羌人叛乱：
当初，烧当羌部落首领滇良击败先零羌，夺取了先零羌的领地。滇良去世后，他的儿子滇吾继位，部落逐渐强盛。
秋季： 滇吾同弟弟滇岸率领部众侵犯陇西郡，在允街击败太守刘盱。于是守卫边塞的羌人部落全部叛变。
明帝下诏命谒者张鸿统领各郡军队征讨，在允吾交战，张鸿兵败阵亡。
冬季，十一月： 明帝又派中郎将窦固监督捕虏将军马武等两位将军，率领四万军队讨伐羌人。
南单于更替： 本年，南单于莫去世，他的弟弟汗继位，为伊伐于虑鞮单于。
汉明帝永平元年（戊午年，公元58年）
春季，正月： 明帝率领公卿及以下官员在原陵朝拜，如同元旦朝会的仪式。明帝在光武帝牌位前叩拜，退下后，坐东厢。侍卫官都在牌位后面，太官献上食物，太常奏乐。各郡国上计吏依次上前，在神座前报告各自郡国的粮价和民间疾苦。从此以后，这项仪式成为常例。
夏季，五月： 高密元侯邓禹去世。
东海王刘强去世：
东海恭王刘强病重，明帝派使者、太医乘驿车前往诊治，络绎不绝。下诏命沛王刘辅、济南王刘康、淮阳王刘延前往鲁国探视病情。
戊寅日： 刘强去世。临终前，他上书谢恩：“臣短命早死，让孤儿弱子又要为皇太后、陛下忧虑，实在悲伤惭愧！儿子刘政，是个小人，勉强继承臣的爵位，恐怕不是保全他的办法。臣愿归还东海郡。如今天下刚遭大丧（指光武帝去世），只愿陛下加意奉养皇太后，多进御餐。臣命在旦夕，言不能尽意，请一并向诸王辞谢，想不到永不能再相见了！”明帝看到遗书非常悲痛，随太后出宫到津门亭为刘强举哀，命大司空持符节主持治丧，给予特殊礼遇的赏赐，诏令楚王刘英、赵王刘栩、北海王刘兴以及在京城的亲戚们都去参加葬礼。明帝追念刘强坚持谦恭节俭，不愿违背他的意愿实行厚葬，于是特地下诏：“陪葬物品，务必从简节约，衣服足够包住身体即可，丧车用茅草编织，器物用陶瓦制作，数量少于常规，以彰明东海王卓尔不群的志向。”命将作大匠留在东海国兴建陵墓宗庙。
秋季，七月： 马武等攻击烧当羌，大败羌军，其余羌人投降或溃散。
山阳王刘荆被贬： 山阳王刘荆私下请来星象术士，与他们商议，希望天下发生变故。明帝听说后，改封刘荆为广陵王，命他前往封国。
祭肜威震塞外： 辽东太守祭肜派偏何讨伐赤山乌桓，大败乌桓军，斩杀其首领。塞外异族震惊恐惧，西起武威，东到玄菟，各族都来归附汉朝。边疆不再有烽烟战尘，于是东汉朝廷将屯驻边境的军队全部撤走。
议定礼乐： 东平王刘苍认为中兴大业已三十多年，四方安宁，应当制定礼乐制度。于是与公卿大臣共同议定南北郊祭天地时的冠冕、车马、服饰制度，以及光武帝庙的登堂歌辞、八佾舞的人数，上报明帝。
耿弇去世： 好畤愍侯耿弇去世。
汉明帝永平二年（己未年，公元59年）
春季，正月，辛未日： 在明堂祭祀光武帝。明帝和公卿、列侯，初次头戴冠冕、身佩玉佩参加仪式。仪式结束后，登上灵台，观测天象。大赦天下。
三月： 明帝亲临辟雍，初次举行大射礼。
冬季，十月，壬子日： 明帝亲临辟雍，初次举行养老礼。任命李躬为三老，桓荣为五更。三老身穿麻布大袍，头戴进贤冠，手扶玉杖。五更的装束相同，但不持杖。明帝乘舆到辟雍礼殿，坐在东厢，派使者用安车迎接三老、五更到太学讲堂。明帝在门屏处迎接，互相行礼。然后明帝从东阶引路，三老从西阶上堂。到达阶前，明帝依礼作揖。三老登堂，面东站立，三公摆设几案，九卿扶正鞋履。明帝亲自卷袖切割祭肉，捧上酱汁请三老食用，手执酒爵向三老敬酒。祝哽官（防噎）在前，祝噎官（防呛）在后。五更面南站立，由三公进奉酒食，礼节与敬奉三老相同。仪式结束后，引导桓荣和他的学生登堂，明帝亲自讲论经书，儒生们手执经书在明帝面前询问疑难，环绕在辟雍门外桥头观看听讲的官吏百姓，不计其数。于是明帝下诏赐封桓荣为关内侯；三老、五更都终身享受二千石俸禄的待遇。赏赐全国的三老，每人一石酒，四十斤肉。
（附：明帝尊师：明帝当太子时，曾向桓荣学习《尚书》。即帝位后，仍以师礼尊奉桓荣。他曾亲临太常府，命桓荣坐在东面，设置几案、手