许敬宗又上奏说：“长孙无忌谋反，是由褚遂良、柳奭、韩瑗煽动勾结而成；柳奭还暗中与宫中勾结，图谋用毒酒害人，于志宁也依附长孙无忌。” 于是高宗下诏追削褚遂良的官爵，削除柳奭、韩瑗的官名，免去于志宁的官职。派遣使者征发沿途的兵力护送长孙无忌前往黔州。长孙无忌的儿子秘书监驸马都尉长孙冲等人都被削除官籍，流放岭南。褚遂良的儿子褚彦甫、褚彦冲流放爱州，在途中被杀死。益州长史高履行多次被贬，最终被贬为洪州都督。
五月丙申日，兵部尚书任雅相、度支尚书卢承庆一同参知政事。卢承庆是卢思道的孙子。
凉州刺史赵持满，力大无穷，善于射箭，喜好行侠仗义，他的姨母是韩瑗的妻子，他的舅舅驸马都尉长孙铨，是长孙无忌的族弟，长孙铨因长孙无忌的事情获罪，流放巂州。许敬宗担心赵持满发动叛乱，诬告他与长孙无忌一同谋反，通过驿站征召他前往京师长安，将他关进监狱，严刑拷打，但赵持满始终没有屈打成招，说：“我的身体可以被杀死，但供词不能更改！” 官吏无可奈何，于是代替他写了供词，结案上奏。戊戌日，赵持满被处死，尸体被陈列在城西，亲戚们都不敢去看。他的朋友王方翼叹息说：“栾布哭祭彭越，是义举；周文王埋葬枯骨，是仁行。在下不失义，在上不失仁，不也是可以的吗！” 于是收敛赵持满的尸体并安葬了他。高宗听说后，没有治王方翼的罪。王方翼是前王皇后的从祖兄。长孙铨抵达流放之地后，县令迎合旨意，将他杖打致死。
六月丁卯日，高宗下诏将《氏族志》改为《姓氏录》。
起初，太宗命令高士廉等人修撰《氏族志》，对士族的升降取舍，当时被认为是恰当的。到这时，许敬宗等人认为该书没有记载武氏的家族世系，上奏请求修改，高宗于是命令礼部郎中礼志约等人按照等级高低重新分类编排，将皇后的家族列为第一等，其余的全部按照在唐朝担任官职的品级高低为标准，共分为九等。于是士兵凭借军功获得五品官职的，也被列入士族，当时的人称之为 “勋格”。
许敬宗商议封禅的礼仪，己巳日，上奏说：“请求将高祖、太宗一同配祀昊天上帝，太穆皇后、文德皇后一同配祀皇地只。” 高宗批准了这一请求。
秋季七月，高宗命令御史前往高州追捕长孙恩，前往象州追捕柳奭，前往振州追捕韩瑗，将他们戴上枷锁押送到京师长安，同时命令州县登记他们的家产。长孙恩是长孙无忌的族弟。
壬寅日，高宗命令李积、许敬宗、辛茂将与任雅相、卢承庆一同重新审理长孙无忌的案件。许敬宗又派遣中书舍人袁公瑜等人前往黔州，再次审讯长孙无忌的谋反罪状，抵达黔州后，就逼迫长孙无忌自缢身亡。高宗下诏命令柳奭、韩瑗在押解途中遇到的地方就地处决。使者在象州杀死了柳奭。韩瑗已经去世，使者打开棺材验明正身后返回。朝廷查抄了长孙无忌、柳奭、韩瑗三家的家产，他们的近亲都被流放到岭南为奴婢。常州刺史长孙祥因与长孙无忌通信而获罪，被处以绞刑。长孙恩被流放到檀州。
八月壬子日，任命普州刺史李义府兼任吏部尚书、同中书门下三品。李义府显贵后，自称原本出身赵郡李氏，与李氏各房叙论辈分；一些无赖之徒借助他的权势，有很多人拜伏在他面前自称兄叔。给事中李崇德起初与李义府同入族谱，等到李义府被贬为普州刺史，就将他从族谱中删除。李义府听说后心怀怨恨，等到再次担任宰相，就派人诬陷李崇德有罪，将他关进监狱，李崇德自杀身亡。
乙卯日，长孙氏、柳氏因为长孙无忌、柳奭的事情而被贬降的有十三人。高履行被贬为永州刺史。于志宁被贬为荣州刺史，于氏被贬降的有九人。从此朝政大权归于皇后。
九月，高宗下诏在石国、米国、史国、大安国、小安国、曹国、拔汗那国、北拔汗那国、悒怛国、疏勒国、朱驹半国等国设置一百二十七个州县府，全部隶属于