昭宗圣穆景文孝皇帝下之上天复三年（癸亥，公元九零三年）
二月壬申日初一，昭宗颁布诏书：“此前在凤翔府所任命的官员，全部罢免。” 当时宦官已经被全部诛杀，只有河东监军张承业、幽州监军张居翰、清海监军程匡柔、西川监军鱼全禋以及已经退休的严遵美，被李克用、刘仁恭、杨行密、王建藏匿起来，得以保全性命，他们都斩杀了其他囚犯来应付诏书的要求。
甲戌日，门下侍郎、同平章事陆扆被贬为沂王傅、分司东都。昭宗的车驾返回京城，赐给各路藩镇诏书，唯独没有给凤翔的李茂贞。陆扆说：“李茂贞的罪过虽然很大，但朝廷还没有和他断绝关系，如今唯独不给他诏书，显得朝廷气量不够大。” 崔胤大怒，上奏将陆扆贬官。宫人宋柔等十一人都是韩全诲进献的，还有和宦官关系亲近的僧人、道士等二十多人，全部被押送到京兆府，用杖刑处死。
昭宗对韩偓说：“崔胤虽然竭尽忠心，但比起你，他更喜欢用权术谋略。” 韩偓回答说：“凡是统治天下的君主，天下万国都在注视着他，怎么能用权术谋略欺骗天下人呢！不如推心置腹、真诚待人，这样虽然每天算计着好像有所不足，但以一年来计算，却是绰绰有余的。”
丙子日，工部侍郎、同平章事苏检，吏部侍郎卢光启，都被赐令自尽。丁丑日，昭宗将中书侍郎、同平章事王溥贬为太子宾客、分司东都，这些人都是崔胤所厌恶的。戊寅日，昭宗赐给朱全忠 “回天再造竭忠守正功臣” 的称号，赐给他的僚佐敬翔等人 “迎銮协赞功臣” 的称号，赐给各位将领朱友宁等人 “迎銮果毅功臣” 的称号，赐给都头以下的军官 “四镇静难功臣” 的称号。昭宗和大臣们商议褒奖尊崇朱全忠，想要任命皇子为诸道兵马元帅，任命朱全忠为副元帅。崔胤请求任命辉王李祚为元帅，昭宗说：“濮王年纪更大。” 崔胤秉承朱全忠的密旨，贪图李祚年幼容易控制，坚决请求任命李祚。己卯日，昭宗任命李祚为诸道兵马元帅。庚辰日，加封朱全忠为守太尉，充任副元帅，晋升爵位为梁王。任命崔胤为司徒兼侍中。崔胤依仗朱全忠的势力，独揽朝政、肆意妄为，昭宗的一举一动都要向他禀报。跟随昭宗前往凤翔的朝廷大臣，共有三十多人被降职放逐。刑罚和奖赏都取决于崔胤的爱憎，朝廷内外的人都畏惧他，吓得不敢迈步。朝廷任命敬翔为太府卿，任命朱友宁兼任宁远节度使。朱全忠上表举荐苻道昭为同平章事，充任天雄节度使，派遣军队护送他前往秦州，结果没能到达就返回了。
起初，翰林学士承旨韩偓考中进士的时候，是由御史大夫赵崇担任主考官。昭宗从凤翔返回京城之后，想要任命韩偓为宰相，韩偓举荐赵崇以及兵部侍郎王赞来代替自己。昭宗想要听从他的建议，崔胤厌恶他们会分走自己的权力，让朱全忠入宫争辩反对。朱全忠拜见昭宗说：“赵崇是轻浮浅薄之人的首领，王赞没有才能可用，韩偓怎么能胡乱举荐他们担任宰相呢！” 昭宗看到朱全忠怒气冲冲，迫不得已，癸未日，将韩偓贬为濮州司马。昭宗秘密地和韩偓流泪告别，韩偓说：“朱温这个人已经不是以前可以相比的了，臣能够被贬到远方，直到死去，都是幸运的，实在不忍心看到他篡夺皇位、弑杀君主的耻辱啊！”
己丑日，昭宗命令朱全忠写信给李茂贞，要回平原公主。李茂贞不敢违抗，急忙把平原公主送回京城。
壬辰日，朝廷任命朱友裕为镇国节度使。
乙未日，朱全忠上奏请求留下步兵、骑兵一万人，分别隶属于原来的左、右神策两军，任命朱友伦为左军宿卫都指挥使，又任命汴州将领张廷范为宫苑使，王殷为皇城使，蒋玄晖担任街使。从此朱全忠的党羽遍布皇宫的禁卫部队以及京城的各个要害部门。戊戌日，朱全忠告辞返回藩镇，昭宗在寿春殿设宴挽留他，又在延喜楼为他饯行。昭宗亲自来到楼前的长廊上，流泪送别，命令朱全忠在楼前上马出发。昭宗又赐给朱全忠一首诗，朱全忠也作诗唱和进献给昭宗；昭宗还赐给他《杨柳枝辞》五首。文武百官在长乐驿列队为朱全忠饯行。只有崔胤一个人一直送到霸桥，还亲自置办了饯行的宴席，直到夜里二更时分，崔胤才返回城中。昭宗又召见崔胤奏对，询问朱全忠是否平安，摆上酒宴，奏起音乐，直到四更时分才结束。
朝廷任命清海节度使裴枢为门下侍郎、同平章事，这是朱全忠举荐的。
李克用的使者返回晋阳，禀报崔胤专横跋扈的情况，李克用说：“崔胤作为臣子，在外欺凌君主，既执掌朝政大权，又手握兵权。权力过重到这种地步，破败家族、灭亡国家的灾祸，就在眼前了。” 朱全忠即将出发返回藩镇的时候，上奏说：“李克用和臣之间，本来没有大的仇怨，恳请陛下优厚地施加恩宠和恩泽给他，派遣大臣前去安抚慰问，让他知道臣的心意。” 送奏章的官吏把这件事禀报给李克用，李克用笑着说：“朱温这个贼子想要攻打淄青，是害怕我在背后牵制他罢了！”
三月戊午日，朱全忠回到大梁。王师