六月，营州都督兼东夷都护程名振、右领军中郎将薛仁贵率军攻打高丽的赤烽镇，攻克该镇，斩首四百多级，俘获一百多人。高丽派遣大将豆方娄率领三万部众抵抗，程名振率领契丹军队迎击，大破高丽军队，斩首二千五百级。
秋季八月甲寅日，播罗哀獠酋长多胡桑等人率领部众归附唐朝。
冬季十月庚申日，吐蕃赞普前来请求通婚。
中书令李义府受到高宗的宠爱，他那些还在襁褓中的儿子都位列清高显贵的官职。而李义府贪得无厌，他的母亲、妻子以及儿子、女婿，都卖官鬻狱，家中门庭若市，结党营私，权势震动朝野。中书令杜正伦常常以资历深厚自居，李义府依仗恩宠，不愿位居其下，因此两人产生矛盾，在高宗面前相互争执。高宗认为大臣之间不和，对两人都加以责备。十一月乙酉日，杜正伦被贬为横州刺史，李义府被贬为普州刺史。杜正伦不久后在横州去世。
阿史那贺鲁被擒获后，对萧嗣业说：“我本是逃亡的俘虏，承蒙先帝收留，先帝对我恩重如山而我却背叛了他，今日的失败，是上天发怒的结果。我听说中原处死犯人必定在闹市，希望能在昭陵之前将我处死，以向先帝谢罪。” 高宗听说后怜悯他。贺鲁被押送到京师长安后，甲午日，高宗将他献给昭陵。高宗敕令免除他的死罪，将他的部落分为六个都督府，他所奴役的各国都设置州府，西至波斯，全部隶属于安西都护府。贺鲁不久后去世，葬在颉利可汗的墓地旁边。
戊戌日，任命许敬宗为中书令，大理卿辛茂将为兼侍中。
开府仪同三司鄂忠武公尉迟敬德去世。尉迟敬德晚年闲居在家，学习延年益寿之术，修饰池塘台榭，演奏清商乐来自娱自乐，不与宾客交往，长达十六年。尉迟敬德享年七十四岁，因病去世，朝廷给予他十分优厚的丧葬礼仪。
这一年，爱州刺史褚遂良去世。
雍州司士许祎与来济关系友好，侍御史张伦与李义府有怨恨，吏部尚书唐临上奏任命许祎为江南道巡察使，张伦为剑南道巡察使。当时李义府虽然被贬在外，但皇后常常保护他，认为唐临是挟私报复，选拔任命不公。
高宗天皇大圣大弘孝皇帝上之下显庆四年（己未，公元 659 年）
春季二月乙丑日，唐临被免去官职。
三月壬午日，西突厥兴昔亡可汗与真珠叶护在双河交战，兴昔亡可汗斩杀真珠叶护。
夏季四月丙辰日，任命于志宁为太子太师、同中书门下三品；乙丑日，任命黄门侍郎许圉师参知政事。
武后因为太尉赵公长孙无忌接受了厚重的赏赐却不帮助自己，对他深怀怨恨。等到商议废黜王皇后时，燕公于志宁持中立态度，不发表意见，武后也对他不满。许敬宗多次以利害关系劝说长孙无忌，长孙无忌每次都当面驳斥他，许敬宗也心怀怨恨。武后被立为皇后后，长孙无忌内心不安，武后命令许敬宗寻找机会陷害他。
恰逢洛阳人李奉节告发太子洗马韦季方、监察御史李巢结党营私，高宗敕令许敬宗与辛茂将审理此案。许敬宗审讯急迫，韦季方自杀未遂，许敬宗于是诬告上奏说韦季方想要与长孙无忌勾结，陷害忠臣近戚，让权力归于长孙无忌，伺机谋反，如今事情败露，因此自杀。高宗大惊说：“怎么会有这种事！舅舅被小人离间，产生一些猜疑隔阂是有的，何至于谋反！” 许敬宗说：“臣从头到尾仔细推究，谋反的迹象已经显露，陛下仍然有所怀疑，恐怕不是社稷之福。” 高宗哭泣着说：“我家不幸，亲戚之间多次有谋反的意图，往年高阳公主与房遗爱谋反，如今舅舅又这样，让我无颜面对天下之人。这件事如果属实，该怎么办？” 许敬宗回答说：“房遗爱只是个乳臭未干的小子，与一个女子谋反，能成什么气候！长孙无忌与先帝一同谋取天下，天下人佩服他的智谋；担任宰相三十年，天下人畏惧他的威势；如果一旦发动叛乱，陛下派遣谁去抵挡？如今依靠宗庙的神灵，皇天憎恨邪恶，借着审理小事，竟然查获了大奸之人，实在是天下的幸运。臣私下担心长孙无忌得知韦季方自杀后，处境窘迫而发动谋反，振臂一呼，同党云集，必定会成为宗庙的祸患。臣从前见到宇文化及的父亲宇文述被隋炀帝亲近信任，两人结为姻亲，将朝政委托给他；宇文述去世后，宇文化及又掌管禁军，一夜之间在江都发动叛乱，先杀死不依附自己的人，臣的家族也遭遇了这场灾祸，当时大臣苏威、裴矩等人，都在宇文化及的马前舞蹈参拜，唯恐落后，黎明时分就倾覆了隋室。前事不远，希望陛下迅速决断！” 高宗命令许敬宗进一步详细核查。第二天，许敬宗再次上奏说：“昨晚韦季方已经承认与长孙无忌一同谋反，臣又问韦季方：‘长孙无忌是国家的至亲，历代受到宠爱信任，有什么怨恨而要谋反？’韦季方回答说：‘韩瑗曾经对长孙无忌说：“柳奭、褚遂良劝说你立梁王李忠为太子，如今梁王已经被废，皇上也怀疑你，因此将高履行外放。” 从此长孙无忌忧虑恐惧，逐渐图谋自保。后来看到长孙祥又被外放，韩瑗获罪，便日夜与韦季方等人策划谋反。’臣