李圆通原本是隋文帝未显贵时的家奴，他有器量和才干；等到隋文帝被封为隋公后，就任用李圆通和陈茂为僚佐，从此对他们十分信任。后梁被废除后，隋文帝任命后梁太府卿柳庄为给事黄门侍郎。柳庄有见识和气度，学识渊博，善于言辞，通晓典章制度，对政务十分通达，隋文帝和高颎、苏威都很器重他。柳庄和陈茂是同僚，却不肯屈意奉承陈茂，陈茂于是在隋文帝面前诬陷他，隋文帝渐渐疏远柳庄，将他外放为饶州刺史。
隋文帝生性猜忌多疑，不喜欢学问，他依靠智谋夺取皇位后，就以精通法令条文自居，用明察秋毫的手段驾驭臣下，常常命令身边侍从窥探朝廷内外的动向，一旦发现有人犯错就处以重罪。他又担忧负责文书的令史贪污受贿，就私下派人用钱财布帛去贿赂他们，凡是接受贿赂的，立即处斩。隋文帝还经常在宫殿庭院中杖打大臣，一天之内，有时多达三四次；他曾因负责行刑的人杖打不够用力而发怒，当即下令将行刑者斩首。尚书左仆射高颎、治书侍御史柳彧等人劝谏，认为 “朝堂不是杀人的地方，殿廷也不是行刑的场所”。隋文帝拒不采纳。高颎等人于是全都来到朝堂请罪，隋文帝回头对领左右都督田元说：“我的刑杖是不是太重了？” 田元说：“很重。” 隋文帝询问具体情况，田元举起手说：“陛下的刑杖像手指那么粗，打三十下，就相当于普通刑杖打几百下，所以受刑的人大多会被打死。” 隋文帝听后很不高兴，于是下令撤掉殿内的刑杖，若是需要行刑，就交付相关部门处理。后来楚州行参军李君才上书说：“陛下过于宠幸高颎了。” 隋文帝大怒，下令杖打他，可殿内已经没有刑杖，就用马鞭将他活活打死，从此殿内又重新设置了刑杖。没过多久，隋文帝震怒之下，又在殿廷中杀人；兵部侍郎冯基极力劝谏，隋文帝不听，最终还是在殿廷中将人处死。不久隋文帝就后悔了，派人慰问冯基，同时对没有劝谏的群臣十分恼怒。
五月乙未日，隋文帝下诏说：“北魏末年战乱四起，军人被临时安置在军坊府署中，他们南征北伐，居无定所，家中房屋破败，地里也没有固定的桑树，朕对此深感怜悯。凡是军人，都可以划归到所在州县管辖，开垦田地、户籍登记，一律和普通百姓相同。军府的统领调度，仍依照旧有的制度。废除崤山以东、河南地区以及北方边境新设置的军府。”
六月辛酉日，隋文帝制定制度：百姓年满五十岁，可以免除徭役，改为缴纳庸布来代替。
秋季七月癸卯日，隋文帝任命纳言杨素为内史令。
冬季十一月辛丑日，隋文帝到南郊举行祭天仪式。
江东地区自从东晋以来，刑法宽松弛缓，世家大族凌驾于寒门之上；平定陈国之后，隋朝的地方官将这些旧俗全部改变。苏威又制定了《五教》，让百姓无论长幼都必须诵读，江东的士民百姓对此怨声载道。民间又谣传隋朝要将他们迁徙到关中，远近百姓都十分惊恐。于是婺州人汪文进、越州人高智慧、苏州人沈玄懀都起兵造反，各自自称天子，设置文武百官。乐安人蔡道人、蒋山人李凌、饶州人吴世华、温州人沈孝彻、泉州人王国庆、杭州人杨宝英、交州人李春等人都自称大都督，攻陷了隋朝的州县。陈朝的旧境，几乎全部发生叛乱。叛乱势力大的有数万人，小的也有几千人，他们相互呼应。叛军抓住隋朝的县令，有的抽出他的肠子，有的割下他的肉吃掉，还叫嚣道：“看你还敢不敢让我们诵读《五教》！” 隋文帝下诏任命杨素为行军总管，率军讨伐叛军。
杨素准备渡江时，派始兴人麦铁杖头顶一捆稻草，在夜里浮水渡过长江去侦察敌情，返回后又再次前往，结果被叛军擒获，叛军派三十名士兵看守他。麦铁杖趁机夺取看守士兵的刀，将三十名看守全部斩杀，割下他们的鼻子揣在怀里返回军营。杨素对他的勇毅大为惊奇，上奏任命他为仪同三司。
杨素率领水军从杨子津进入江南，在京口攻打叛军首领朱莫问，将其击败。随后又进军攻打晋陵叛军首领顾世兴、无锡叛军首领叶略，都将他们平定。沈玄懀