起初，杨国忠憎恶宪部尚书苗晋卿，安禄山反叛后，杨国忠请求将苗晋卿外放为陕郡太守，兼陕、弘农防御使。苗晋卿以年老多病为由坚决推辞，上皇不高兴，让他退休。等到长安失守，苗晋卿暗中逃入山谷；肃宗到达凤翔后，亲手书写敕令征召他为左相，军国大事都向他咨询。
上皇思念张九龄的先见之明，为他流下眼泪，派遣中使前往曲江祭祀他，厚加抚恤他的家人。
尹子奇再次率领大军攻打睢阳。张巡对将士们说：“我蒙受国家恩典，坚守此城，只为一死报国罢了。只是想到各位捐躯献身，尸骨暴露在荒野，而奖赏却不能酬谢功劳，因此感到痛心！” 将士们都受到激励，请求奋勇杀敌。张巡于是杀牛，大肆犒劳士卒，率领全部军队出战。叛军看到官军兵力稀少，嘲笑他们。张巡手持战旗，率领各位将领直冲叛军阵中。叛军大败，被斩杀将领三十多人，士兵三千多人，官军追击数十里。第二天，叛军又集合军队到达城下，张巡出战，昼夜交战数十回合，多次挫败叛军的锋芒，但叛军的围攻没有停止。
三月辛未日，安守忠率领两万骑兵侵犯河东，郭子仪击退他们，斩首八千级，俘虏五千人。
夏季四月，颜真卿从荆、襄地区北上前往凤翔，肃宗任命他为宪部尚书。
肃宗任命郭子仪为司空、天下兵马副元帅，让他率领军队赶赴凤翔。四月庚寅日，李归仁率领五千精锐骑兵在三原以北截击郭子仪，郭子仪派他的部将仆固怀恩、王仲升、浑释之、李若幽等人设伏，在白渠留运桥袭击叛军，叛军几乎被全部杀伤，李归仁游泳逃脱。李若幽是李神通的玄孙。
郭子仪与王思礼的军队在西渭桥会合，进军驻扎在潏水西岸。安守忠、李归仁的军队驻扎在京城西的清渠。相互对峙七天，官军没有前进。五月癸丑日，安守忠假装逃跑，郭子仪率领全部军队追击。叛军以九千骁骑布成长蛇阵，官军攻击叛军，叛军首尾分为两翼，夹击官军，官军大败。判官韩液、监军孙知古都被叛军擒获，军资器械全部丢弃。郭子仪退保武功，朝廷内外实行戒严。
当时府库没有积蓄，朝廷专门用官爵奖赏功劳，各位将领出征，都给予空白告身（任命状），从开府、特进、列卿、大将军，下到中郎、郎将，允许他们根据情况填写姓名授予官职。后来又允许用临时凭证授予官爵，甚至有封异姓王的。各路军队只根据职务相互统领，不再计较官爵的高低。等到清渠战败后，又用官爵收拢溃散的士兵。因此官爵变得轻视，财物变得贵重，一通大将军的告身，只能换一顿酒喝。凡是应募参军的人，一律穿着金紫官服，甚至有朝廷官员的僮仆穿着金紫官服，自称大官，却从事低贱的劳役，名位和器物的混乱，到这时达到了极点。
房琯性情高傲简慢，当时国家多难，而房琯常常称病不上朝，不把职务事务放在心上，每天与庶子刘秩、谏议大夫李揖高谈佛教、道教，有时听门客董庭兰弹琴，董庭兰因此大肆谋取权势和利益。御史上奏弹劾董庭兰贪赃受贿，五月丁巳日，罢免房琯为太子少师。任命谏议大夫张镐为中书侍郎、同平章事。肃宗常常让数百名僧人在宫内举行道场，日夜诵读佛经。张镐劝谏说：“帝王应当修养德行来平息战乱、安定百姓，没有听说过供养僧人就能实现天下太平的！” 肃宗认为他说得对。
五月庚申日，上皇追册肃宗的母亲杨妃为元献皇后。
山南东道节度使鲁炅镇守南阳，叛军将领武令珣、田承嗣相继攻打南阳。城中粮食耗尽，一只老鼠价值数百钱，饿死的人相互枕藉。肃宗派遣宦官将军曹日升前往宣慰，南阳城被包围得十分紧急，曹日升无法入城。曹日升请求单人匹马入城传达圣旨，襄阳太守魏仲犀不允许。恰逢颜真卿从河北到达，说：“曹将军不顾万死，前来传达皇帝的命令，为什么要阻止他！即使不能到达，不过损失一名使者；如果能够到达，那么全城军民的信心就会坚定。” 曹日升与十名骑兵一同前往，叛军畏惧他的锐气，不敢逼近。城中军民本来以为没有希望了，等到见到曹日升，大喜过望。曹日升又为他们前往襄阳取得粮食，率领一千人运粮入城，叛军无法阻止。鲁炅在包围中坚守了一年，昼夜苦战，兵力耗尽，无法支撑，五月壬戌日夜间，打开城门，率领残余士兵数千人突围而出，逃往襄阳，田承嗣追击，双方转战两天，田承嗣不能攻克，于是返回。当时叛军想要向南侵犯江、汉地区，依靠鲁炅扼守交通要道，南方地区才得以保全。
司空郭子仪前往朝廷请求自我贬官；五月甲子日，肃宗任命郭子仪为左仆射。
尹子奇增派兵力，围攻睢阳更加紧急，张巡在城中夜间击鼓，整顿军队，好像将要出击的样子；叛军听到后，整夜戒备。天亮后，张巡却让士兵休息，停止击鼓。叛军用飞楼眺望城中，什么也没有看到，于是脱下铠甲休息。张巡与将军南霁云、郎将雷万春等十多名将领，各自率领五十名骑兵，打开城门，突然冲出，直冲叛军营地，到达尹子奇的指挥旗下，叛军营地大