五月辛未日，晋武帝被安葬在峻阳陵。
杨骏心里清楚，自己平时没什么好名声，就想效仿魏明帝即位时的做法，给大家普遍加封爵位，以此来讨好众人。左军将军傅祗提议，让所有大臣都晋升一级，参与丧事办理的人晋升两级；俸禄两千石以上的官员都封为关中侯，还免除他们一年的田租赋税。散骑常侍石崇和散骑侍郎何攀一起上书反对，他们说：“太子在东宫做了二十多年储君，如今继承皇位，这时候行赏封爵，赏赐力度竟然比当初晋朝建立以及将领们平定东吴时还要优厚，实在不合情理。况且大晋国运长久，现在制定的制度是要流传后世的，如果以后有爵位就晋升，那几代人之后，大家不都成公侯了！”但杨骏根本不听。
朝廷又下诏书，任命太尉杨骏为太傅、大都督，授予假黄钺，让他处理朝廷政务，百官都要听从他的指挥。傅咸劝杨骏说：“皇帝居丧期间不理政事的制度，已经很久没人遵守了。现在皇上谦虚，把政事托付给您，可天下人并不认可，我担心您很难承担这份重任。周公那么圣明，还遭人非议，更何况现在皇上年纪可比当年的成王大，情况不一样啊！我觉得皇陵修建完成后，您应该好好考虑是继续掌权还是退隐，只要能表明您的忠诚，不用多说什么大家也能明白！”可杨骏根本听不进去。傅咸多次进谏，杨骏渐渐对他不满，甚至想把他外放到地方当郡守。李斌劝阻说：“赶走正直的人，会失去人心的。”杨骏这才作罢。杨济给傅咸写信说：“俗话说‘生个傻儿子，才能远离官场是非’，官场的事儿可不好处理。我怕你想破脑袋也想不明白，所以特意写信提醒你。”傅咸回信说：“卫瓘曾说‘沉迷酒色杀人，比正直处世更厉害’。因酒色而死，人们不会后悔，可有些人却害怕因正直招来灾祸，这是因为他们内心不坚定，想靠敷衍了事来假装明智。自古以来，因正直招来灾祸的，要么是矫枉过正，要么是不够忠诚，想用激烈的言行博取名声，所以才招人怨恨。哪有真心实意、一心为国却被人怨恨的道理！”
杨骏深知贾后性格凶狠、诡计多端，心里十分忌惮她。于是，他安排自己的外甥段广担任散骑常侍，负责掌管朝廷机密；又让张劭担任中护军，统领禁军。此后，只要有诏书命令，都得先由皇帝看过，再呈给太后，最后才能执行。
杨骏处理政务时，既严厉苛刻又独断专行，朝廷内外很多人都讨厌他。冯翊太守孙楚劝他说：“您作为外戚，身负伊尹、霍光那样辅佐朝政的重任，应该秉持公正，待人诚信，为人谦逊。可现在皇室宗亲势力强大，您却不和他们共同处理国事，对内猜忌，对外任用亲信，大祸很快就要临头了！”杨骏还是不听。孙楚是孙资的孙子。
弘训少府蒯钦是杨骏姑姑的儿子，他多次直言批评杨骏，旁人都替他捏把汗。蒯钦却淡定地说：“杨文长（杨骏字文长）虽然糊涂，但还知道不能随便杀无罪之人，顶多疏远我。我被疏远了，反而能免祸，不然以后杨家出事，我也得跟着遭殃！”
杨骏征召匈奴东部的王彰担任司马，王彰却直接拒绝，躲了起来。朋友新兴人张宣子觉得奇怪，就问他原因。王彰说：“自古以来，一个家族出两个皇后，没有不灭亡的。更何况杨太傅亲近小人，疏远君子，独断专行，很快就要完蛋了。我就算漂洋过海、远走塞外躲避，都怕被牵连，怎么还能接受他的征召呢？而且晋武帝没为国家长远打算，继位的太子根本挑不起大梁，接受遗命辅佐的人又不行，天下大乱马上就要来了！”
秋天八月壬午日，朝廷立广陵王司马遹为皇太子，还任命中书监何劭为太子太师，卫尉裴楷为少师，吏部尚书王戎为太傅，前太常张华为少傅，卫将军杨济为太保，尚书和峤为少保，又封太子的母亲谢氏为淑媛。但贾后却把谢氏安排在别的地方居住，不让她和太子见面。当初，和峤曾不慌不忙地对晋武帝说：“皇太子为人太过老实，可如今世道人心复杂，恐怕他难以处理好陛下的家事。”晋武帝听了没说话。后来，和峤与荀勖等人一起侍奉晋武帝，晋武帝说：“太子最近上朝表现有进步，你们可以一起去看看他，顺便和他聊聊国事。”回来后，荀勖等人都夸赞太子聪明有见识、气度不凡，和皇上说的一样。可和峤却说：“太子的本性还是和以前一样。”晋武帝听了很不高兴，起身离开了。晋惠帝即位后，和峤陪着太子司马遹入朝，贾后让晋惠帝问和峤：“你以前说我处理不好家事，现在觉得怎么样？”和峤回答：“我以前侍奉先帝时，确实说过这样的话。要是我说的话没应验，那可是国家的福气啊！”
冬天十月辛酉日，朝廷任命石鉴为太尉，陇西王司马泰为司空，还封刘渊为建威将军