壬子日，刘秀任命太中大夫宋弘为大司空。宋弘推荐桓谭做议郎、给事中。刘秀让桓谭弹琴，喜欢他弹的华丽曲调。宋弘知道后很不高兴，等桓谭从宫里出来，他穿着朝服坐在府中，派人把桓谭叫来。桓谭到后，宋弘不给他座位，责备说：“你是能自己改正，还是要我依法检举你？”桓谭叩头谢罪，过了很久才被放走。后来刘秀大会群臣，让桓谭弹琴，桓谭看到宋弘，紧张得弹走了调。刘秀奇怪地问，宋弘离席脱帽谢罪说：“我推荐桓谭，是希望他用忠正引导陛下，如今他让朝廷沉迷靡靡之音，是我的错。”刘秀听了也严肃地向他道歉。
湖阳公主守寡，刘秀和她一起谈论朝臣，暗中观察她的心意。公主说：“宋公威严庄重，品德高尚，群臣没人比得上。”刘秀说：“我来想想办法。”后来宋弘被召见，刘秀让公主坐在屏风后，对宋弘说：“俗话说‘显贵了就换朋友，富有了就换妻子’，这是人之常情吗？”宋弘说：“我只听说贫贱时的朋友不能忘，共患难的妻子不能抛弃。”刘秀回头对公主说：“这事办不成了！”
刘秀讨伐王郎时，彭宠派精锐骑兵助战，运送粮食从没断过。刘秀追击铜马军到蓟城时，彭宠自恃有功，期望值很高，但刘秀对他的礼遇没达到他的预期，他心里不满。刘秀即位后，彭宠派去的吴汉、王梁都做了三公，唯独他没得到加封，越发失意，抱怨说：“我本该封王的，现在这样，陛下是忘了我吗？”当时北方各州残破，只有渔阳还算完好，又有旧铁官，彭宠靠贸易粮食，积累了大量珍宝，越来越富。
幽州牧朱浮年轻有才，想整顿风气、收买人心，征召州中名人和王莽时期的二千石旧吏，安置在幕府，还调用各郡粮仓的粮食供养他们的家属。彭宠认为天下未定，战事正紧，不该多设官属浪费物资，不听他的命令。朱浮傲慢急躁，彭宠又固执强硬，两人的矛盾越来越深。朱浮多次诬陷彭宠，密奏说他囤积兵粮，野心不小。刘秀却故意把这话泄露给彭宠，想吓唬他。
这时刘秀下诏征召彭宠，彭宠上疏请求和朱浮一起进京，刘秀不同意，彭宠更加怀疑。他妻子性格刚强，受不了委屈，坚决劝他不要接受征召，说：“天下未定，各地都有豪强称雄。渔阳是大郡，兵马最强，为什么要因为被人告发就放弃这里？”彭宠和亲信们商量，大家都怨恨朱浮，没人劝他进京。刘秀派彭宠的侄子子后兰卿去劝说，彭宠却把子后兰卿扣下，起兵反叛，任命将帅，亲自率两万多人攻打朱浮所在的蓟城。他又觉得自己和耿况都立过大功，却都没得到厚赏，多次派使者拉拢耿况，耿况不答应，还杀了使者。
延岑再次反叛，率军包围南郑。汉中王刘嘉被打得大败，只好逃走。延岑趁机占据汉中，又向武都进军，却被更始帝的柱功侯李宝击败，无奈逃到天水。公孙述派部将侯丹夺取南郑。刘嘉收拢逃散的士兵，又聚集起几万人，任命李宝为丞相，从武都向南攻打侯丹，结果出师不利，只好退到河池、下辨，之后又与延岑多次交战。延岑战败向北撤退，进入散关，抵达陈仓；刘嘉紧追不舍，终于将其击败。公孙述又派将军任满从阆中出兵，直取江州，向东占据扞关，至此，公孙述完全占据了益州全境。
辛卯日，刘秀返回洛阳。
三月乙未日，刘秀宣布大赦天下。
当时，更始帝手下还有许多大将在南方尚未归降。刘秀召集众将领商议军事，他用檄文敲击地面说：“郾城的敌人最为强大，宛城次之，谁愿意去攻打？”贾复毫不犹豫地回答：“我请求去攻打郾城。”刘秀笑着说：“有执金吾去攻打郾城，我还有什么可担忧的！大司马吴汉就去攻打宛城吧。”于是，刘秀派贾复进攻郾城，成功将其攻破，守将尹尊投降。接着，贾复又向东攻打更始帝的淮阳太守暴汜，暴汜也归降了。
这年夏天四月，虎牙大将军盖延率领驸马都尉马武等四位将军，向刘永发起进攻并大获全胜，随后将刘永围困在睢阳。原更始帝的将领苏茂反叛，杀掉淮阳太守潘蹇，占据广乐后，向刘永称臣。刘永任命苏茂为大司马、淮阳王。
吴汉攻打宛城，宛王刘赐带着更始帝的妻子儿女前往洛阳投降，刘秀封刘赐为慎侯。刘秀的叔父刘良、族父刘歙、族兄刘祉也都从长安赶来。甲午日，刘秀封刘良为广阳王，刘祉为城阳王；又封哥哥刘演的儿子刘章为太原王，刘兴为鲁王；更始帝的三个儿子刘求、刘歆、刘鲤都被封为列侯。
邓王王常前来归降，刘秀见到他十分高兴，说：“我见到王廷尉，就不用担心南方的局势了！”于是任命王常为左曹，封山桑侯。
五月庚辰日，刘秀封族父刘歙为泗水王。
刘秀认为阴贵人向来性情宽厚仁慈，想立她为皇后。但阴贵人觉得郭贵人已经有了儿子，始终不肯接受。六月戊戌日，刘秀立郭贵人为皇后，立她的儿子刘强为皇太子，同时大赦天下。
丙午日，刘秀封泗水王刘歙的儿子刘终为淄川王。
秋天，贾复向南攻打召陵、新息，将这两地平定。