侍御史王求礼上书说：“古代的明堂，茅草屋顶不加修剪，柞木椽子不加砍削。如今的明堂用珠玉装饰，用丹青彩绘，铁凤高耸入云，金龙隐现于云雾之中，即便是商纣王的琼台、夏桀的瑶室，也无法与之相比。”太后没有回应。太后打算征调梁州、凤州、巴州的獠族百姓，从雅州开山修路，出兵攻打生羌，进而袭击吐蕃。正字陈子昂上书认为：“雅州边境的羌人，从唐朝建立以来从未做过盗贼。如今无故诛杀他们，他们必定会心怀怨恨；而且害怕被灭族，一定会纷纷起兵做盗贼。西山盗贼兴起，蜀地的边境城镇就不得不接连出兵防守，战事长期不能平息，我认为西蜀的祸患，从此就要开始了。我听说吐蕃贪图蜀地的富饶，想要夺取它已经很久了，只是因为山川阻隔、关隘不通，才没能采取行动。如今国家却骚扰边境的羌人，开辟关隘通道，让吐蕃得以收纳逃亡的羌人，作为向导来攻打边境，这是借给敌人兵器、为盗贼清除道路，把整个蜀地拱手送给吐蕃啊。蜀地是国家的宝库，能够接济中原地区。如今掌权者却贪图侥幸之利，去征讨西羌，即使得到他们的土地也不能耕种，得到他们的财富也不能使国家富足，只是白白浪费钱财，对陛下的圣德没有任何益处，更何况成败还不可知呢！蜀地所依靠的是地势险要，百姓之所以安居乐业是因为没有徭役；如今国家却开辟它的险要之地，役使它的百姓，险要之地被开辟就方便了敌人入侵，百姓被役使就会耗费财力，我担心还没见到羌人和吐蕃的军队，蜀地内部就已经出现奸贼盗贼了。况且蜀地百姓体弱，不熟悉打仗，山川辽阔遥远，距离中原很远，如今无故招致西羌、吐蕃的祸患，我预见不到一百年，蜀地就会被异族占据。国家近来废除安北都护府、撤销单于都护府、放弃龟兹、疏勒，天下人都一致称赞这是盛德之举，因为陛下致力于休养百姓，而不是扩张土地。如今山东地区饥荒，关陇地区疲惫，却听从贪婪之人的建议，谋划动用军队、发动大规模徭役，自古以来国家灭亡、家族衰败，没有不是因为穷兵黩武的，希望陛下慎重考虑。”后来，这项徭役最终没有实施。
永昌元年己丑（公元689年）
春正月乙卯朔日，太后在万象神宫举行盛大祭祀，太后身穿帝王的衮袍礼帽，腰插大圭，手持镇圭，作为初献者；皇帝作为亚献者，太子作为终献者。祭祀先祭拜昊天上帝的神位，接着是唐高祖、唐太宗、唐高宗，然后是魏国先王，最后是五方帝的神位。太后亲临则天门，大赦天下，更改年号。丁巳日，太后驾临明堂，接受群臣朝贺。戊午日，太后在明堂宣布政令，颁布九条训诫来教导百官。己未日，太后再次驾临明堂，设宴款待群臣。
二月丁酉日，太后追尊魏忠孝王为周忠孝太皇，追尊其妻子为忠孝太后，将文水的陵墓命名为章德陵，咸阳的陵墓命名为明义陵。设置崇先府官员。戊戌日，追尊鲁公为太原靖王，北平王为赵肃恭王，金城王为魏义康王，太原王为周安成王。
三月甲子日，张光辅代理纳言一职。
壬申日，太后询问正字陈子昂当今治理国家的关键。陈子昂退朝后，上书认为：“应当放宽刑罚、尊崇道德，停止战争，减轻赋税徭役，抚慰宗室成员，让他们各自安心。”奏疏言辞委婉、情意恳切，议论十分精辟，将近三千字。
癸酉日，朝廷任命天官尚书武承嗣为纳言，张光辅代理内史。
夏四月甲辰日，朝廷处死辰州别驾汝南王李炜、连州别驾鄱阳公李謓等十二名宗室成员，将他们的家属迁徙到巂州。李炜是李恽的儿子，李謓是李元庆的儿子。
己酉日，朝廷处死天官侍郎蓝田人邓玄挺。邓玄挺的女儿是李謓的妻子，他又和李炜关系友好。李謓谋划从庐陵迎接唐中宗回京，向邓玄挺询问意见，李炜也曾对邓玄挺说：“想要采取紧急行动，你看怎么样？”邓玄挺都没有回应。因此他以“知道谋反却不告发”的罪名，与李炜、李謓一同被诛杀。
五月丙辰日，朝廷任命文昌右相韦待价为安息道行军大总管，率军攻打吐蕃。浪穹州蛮人酋长傍时昔等二十五部，之前归附吐蕃，到这时前来投降；朝廷任命傍时昔为浪穹州刺史，让他统领本部部众。
己巳日，朝廷任命僧人怀义为新平军大总管，北上讨伐突厥。大军走到紫河，没有遇到突厥军队，于是在单于台刻石记功后返回。
诸王起兵时，只有贝州刺史纪王李慎没有参与谋划，但也被牵连入狱；秋七月丁巳日，李慎用囚车迁徙到巴州，改姓虺氏，走到蒲州时去世。他的八个儿