曹节升任长乐卫尉，封为育阳侯。 王甫升任中常侍，仍兼任黄门令。朱瑀、共普、张亮等六人都封为列侯。另外十一人封为关内侯。于是，一群小人得志，士大夫都垂头丧气。陈蕃的朋友陈留郡人朱震收殓埋葬了陈蕃的尸体，并把陈蕃的儿子陈逸藏匿起来。事情被发现后，朱震全家被捕入狱，都戴上刑具。朱震虽遭严刑拷打，誓死不肯吐露真情，陈逸因此得以幸免。窦武府中的掾吏桂阳郡人胡腾收殓殡葬了窦武的尸体，为他发丧，因此也被禁锢。窦武的孙子窦辅，年仅二岁。胡腾谎称是自己的儿子，与令史南阳郡人张敞一起将他藏匿在零陵郡（今湖南永州）境内，也得以幸免。张奂升任大司农，因功封侯。张奂深恨被曹节等人出卖，坚决推辞不肯接受。
任命司徒胡广为太傅，主管尚书事务；司空刘宠为司徒；大鸿胪许栩为司空。
冬季，十月，甲辰晦（三十日），发生日食。
十一月，太尉刘矩被免官；任命太仆沛国人闻人袭为太尉。
十二月，鲜卑和濊貊侵犯幽州、并州。
这一年，疏勒国（今新疆喀什）国王的叔父和得杀死国王自立为王。
乌桓酋长上谷郡的难楼拥有部众九千余落（户）；辽西郡的丘力居拥有部众五千余落，各自称王。 辽东郡的苏仆延拥有一千余落，自称峭王。右北平郡的乌延拥有八百余落，自称汗鲁王。
汉灵帝建宁二年（己酉，公元169年）
春季，正月，丁丑（疑误，正月无丁丑），大赦天下。
灵帝将贵人董氏从河间国（今河北献县东南）迎接到京都洛阳。 三月，乙巳（初三），尊董贵人为孝仁皇后，住永乐宫。任命她的哥哥董宠为执金吾（掌管京师警卫），侄儿董重为五官中郎将（皇帝侍卫官）。
夏季，四月，壬辰（二十一日），御座上出现一条青蛇。 癸巳（二十二日），刮大风，降冰雹，雷霆霹雳，拔起大树一百多棵。灵帝下诏，命三公九卿以下官员各呈密封奏章。大司农张奂上书说：“从前，周公姬旦埋葬不合礼制，上天震怒（事见《尚书》）。如今窦武、陈蕃忠诚正直，尚未蒙受赦免和宽恕。妖异的发生，都是为此而发。应该尽快收殓安葬他们，召回被流放的家属，解除株连禁锢的禁令。还有，皇太后虽然居住南宫，但恩遇礼敬断绝，朝臣无人敢言，远近失望。陛下应该思念大义，回报养育之恩。”灵帝认为张奂的意见很好，但询问各位常侍时，左右宦官都厌恶张奂的话，灵帝无法自己做主。张奂又与尚书刘猛等共同推荐王畅、李膺是担任三公的合适人选。曹节等人更加痛恨张奂等人，于是下诏严厉斥责。张奂等人自动投入廷尉狱，请求囚禁。几天后才被释放，但仍罚扣三个月俸禄赎罪。
郎中东郡人谢弼呈上密封奏章说： “我听说：‘蟒蛇毒蛇，是女子之兆（指后宫）。’我想陛下能继承皇位，是窦太后在宫中决策拥立的结果。《尚书》说：‘父子兄弟，罪行互不牵连。’窦家的诛杀，岂能把罪过延及太后！将她幽禁空宫，忧愁伤感感动天心，万一患上疾病，陛下还有什么面目见天下人！孝和皇帝（和帝）不断绝窦太后的养育之恩（指和帝不罪窦太后），前世传为美谈。礼法规定：‘为人后嗣者就是他的儿子。’如今陛下以桓帝为父，怎能不以窦太后为母呢！希望陛下仰慕舜帝侍奉瞽叟（其父）的孝心（指《尚书》“克谐以孝，烝烝乂”），俯察《诗经·凯风》（咏孝子自责）思念母亲的哀思。我又听说：‘开创国家和承继家业，不能任用小人。’如今功臣久居外郡（指未被重用），未得封爵官秩；而陛下乳母却受宠私封，享受大封。大风雨雹的灾异，也由于此。还有，前太傅陈蕃，为王室辛劳，却被一群奸邪陷害，一旦被杀，其手段残忍暴虐，震惊天