他去世后，其子贾汗吉尔继位！
贾汗吉尔在其很小时就成为了皇位继承者。
出于对等待皇位继承的不耐烦，
他在公元1599年时，便起兵反抗。
虽然被镇压，但他还是在他继母和其他人的支持下，在公元1605年继承了皇位。
在他的任内，莫卧尔帝国政局稳定，经济繁荣，文化愈发灿烂，并继承了其父亲对国家行政的出色管理。
在贾汗吉尔时期，一直对莫卧儿帝国有威胁的乌代普尔政权被解除，
乌代普尔的首领罗那，最终答应归顺莫卧儿帝国，
但乌代普尔政权仍保持独立性。
公元1602年，荷兰东印度公司挂牌营业，开始了对印度的殖民活动。
此后，相继在普利卡特，苏拉特，科钦等地建立殖民据点，并排挤葡萄牙人势力。
但是，荷兰将其殖民重心放在东印度群岛（印度尼西亚），对广大的印度不甚上心，只是控制重要的贸易据点与海上贸易线路。
继葡萄牙，荷兰之后，英国，法国殖民者也相继来到印度，
与人口少，陆军弱，国力有限，只能控制沿海商业据点与海上商路的葡萄牙与荷兰殖民者不同，
英、法殖民者人口众多，国力军事实力更为强大，殖民策略更为成熟，有能力深入内陆，在殖民地建立长期统治，
尤其是英国，对印度的殖民活动颇感兴趣，
在女王伊丽莎白一世的支持下，
公元1600年，英国东印度公司成立，
英国殖民政府起先与荷兰人合作，排挤葡萄牙人的势力，
一边派出使者访问，贿赂莫卧儿王朝的统治者，想方设法取得莫卧儿王朝的支持，
公元1613年，6月，莫卧儿帝国准许英国在苏拉特建立商馆！
公元1613年，10月，葡萄牙第乌长官路易斯为了报复莫卧儿帝国与英国交好，
袭击了莫卧儿帝国皇太后玛丽亚姆·乌兹·扎马尼的私人财产——盖伦帆船拉西米号，将其焚毁，
但在莫卧尔帝国和英国的联合打击下，葡萄牙军队大败，
战后，葡萄牙果阿总督将路易斯解职，向莫卧儿帝国致歉，双方重新恢复了友好关系！
公元1618年，莫卧儿皇帝贾汗吉尔，再次颁布敕令，
准许英国商人在莫卧儿帝国境内自由贸易与开设商馆，开始殖民活动，
同时，英国女王伊丽莎白一世，也大力支持东印度公司在印度的殖民活动，
之后英国殖民者大举，来到印度东海岸的卡纳蒂克地区（也译为卡尔纳提克地区），
在该地以每年600英镑的价格和提供最新式英国燧发枪为条件，
从莫卧尔帝国皇帝贾汗吉尔手中，租得土地，
后扩建为马德拉斯，圣大卫堡等殖民据点，
并慢慢成为了之后英国势力在印度东海岸的殖民中心。
在获得英国财政和最新式英式燧发枪的帮助下，
贾汗吉尔开始对南方德干的一些伊斯兰教王朝发动了一系列战争，
公元1619年，艾哈迈德纳贾尔皇帝最终被征服，
此时莫卧尔帝国的领土在南方扩大了许多。
同时，因为贾汗吉尔对艺术的喜爱，
故，莫卧儿绘画在这一时期得到了很大的发展，
当时帝国画院大师云集，贾汗吉尔每天身旁都要有这些人跟随，帮助把美好的景物记录下来，
莫卧儿绘画从一开始只画些插图，到此时绘画上又擅长画一些山水、花鸟和人物。
后来在一次绘画上，贾汗吉尔偶遇了波斯裔贵族米尔扎·吉亚斯·贝格之女——努尔·贾汗，
并深深被其吸引，后于公元1611年，封努尔·贾汗为皇后，
之后皇后努尔·贾汗，凭借卓越的政治才能，在贾汗吉尔体弱期间实际摄政16年，
成为印度历史上首位女性统治者，
其权力涵盖军事决策与宫廷事务管理，名字还被铸于帝国硬币之上。
公元1627年，贾汗吉尔逝世后，
皇后努尔·贾汉，企图扶持女婿，贾汗吉尔的幼子沙里亚尔王子继位，
由此导致了莫卧尔帝国内乱！
贾汗吉尔，有4个儿子，沙里亚尔只是幼子，他上面还有三个哥哥，
无论如何，也轮不到他继位，
故，公元1627年，贾汗吉尔去世，幼子沙里亚尔在皇太后努尔·贾汉的支持下继位后，
老大库拉姆，立刻起兵平乱，击败沙里亚尔，
后于第二年，公元1628年，在阿格拉称帝，称“沙·贾汗”，
在波斯语中的意思是，“世界的统治者”，