甲寅日，太宗问侍从大臣：“帝王创业和守成哪个更难？”房玄龄说：“天下混乱之初，与各路群雄并起争夺天下，然后使他们臣服，创业艰难啊。”魏征说：“自古以来的帝王，没有不是在艰难中取得天下，在安逸中失去天下的，守成艰难啊。”太宗说：“玄龄和我一起夺取天下，出生入死，九死一生，所以知道创业的艰难。魏征和我一起安定天下，常常担心在富贵中滋生骄奢，在疏忽中引发祸乱，所以知道守成的艰难。但创业的艰难，已经过去了；守成的艰难，正应当和各位谨慎对待。”房玄龄等人跪拜说：“陛下能说这番话，是天下的福气啊。”
起初，突厥颉利可汗灭亡后，北方地区空虚，薛延陀真珠可汗率领部落在都尉犍山以北、独逻水以南建立王庭，拥有二十万精兵，立他的两个儿子拔酌、颉利苾分别主管南、北部。太宗因薛延陀强盛，担心日后难以控制，癸亥日，册封他的两个儿子都为小可汗，各赐鼓和大旗，表面上表示优待尊崇，实际上是分割他们的势力。
冬季十月乙亥日，巴州獠人反叛。
己卯日，太宗在始平打猎；乙未日，返回京城。
钧州獠人反叛；派遣桂州都督张宝德讨伐平定叛乱。十一月丁未日，开始在玄武门设置左、右屯营飞骑，由各位将军统领。又挑选飞骑中财力雄厚、骁勇健壮、擅长骑马射箭的人，号称百骑，身穿五色袍，乘坐骏马，用虎皮做马鞍垫，凡是太宗出游就跟随左右。
己巳日，明州獠人反叛；派遣交州都督李道彦讨伐平定叛乱。
十二月辛巳日，左武候将军上官怀仁在壁州攻打反叛的獠人，大败他们，俘获男女一万多人。
这一年，任命给事中马周为中书舍人。马周机智善辩，中书侍郎岑文本常常称赞：“马君议论事情，引用事例，品评古今，抓住要点、删除繁杂，文辞贴切、道理透彻，一字不能增，也不能减，听他说话娓娓动听，让人忘记疲倦。”
霍王元轨喜爱读书，恭敬谨慎、坚守本分，言行举止不鲁莽。担任徐州刺史时，与处士刘玄平结为平民之交。有人问刘玄平霍王的长处，刘玄平说：“没有长处。”提问的人感到奇怪。刘玄平说：“人有短处才能显现出长处，至于霍王，没有短处，我怎么能称赞他的长处呢！”
起初，西突厥咥利失可汗把他的国家分为十部，每部有一位酋长，还各赐一支箭，称为十箭。又分为左、右两厢，左厢号称五咄陆，设置五大啜，居住在碎叶以东；右厢号称五弩失毕，设置五大俟斤，居住在碎叶以西；统称十姓。咥利失失去民心，被他的大臣统吐屯袭击。咥利失兵败，与他的弟弟步利设逃到焉耆自保。统吐屯等人准备拥立欲谷设为大可汗，恰逢统吐屯被人杀死，欲谷设的军队也战败，咥利失重新收复了原来的土地。到这时，西部最终拥立欲谷设为乙毗咄陆可汗。乙毗咄陆即位后，与咥利失展开大战，伤亡惨重。于是两国平分西突厥的土地，自伊列水以西归乙毗咄陆，以东归咥利失。
处月、处密部落与高昌一起攻占焉耆的五座城池，劫掠男女一千五百人，烧毁他们的房屋后离去。
贞观十三年（己亥，公元639年）
春季正月乙巳日，太宗车驾前往献陵祭拜；丁未日，返回宫中。
戊午日，加封左仆射房玄龄为太子少师。房玄龄自认为担任宰相十五年，儿子房遗爱娶了太宗的女儿高阳公主，女儿是韩王妃，深知功高震主的危险，上表请求解除机要职务；太宗没有同意。房玄龄坚持请求不止，太宗下诏拒绝他的上表，他才就职。太子想拜见房玄龄，设置仪仗侍卫等待他，房玄龄不敢入宫拜见，返回府邸，当时的人称赞他谦逊有礼。房玄龄认为度支部门关系到天下的利害，曾经有空缺，寻找合适的人选没有找到，于是自己兼任度支尚书。
礼部尚书永宁懿公王珪去世。王珪性情宽厚，生活十分节俭。如今，三品以上官员都建立家庙，王珪显贵已久，却只在寝室祭祀祖先。被司法部门弹劾，太宗没有追究，命令有关部门为他建立家庙，以此让他羞愧。
二月庚辰日，任命光禄大夫尉迟敬德为鄜州都督。
太宗曾经对尉迟敬德说：“有人说你谋反，为什么呢？”尉迟敬德回答说：“我谋反是事实！我跟随陛下征战四方，身经百战，如今能活下来，都是从刀箭下逃出来的。天下已经平定，却反而怀疑我谋反吗！”于是解开衣服扔在地上，露出身上的伤疤。太宗为他流下眼泪，说：“你穿上衣服，我不怀疑你，所以才告诉你，你又何必怨恨呢！”
太宗又曾经对尉迟敬德说：“我想把女儿嫁给你，怎么样？”尉迟敬德叩头谢罪说：“我的妻子虽然粗陋，但我们一起经历贫贱很久了。我虽然没有学问，但听说古人富贵了不换妻子，这不是我所希望的。”太宗于是作罢。
戊戌日，尚书省上奏：“近代挑选后宫嫔妃，有的出自微贱家族，不懂礼仪教化；有的来自受过刑罚的家庭，心怀积怨。请求从今往后，后宫及东宫的职位有空缺，都挑选出身良家、有才能德行