杜牧还为《孙子兵法》作注，并撰写了序言，认为：“军队，是施行刑罚的工具；刑罚，是治理国家政务的手段。身为孔子的门徒，研究军事，实在是子路、冉有那样的人所做的事情。不知道从哪个时代、哪个人开始，将治理国家的方法分成了文、武两道，二者分道扬镳，并行于世。于是，使得士大夫们不敢谈论军事，有的人甚至以谈论军事为耻。如果有谁谈论军事，世人就会认为他是粗鲁莽撞的异类，不愿意与他为伍。唉！治国之道的根本被抛弃，没有比这更严重的了！《礼记》说：‘都城的四郊如果有很多营垒，这是卿大夫的耻辱。’纵观自古以来的历史，一个国家的建立和灭亡，没有哪一次不是由军事决定的。统率军队的人，必须是圣贤、有才能、学识渊博的人，这样才能建立功勋。因此，有关军事的谋略，应该在朝堂之上商议确定，军事行动的形势已经形成之后，再将兵权交给将领。汉高祖刘邦说：‘指挥打猎的人，是人；捕获猎物的人，是狗。’说的正是这个道理。那些担任宰相的人却说：‘军事不是我的职责，我不应该知道。’君子说：‘既然这样，那么你就不应该占据宰相的职位！’”
前任邠宁行军司马郑注，依附宦官王守澄，权势熏天，文宗十分憎恶他。九月，丙寅日，侍御史李款在紫宸殿上奏弹劾郑注，说：“郑注对内勾结宦官，对外结交朝廷官员，在宫廷和外朝之间往来奔走，窥探窃取朝政大权，收受贿赂，聚敛钱财。他白天潜伏不出，夜晚四处活动，人们都敢怒而不敢言，在路上相遇时，只能用眼神示意。请陛下将他交付司法部门治罪。” 在十天的时间里，李款接连上奏了几十道弹劾奏章。王守澄将郑注藏匿在右神策军中。左神策军中尉韦元素、枢密使杨承和、王践言都憎恶郑注。左神策军将领李弘楚劝说韦元素说：“郑注奸诈狡猾，举世无双。如果现在不除掉他，等他羽翼丰满之后，必定会成为国家的祸患。如今，他因为受到御史的弹劾，被藏匿在右神策军中。我请求您以中尉的名义，谎称身患疾病，召郑注前来为您治病。郑注一来，您就请他入座，我在一旁侍奉。等您使个眼色，我就立刻将他擒住，用棍棒打死。然后，您再去面见皇上，叩头请罪，详细陈述郑注的奸邪行径。杨承和、王践言一定会帮助您向皇上进言。更何况您有拥戴皇上登基的功劳，难道会因为铲除奸邪而获罪吗！” 韦元素认为李弘楚说得有道理，便派人去召郑注。郑注来到后，对韦元素点头哈腰，卑躬屈膝，阿谀奉承的言辞像泉水一样源源不断地从他口中涌出。韦元素不知不觉地握住了他的手，亲切地交谈，听得入了迷，连疲倦都忘记了。李弘楚在一旁多次用眼神示意韦元素动手，韦元素却视而不见。最后，韦元素还赠送了丰厚的金银绸缎给郑注，将他送走了。李弘楚愤怒地说：“中尉您今天失去了诛杀郑注的机会，将来必定难免遭受他的祸害！” 于是，李弘楚辞去了军职，离开了左神策军。不久之后，李弘楚背上毒疮发作，不治身亡。王涯能够担任宰相，郑注出了不少力。王涯又畏惧王守澄的权势，于是便将李款的弹劾奏章压了下来。王守澄在文宗面前为郑注说好话，文宗因此赦免了郑注。不久之后，王守澄又上奏朝廷，任命郑注为侍御史，充任右神策军判官。朝廷内外的官员得知后，都大为震惊，无不扼腕叹息。
甲寅日，朝廷任命前任忠武节度使王智兴为河中节度使。
群臣认为文宗即位已经八年，还没有接受尊号。冬季，十二月，甲午日，群臣为文宗奉上尊号，称太和文武仁圣皇帝。恰逢五坊使薛季棱从同州、华州返回京城，向文宗禀报当地百姓生活困苦。文宗叹息说：“关中地区今年收成还算不错，百姓的生活尚且如此艰难，更何况江淮地区近年来接连遭受大水灾，那里的百姓生活又会是怎样的呢！我没有办法拯救他们，哪里还敢接受这样空虚的尊号呢！” 于是，文宗赏赐给薛季棱一条通天带。群臣前后四次上表请求文宗接受尊号，文宗最终还是没有接受。
庚子日，文宗突然中风，不能说话。在这种情况下，王守澄举荐昭义行军司马郑注，说他擅长医术。文宗下诏征召郑注前往京城。郑注为文宗诊治疾病，服用了他开的药后，文宗的病