其中河南尹夏侯和向朝中重臣贾充进言迎立更有贤能的人为继承人，贾充犹豫并未表态，司马炎得知后很不高兴，之后便夺去了二人的实权。
尚书张华更是直言继承人应当为司马攸，司马炎听后便将其外放贬出中央。
后来司马炎身边的中书监荀勖和侍中冯紞因与司马攸关系不和，向司马炎表示朝廷百官都心向司马攸，太子将来必然无法顺利继位。
司马炎便下决心消减司马攸的名望，之后采纳冯紞的建议，于太康三年（公元282年）加封司马攸为大司马、都督青州诸军事，
通过此举表面上为司马攸提升了官职，实则将其调任到封国中远离中央，从而减弱其势力。
太康四年（公元283年）司马炎继续下诏书催促司马攸前往封国。司马攸知道自己受到陷害，于是忧愤成疾，乞求留在国都看守皇陵，但司马炎予以拒绝。
之后司马炎派御医治疗司马攸，御医迎合司马炎的心意都表示司马攸没病，
于是司马炎继续催促病情加重的司马攸启程，司马攸便勉强辞行，强撑病体启程，两天后病死，
“至此司马攸本人去世，不支持太子的大臣也被司马炎进行打击，太子司马衷的地位得以稳固，使得后来司马炎去世后晋朝权力平稳过渡。”
“自太康元年灭亡吴国后的十数年里，晋国国内外没再出现较大的叛乱或军事冲突”
“国内经济得以充分恢复，司马炎也进行了农业改革、同时采取一系列措施恢复农业，使得国内生产出现繁荣景象。”
“此时期晋国国内人口增长速度也很快，仅太康三年（公元282年）时晋国国内户口便从统一全国时的二百四十五万户增长至三百七十七万户。”
“经司马炎改革后，太康年间的赋税比较平均，国家没有多少大事发生”
“因而人人能够安居乐业，出现小康的局面，社会繁荣以至牛马遍野、外户不闭，”
“甚至传出了天下无穷人的谚语，这一段社会经济高度增长、繁荣的时期也被后世称为“太康之治”。”
“此外上百个晋国四方的少数民族部落也在数年里先后向司马炎表示归顺，而司马炎也继续派兵击败不服从晋朝的鲜卑族人，”
“最终于太康十年（公元289年）迫使辽东慕容部鲜卑的首领慕容廆归降。”
“司马炎执政后期，国内矛盾逐渐显现出来，其本人自平定吴国之后便开始逐渐懈怠，较即位初期更加注重享乐，在扩充后宫的同时也沉浸于宴饮游乐之中。”
“朝政上司马炎宠信皇后的父亲侍中杨骏等人，晋朝开始出现贵族、外戚专权的现象。”
“而政治制度上司马炎继承了曹魏的政策，采取九品中正制，使得世家大族长期垄断高级官员位置，”
“社会阶层流动性大大下降，且给予世族地主极大的政治、经济优待，这些导致太康后期晋国社会腐败奢侈情况严重，”
“以至于出现公卿石崇与王恺斗富、太傅何曾每日饮食耗费高达万钱的情况。”
“世家大族的奢侈行为浪费了大量资源，也使得太康年间的小康局面好景不长。”
“司马炎对于太子的一系列举措同样为晋国埋下了隐患，考虑到司马衷的嫡长子不是其皇后贾氏所生，”
“于是采纳谋臣王佑的建议，大力提升宗室藩王们的地位与权力，并授予他们很大军权，命其守卫各个关键位置以做防备，但这又为藩王们兴兵混战埋下了隐患。”
“晋太熙元年（公元290年），司马炎病重，此时开国功臣们大多去世，而侍中杨骏不许其他大臣见到司马炎，独自守在其身边，并趁机改换朝中公卿，安插自己的亲信。”
“之后司马炎病情稍好，见杨骏的人事安排不合理，便下诏命汝南王司马亮与杨骏一起辅政，”
“同时任命了一些有名望的年轻大臣辅佐太子，而杨骏却将诏书藏匿起来，后来司马炎病重，皇后奏请让杨骏辅政，司马炎点头应允。”
“随后司马炎希望见司马亮一面对其托付后事，但司马亮没能及时回到国都。”
苏轼：之后皇后又写了一份对杨骏大加封赏的诏书，司马炎由于病重看后没能言语，而诏书最后仍然被执行了下去。
同年四月己酉日（公元290年5月16日），司马炎在含章殿去世，享年五十五岁，被安葬于峻阳陵，庙号为世祖。
司马炎去世后，太子司马衷登基，即晋惠帝，但其能力欠缺导致皇后贾南风与杨骏争权，使得晋朝政局动荡，
同时各地藩王的权力过大，开始起兵争夺对中央权力的控制权，晋朝陷入动乱之中，国力大大下降，史称“八王之乱”。
司马炎即位时便开始颁布新的法律制度，之后又多次对官员下诏命其积极处理案件、审理