夏季，四月，前秦镇东将军魏揭飞自称冲天王，率领氐、胡进攻后秦安北将军姚当成于杏城；镇军将军雷恶地反叛响应，攻打后秦镇东将军姚汉得于李润。后秦主姚苌想亲自攻击，群臣都说：“陛下不忧六十里外的苻登，却忧六百里外的魏揭飞，为何？”姚苌说：“苻登非可速灭，我的城池也非苻登能速克。雷恶地智略非凡，若南引魏揭飞，东结董成，得杏城、李润而据之，长安东北就非我所有了。”于是秘密率领精兵一千六百人奔赴。魏揭飞、雷恶地有众数万，氐、胡奔赴者首尾不绝。姚苌每见一军到来，就高兴。群臣奇怪而问之，姚苌说：“魏揭飞等煽诱同恶，种类甚繁，我虽能克其魁首，余党不易速平。如今乌合而来，我乘胜取之，可一举歼灭。”魏揭飞等见后秦兵少，全军进攻。姚苌坚守营垒不战，示弱于敌，暗中派其子中军将军姚崇率骑兵数百绕到敌后。魏揭飞军扰乱，姚苌派镇远将军王超等纵兵攻击，斩魏揭飞及其将士万余级。雷恶地请降，姚苌待之如初，雷恶地对人说：“我自谓智勇杰出当世，而每遇姚翁就受困，确是命该如此！”
姚苌命令姚当成在其营地，每个栅孔中都种一棵树以表彰战功。一年多后，问他，姚当成说：“营地太小，已经扩大了。”姚苌说：“我自成年以来，与人交战，从未如此痛快，以千余兵破三万之众，营地正因为小才奇妙，岂是以大为贵呢！”
吐谷浑视连派使者见金城王乞伏乾归，乞伏乾归任命视连为沙州牧、白兰王。
丙寅日，魏王拓跋珪与后燕赵王慕容麟在意辛山会合，攻击贺兰部、纥突邻部、纥奚部，破之，纥突邻、纥奚都投降北魏。
秋季，七月，冯翊人郭质在广乡起兵响应前秦，传檄三辅说：“姚苌凶虐，毒害神人。我等世代蒙受先帝（苻坚）尧、舜之仁，不是常伯（近臣）、纳言（尚书）之子，就是卿校、牧守之孙。与其含耻而存，不如守道而死！”于是三辅壁垒都响应；唯独郑县人苟曜不从，聚众数千归附后秦。前秦任命郭质为冯翊太守；后秦任命苟曜为豫州刺史。
刘卫辰派子直力鞮攻打贺兰部，贺讷困急，向魏请降。丙子日，魏王拓跋珪引兵救援，直力鞮退走。拓跋珪迁移贺讷部落，安置在东部边境。
八月，东晋刘牢之在鄄城攻击翟钊，翟钊逃往黄河以北；又在滑台击败翟辽，张愿来降。
九月，北平人吴柱聚众千余，立沙门法长为天子。攻破北平郡，转寇广都，进入白狼城。后燕幽州牧高阳王慕容隆正安葬其夫人，郡县守宰都会集。众人听说吴柱反叛，请慕容隆回城，派大兵讨伐。慕容隆说：“如今民间安居乐业，民不思乱。吴柱等以诈谋迷惑愚民，诱逼相聚，成不了事。”于是留待葬毕，派广平太守、广都令先回，接着派安昌侯慕容进率百余骑奔赴白狼城。吴柱部众听说，都溃散；全力追捕，斩之。
东晋任命侍中王国宝为中书令，不久兼中领军。
丁未日，任命吴郡太守王珣为尚书右仆射。
吐谷浑视连去世，子视罴立。视罴因父祖慈仁，被四邻侵侮，于是督厉将士，欲建功业。冬季，十月，金城王乞伏乾归派使者拜视罴为沙州牧、白兰王，视罴不接受。
十二月，郭质与苟曜在郑县东交战，郭质败，奔洛阳。
越质诘归据平襄，背叛金城王乞伏乾归。
晋孝武帝太元十六年（辛卯年，公元391年）
春季，正月，后燕在蓟城设置行台，加授长乐公慕容盛录行台尚书事。
金城王乞伏乾归攻击越质诘归，越质诘归投降，乞伏乾归将同宗之女嫁给他。贺染干谋杀其兄贺讷，贺讷知道后，举兵相攻。魏王拓跋珪报告后燕，请求作为向导讨伐他们。二月，甲戌日，后燕主慕容垂派赵王慕容麟率兵攻击贺讷，镇北将军兰汗率龙城之兵攻击贺染干。
三月，前秦主苻登从雍城攻打后秦安东将军金荣于范氏堡，攻克。于是渡过渭水，攻打后秦京兆太守韦范于段氏堡，不克，进据曲牢。
夏季，四月，后燕兰汗在牛都击败贺染干。
苟曜有众一万，秘密召请前秦主苻登，答应为内应。苻登从曲牢向繁川进军，驻军马头原。五月，后秦主姚苌引兵迎战，苻登击破之，斩其右将军吴忠。姚苌收集部众再战，姚硕德说：“陛下一向谨慎不轻战，常想以计取胜，今战失利却更向前逼贼，为何？”姚苌说：“苻登用兵迟缓，不识虚实。今轻兵直进，远远占据我东面，这必定是苟曜那小子与他有密谋。拖延则其谋得成，故趁其未合兵，急击之，以破坏他们的计划。”于是进战，大破苻登。苻登退屯郿县。
前秦兖州刺史强金槌据新平，投降后秦，以其子强逵为人质。后秦主姚苌率数百骑进入强金槌军营。部下劝谏，姚苌说：“强金槌既离苻登，又欲图我，将归何处？况且他刚来归附，应推心结纳，怎能又因不信任怀疑他？”不久群氐想抓姚苌，强金槌不从。