六月甲戌朔日，高宗即位，大赦天下。
丁丑日，任命叠州都督李世积为特进、检校洛州刺史、洛阳宫留守。
此前，太宗名“世民”，下令天下只要不连称“世民”二字就不用避讳；到这时，才开始修改官职名称中触犯先帝名讳的字。
癸未日，任命长孙无忌为太尉，兼检校中书令，掌管尚书省、门下省事务。长孙无忌坚决推辞掌管尚书省事务，高宗同意了，仍任命他以太尉身份同中书门下三品。
癸巳日，任命李世积为开府仪同三司、同中书门下三品。
阿史那社尔攻破龟兹时，行军长史薛万备请求借着军威劝说于阗王伏阇信入朝，阿史那社尔同意了。秋季七月己酉日，伏阇信跟随薛万备入朝，高宗下诏让他拜谒太宗的灵柩。
八月癸酉日夜，发生地震，晋州最为严重，压死五千多人。
庚寅日，将太宗文皇帝安葬在昭陵，庙号太宗。阿史那社尔、契苾何力请求自杀殉葬，高宗派人传达太宗遗旨，不允许他们这样做。被太宗擒服的外族君主首领颉利等人共十四人，都被雕刻石像，刻上姓名排列在昭陵北司马门内。
丁酉日，礼部尚书许敬宗上奏称弘农府君庙应当拆毁，请求将神主藏在西夹室；高宗采纳了他的建议。
九月乙卯日，任命李世积为左仆射。
冬季十月，在突厥各部设置舍利等五州，隶属于云中都督府；设置苏农等六州，隶属于定襄都督府。
乙亥日，高宗询问大理卿唐临在押囚犯的人数，唐临回答说：“现在在押的有五十多人，只有两人应当处死。”高宗很高兴。高宗曾亲自审查在押囚犯，前任大理卿判处的囚犯大多哭喊着喊冤，唯独唐临判处的囚犯一言不发。高宗感到奇怪，询问原因。囚犯说：“唐卿判处的刑罚，本来就没有冤枉我们。”高宗叹息许久，说：“掌管刑狱的人不就应该这样吗！”
高宗任命吐蕃赞普松赞干布为驸马都尉，封西海郡王。赞普写信给长孙无忌等人说：“天子刚即位，如果臣子中有不忠之人，我将率领军队赶赴中原讨伐铲除他。”
十二月，下诏允许濮王李泰开设府署、设置僚属，车马服饰、珍贵膳食都特别优厚。
永徽元年（庚戌年，公元650年）
春季正月辛丑朔日，改年号为永徽。
丙午日，册立妃子王氏为皇后。皇后是王思政的孙女。任命皇后的父亲王仁佑为特进、魏国公。
己未日，任命张行成为侍中。
辛酉日，高宗召见各州朝集使，对他们说：“我刚即位，凡是对百姓不利的事情，都应当上奏，没说尽的可以另外密封上奏。”从此，高宗每天召见十位刺史入宫，询问百姓的疾苦以及他们的治理情况。
洛阳人李弘泰诬告长孙无忌谋反，高宗立刻下令将他斩首。长孙无忌和褚遂良同心协力辅佐朝政，高宗也尊重礼遇他们，虚心听从他们的意见，因此永徽年间的政治，百姓富足安定，有贞观时期的遗风。
太宗的女儿衡山公主应当嫁给长孙氏，有关部门认为服丧期已满，想在今年秋季成婚。于志宁上奏说：“汉文帝制定丧礼制度，本来是为了天下百姓。公主原本应服斩衰重丧，即使按照惯例除去丧服，怎能让感情也跟着惯例改变呢？请求等三年丧期结束后再成婚。”高宗采纳了他的建议。
二月辛卯日，册立皇子李孝为许王，李上金为杞王，李素节为雍王。
夏季五月壬戌日，吐蕃赞普松赞干布去世，他的嫡子早死，立孙子为赞普。赞普年幼弱小，国家政事都由国相禄东赞决定。禄东赞性情通达严肃，用兵有谋略，吐蕃之所以强大，威震并降服氐、羌等族，都是他的谋划。
六月，高侃攻打突厥，抵达阿息山。车鼻可汗召集各部兵力，却无人响应，只好率领几百名骑兵逃跑。高侃率领精锐骑兵追击到金山，将他擒获后返回，车鼻可汗的部众全部归降。
起初，阿史那社尔俘虏龟兹王布失毕后，立他的弟弟为国王。唐朝军队返回后，龟兹各酋长争夺王位，相互攻击。秋季八月壬午