康熙初年，施琅升任福建水师提督，终于回到了熟悉的水师统帅岗位。他向朝廷上书，建议整顿沿海防务，“以战养战”，通过剿灭海盗来锻炼水师，同时积累对抗郑氏的经验。朝廷批准后，他亲自率领舰队，清剿了盘踞在厦门、金门附近的几股海盗，缴获了大量船只、兵器，水师的实力也一步步壮大。
这期间，王氏因病去世，施琅悲痛了很久。后来经人介绍，娶了第二位妻子黄氏。黄氏性子泼辣，却很支持他的事业，常说：“男人就该在战场上建功立业，家里有我撑着。”黄氏为他生下了施世纶、施世骠等几个儿子。施琅虽忙，却总抽时间教儿子们游泳、识船，把自己画的海图给他们看，讲海战的故事。施世骠最像他，小小年纪就爱摆弄船模，说将来要像父亲一样“驾大船，打胜仗”。
四、平台之议：朝堂上的坚持
康熙二十年，三藩之乱平定，朝廷终于有精力顾及台湾。当时台湾由郑成功之孙郑克塽统治，虽称臣纳贡，却始终保持着割据状态。康熙帝召集群臣商议对策，多数人主张“迁界禁海”，断绝台湾与大陆的联系，让其不攻自破；少数人支持用兵，却对海战心里没底。
施琅此时已被调往京师担任内大臣，得知消息后，立刻上书《平海策》，力主出兵收复台湾。他在奏折里写道：“台湾本是中国故土，若弃之不顾，必为外夷所趁。臣熟谙海道，愿领兵出征，荡平岛寇，还我疆土。”奏折递上去，反对声四起——有人说他“好大喜功”，有人担心他“与郑氏旧部勾结”，甚至有人翻出他当年投奔清军的旧事，说他“反复无常，不可信任”。
施琅没有退缩。他在朝堂上与反对者辩论，详细分析台湾的地理、郑氏的兵力部署，甚至算出了最佳的出兵季节和航线。他对康熙帝说：“臣若不能平台，愿受军法处置。”康熙帝看着这位头发已有些花白的老将，想起他多年来的沉稳表现，又翻看了他的海图和策论，最终拍板：“就依施琅所奏，命他为福建水师提督，全权负责平台事宜。”
消息传到福建，施琅立刻着手备战。他亲自去船厂督造战船，要求工匠们“用料必实，做工必精”，每艘船下水前，他都要亲自登船测试，有一点瑕疵就返工。他还派人潜入台湾，打探军情、绘制更详细的地图，连郑军将领的性格、喜好都摸得一清二楚。
出征前，施琅回了趟晋江老家。站在父母的坟前，他斟了三杯酒，轻声说：“爹，娘，儿子要去收复台湾了。将来海疆太平，渔民们能安稳打鱼，您们在天之灵也能安心了。”黄氏带着儿子们来送行，施世骠已经长成少年，拉着父亲的手说：“爹，我也想跟你去！”施琅摸摸他的头：“你还小，在家好好读书，等爹打了胜仗回来，给你讲海上的故事。”
五、澎湖决战：浪涛中的决胜时刻
康熙二十二年六月，施琅率领水师三万余人、战船三百余艘，从铜山（今福建东山）出发，直扑澎湖——这里是台湾的门户，郑军主帅刘国轩在此布下重兵，号称“万无一失”。
初战并不顺利。郑军战船虽少，却熟悉海域，利用澎湖的礁盘和浅滩设伏。施琅的先锋船队贸然深入，被郑军包围，损失了几艘战船。部下建议暂时撤退，施琅却摇摇头：“越是艰难，越要坚持。”他登上旗舰“威远号”，亲自指挥，调整战术——不再一味猛冲，而是以“五船结阵”，互相掩护，稳扎稳打。
战斗最激烈的时候，一枚炮弹落在“威远号”附近，掀起的巨浪打湿了施琅的战袍。他站在船头，手里的令旗挥舞得更急，大声下令：“左舷炮对准敌舰主桅，右舷船掩护！”将士们见主帅如此镇定，士气大振，纷纷奋勇向前。
施琅知道，澎湖之战的关键在“天时”。他观察了几日，发现夏季的澎湖午后常起南风，而郑军的战船多在北岸，若南风起时发起猛攻，顺风顺水，必能占据优势。于是他故意示弱，让船队在海面游弋，引诱刘国轩放松警惕。
六月十六日午后，南风果然如期而至。施琅立刻下令总攻，三百艘战船借着风势，如离弦之箭般冲向郑军阵地。郑军猝不及防，战船被冲得七零八落。施琅亲自擂鼓助威，鼓声、炮声、喊杀声震彻海面。激战中，他的右眼被流矢擦伤，鲜血直流，他只是用布一擦，继续指挥：“别管我，杀贼！”
这场仗打了整整一天，直到夕阳西下，海面上漂浮着断裂的船板、散落的兵器，郑军的旗帜一个个倒下。刘国轩见大势已去，带着残部仓皇逃往台湾，澎湖诸岛尽数被清军收复。打扫战场时，施琅站在甲板上，望着远处的台湾岛，喃喃道：“成功了一半。”
六、收复台湾：从战到和的智慧
澎湖大捷后，台湾震动。郑克塽召集部下商议，有人主张抵抗，有人建议投降。施琅没