舒元舆有个同族侄子名叫舒守谦，忠厚而聪敏，舒元舆很喜欢他，让他跟随自己长达十年。有一天，舒元舆毫无缘由地对他发怒，每天都加以斥责，连家中的奴婢也都轻视他。舒守谦感到惶恐不安，请求返回江南老家，舒元舆也不挽留，舒守谦只好悲伤叹息着离去。当天傍晚，舒守谦走到昭应县时，听说舒元舆全家被诛灭，唯独他得以幸免。
这一天，朝廷任命令狐楚为盐铁转运使，左散骑常侍张仲方暂时代理京兆尹。当时，几天之内，诛杀、任免官员，全都由左、右神策军中尉决定，文宗根本无从干预。
起初，王守澄憎恶宦官田全操、刘行深、周元稹、薛士干、似先义逸、刘英誗等人，李训、郑注便趁机建议文宗，派遣他们分别前往盐州、灵武、泾原、夏州、振武、凤翔巡视边境，又命令翰林学士顾师邕起草诏书，赐给这六个藩镇，让他们就地诛杀田全操等人。恰逢李训事败，六个藩镇收到诏书后，都搁置起来，没有执行。
丙寅日，朝廷认定顾师邕伪造诏书，将他关进御史台监狱。
在此之前，郑注率领五百名亲兵，已经从凤翔出发，走到扶风县。扶风县令韩辽知道他的密谋，不肯为他提供食宿和车马，带着县衙的官印和官吏、士兵逃往武功县。郑注得知李训已经事败，便又返回凤翔。
仇士良等人派人携带密诏，授予凤翔监军张仲清，命令他诛杀郑注。张仲清惶恐不安，不知该怎么办。押牙李叔和劝张仲清说：“我替您用友好的名义召见郑注，将他的亲兵挡在门外，在座位上就可以将他拿下，事情立刻就能办成！” 张仲清听从了他的建议，埋伏下甲兵，等待郑注前来。郑注倚仗自己有亲兵护卫，便前往拜见张仲清。李叔和把郑注的亲兵引到外面，设宴款待他们，郑注只带了几个人进入营帐。众人刚刚喝完茶，李叔和便抽出刀来斩杀了郑注，随即关闭营门，将郑注的亲兵全部诛杀。接着，张仲清拿出密诏，向将士们宣告，于是诛灭了郑注全家，还斩杀了节度副使钱可复、节度判官卢简能、观察判官萧杰、掌书记卢弘茂等人及其党羽，总共杀死了一千多人。钱可复是钱徽的儿子；卢简能是卢纶的儿子；萧杰是萧俛的弟弟。
朝廷还不知道郑注已经被杀，丁卯日，文宗下诏，削夺郑注的官爵，命令相邻的藩镇按兵不动，观察凤翔的局势变化。又任命左神策大将军陈君奕为凤翔节度使。
戊辰日夜晚，张仲清派遣李叔和等人带着郑注的首级前往京城进献，将首级悬挂在兴安门示众，人心这才稍微安定下来，京城的各路禁军也开始各自返回军营。
文宗下诏，对讨伐叛贼有功的将士以及整顿军队秩序的官员，分别授予不同的官爵和赏赐。右神策军在崇义坊擒获韩约，己巳日，将他斩杀。仇士良等人各自被晋升官阶，调任要职。
从此以后，天下的政事都由宦官掌控的北司决断，宰相不过是奉命行文而已。宦官的气焰更加嚣张，胁迫天子，轻视宰相，欺凌侮辱朝廷官员如同草芥一般。每当在延英殿商议政事时，仇士良等人动不动就援引李训、郑注的事例来驳斥宰相。郑覃、李石反驳说：“李训、郑注确实是叛乱的祸首，但不知道李训、郑注最初是靠谁的引荐才得到任用的？” 宦官们的气焰这才稍稍收敛，士大夫们都依赖郑覃、李石得以自保。
当时，中书省只剩下空旷的院墙和破败的房屋，各种物品都匮乏短缺。江西、湖南两道献上一百二十份衣服和粮食，用来供给宰相招募随从人员。辛未日，李石上奏说：“宰相如果忠诚正直，没有私心，就会得到神灵的庇佑，即使遇到盗贼，也不会受到伤害。如果心怀奸邪，图谋不轨，即使有重兵护卫，也会被鬼神诛杀。臣愿意竭尽忠心报效国家，只需要遵循旧例，让金吾卫的士兵作为仪仗和随从就足够了。江西、湖南两道所献上的衣服和粮食，请求全部停止供应。” 文宗批准了他的请求。
十二月壬申朔日，顾师邕被流放到儋州，走到商山时，文宗下诏赐他自尽。
榷茶使令狐楚上奏，请求废除茶叶专卖制度，文宗批准了。
度支上奏，登记郑注的家产，共查获绢帛一百多万匹，其他财物的价值也与此相当。
庚辰日，文宗问宰相：“街坊集市已经安定了吗？” 李石回答说：“渐渐安定了。然而近来天气异常寒冷，大概是因为诛杀的人太多了。” 郑覃说：“罪犯的直系亲属之前都已经被处死，剩下的人大概不值得再追究了。” 当时，宦官们对李训等人恨之入骨，凡是和李训等人有丝毫牵连，或者曾经暂时受到他们举荐提拔的人，都不断遭到诛杀贬谪，所以两位宰相才向文宗进言。
李训、郑注被杀之后，文宗下诏召回前往六道巡视边境的宦官。田全操对李训、郑注的密谋怀恨在心，在路上扬言说：“