“全员防御，保护技术人员！”雷克斯下令，带领战士们组成防御阵型，与敌军展开激战。狂乱族战士力大无穷，混沌战斧能轻易斩断钢铁，蚀骨族战士则喷射混沌液，腐蚀小队的防御阵型。小队成员凭借强化型净化药剂与破防武器顽强抵抗，但敌军数量众多，且狂乱族首领的战力极强，多名战士受伤，防御阵型逐渐被突破。
危急时刻，一道金色能量束从控制室门口射来，击中狂乱族首领的后背，净化能量顺着伤口涌入体内，首领发出痛苦的嘶吼。源带领十名启源族战士冲了进来，手中的净化长剑散发着强烈的光芒，快速斩杀周围的混沌仆从。“雷克斯，我来牵制首领，你们尽快完成任务！”源大喊，挥舞着净化长剑，与狂乱族首领展开激战。启源族战士则组成净化屏障，保护技术人员，清除残余的混沌仆从。
源与狂乱族首领的激战惊天动地，净化长剑与混沌战斧碰撞，金色与黑色能量交织，形成巨大的能量冲击波，将控制室的管路震碎。源凭借本源淬炼第三重境界的战力与启源族本源能量的优势，不断压制狂乱族首领的混沌能量，长剑的净化效果逐渐瓦解首领体内的混沌核心。最终，源纵身跃起，净化长剑刺穿首领的胸膛，彻底斩杀狂乱族首领。
此时，星桥族技术人员也顺利完成任务，切断了能量核心与混沌壁垒的连接，同时摧毁了母舰主炮的控制系统。混沌母舰的能量核心瞬间紊乱，剧烈的爆炸在母舰内部爆发，黑色的混沌能量四散飞溅。“立刻撤离！”雷克斯大喊，带领小队与源快速登上小型突击舰，借助空间折叠装置，逃离混沌母舰，返回联盟舰队。
混沌母舰的爆炸引发连锁反应，峡谷两侧的混沌壁垒能量紊乱加剧，龟裂纹路不断扩大，最终彻底崩塌，一道通往混沌深渊的巨大通道出现在眼前。通道内弥漫着浓稠的混沌能量，无数混沌余孽在通道中游荡，远处的黑暗中，隐约可见无数混沌战舰的黑影，正是混沌余孽的集结点——混沌深渊。
卡莎看着崩塌的混沌壁垒，掌心的传承徽章突然亮起，与宇宙起源图谱产生强烈共鸣，一道金色能量光束从徽章中射出，在能量面板上形成混沌深渊的详细星图。星图显示，混沌深渊分为三层，第一层为“混沌荒原”，布满混沌岩浆与废弃战舰残骸，驻守着大量蚀骨族与狂乱族部队；第二层为“暗影回廊”，是影幽族的巢穴，空间结构极不稳定，隐藏着大量暗影陷阱；第三层为“混沌核心”，是混沌之主核心能量的藏匿地，周围环绕着最强的混沌防御阵型，守护着本源之门的入口。
“各军团休整半小时，补充物资与能量，准备进入混沌深渊！”卡莎下令，联盟舰队在通道入口处停靠，医疗团队快速救治受伤战士，后勤部队补充作战物资，老温团队则对战舰进行紧急修复，升级防御与攻击系统。同时，卡莎召集核心成员召开临时会议，调整后续战术。
“混沌深渊内部环境复杂，混沌能量浓度极高，对我们的战舰与战士都是极大的考验。”卡莎指着星图，沉声道，“第一军团带领十艘主力战舰，作为先锋部队，清理混沌荒原的敌军，搭建临时基地；第二军团带领十五艘主力战舰，跟随先锋部队推进，负责保护物资运输与医疗补给；第三军团带领五艘主力战舰与一百艘小型突击舰，作为机动部队，探查暗影回廊的陷阱与敌军部署；守秘者联盟与星桥族，带领二十艘主力战舰，守护旗舰，借助本源之心与传承徽章，压制混沌能量，同时搭建跨层空间锚点，确保各军团通讯畅通；我将带领源、沧溟等核心成员，跟随机动部队进入暗影回廊，寻找混沌之主的核心能量与本源之门。”
半小时后，联盟舰队休整完毕，朝着混沌深渊进发。第一军团的十艘主力战舰率先进入通道，朝着混沌荒原推进。混沌荒原上，地面流淌着红色的混沌岩浆，空气中弥漫着狂暴的混沌能量，无数蚀骨族与狂乱族战士在荒原上游荡，废弃的战舰残骸遍布四周，形成天然的防御屏障。
“开启混沌净化炮，清理沿途敌军！”凯尔下令，战舰的混沌净化炮同时开火，银色能量束击中地面的混沌岩浆，引发剧烈爆炸，净化能量扩散开来，将周围的混沌仆从歼灭。蚀骨族与狂乱族战士见状，纷纷朝着舰队发起冲锋，数量多达数千人，形成一道巨型洪流，朝着战舰涌来。
第一军团的战士们立刻展开反击，主炮与副炮同时开火，破防穿甲弹与净化能量束交织，不断收割敌军的生命。部分战士乘坐小型突击舰登陆，与敌军展开近身厮杀，启源族战士的净化长剑、沧澜族战士的水刃、星灵族战士的净化箭矢相互配合，形成强大的战力，逐步清理混沌荒原的敌军。激战两个时辰后，第一军团成功清除混沌荒原的混沌仆从，摧毁敌军临时据点三个，在荒原中央搭建起临时基地，为后续部队提供支撑。
联盟舰队全部抵达混沌荒原后，第三军团的机动部队立刻朝着暗影回廊进发。暗影回廊内光线昏暗，空间结构极不稳定，到处都是空间裂缝，空气中弥漫着浓郁的暗影能量与混沌能量，无数暗影陷阱隐藏在岩壁之后，稍有不慎就会