在中国，晚清的洋务运动试图以“中体西用”改良传统官制，增设总理各国事务衙门、南北洋通商大臣等新式机构，打破了六部九卿的固化框架，成为近代外交与洋务管理的开端；戊戌变法中，裁汰冗官、设立京师大学堂等举措，进一步冲击了封建官僚体系的腐朽根基。辛亥革命推翻帝制后，南京临时政府效仿西方建立内阁制，设陆军、海军、外交、司法等十部，初步构建起现代民主共和的行政架构；北洋政府时期虽政局动荡，却延续了文官考试制度，试图规范官吏选拔机制。南京国民政府时期，推行“五院制”，将行政、立法、司法、考试、监察五权分立，试图融合中西治理智慧，但其官僚体系最终沦为独裁统治的工具。
而在抗日战争时期自由灵活，贴合实际，实事求是的相关政策，成为相应机关机构的建立变动的主要参考来源之一。
直至新中国成立，社会主义行政体系正式确立，人民政府以“为人民服务”为核心宗旨，构建起中央统一领导、地方分级管理的行政架构，设立政务院（后改为国务院）作为最高行政机关，下设各部、委、办，统筹全国经济建设、社会治理与外交事务。改革开放后，行政体制改革持续深化，政企分开、简政放权、转变政府职能成为核心方向，从精简机构到推行公务员制度，从行政审批制度改革到“放管服”优化，机关机构的运作日益规范化、法治化；进入新时代，服务型政府、法治政府建设加速推进，数字政务、智慧治理等新模式不断涌现，机关机构的公共服务属性愈发凸显，成为推动国家治理体系和治理能力现代化的核心载体。
在欧洲及北美地区，启蒙运动的“天赋人权”“三权分立”思想，为现代行政体系的构建提供了理论基石。英国通过资产阶级革命确立君主立宪制，议会成为最高权力机关，内阁由议会多数党组成，对议会负责，形成“议会主权”下的责任内阁制，传统王室机关逐渐沦为象征性存在；法国历经大革命的洗礼，从君主专制到共和制反复博弈，最终确立了总统与议会共同制衡的行政架构，中央政府（总理领导）掌握行政实权，地方推行省、市镇两级自治，兼顾中央集权与地方民主。美国则以三权分立原则为核心，构建起总统制共和政体，总统为国家元首兼行政首脑，内阁各部直接对总统负责，国会掌握立法权，最高法院掌握司法权，三者相互制衡，彻底摒弃了传统官僚体系的集权特质；同时，美国推行严格的文官制度，以功绩制为核心选拔官员，避免了政党分肥制带来的腐败与低效。两次工业革命的浪潮，进一步推动了机关府衙的职能扩张，社会保障、公共卫生、环境保护等新兴职能应运而生，德国率先设立劳工部、社会保障局等机构，开启了现代福利国家的先河，机关府衙不再局限于维护统治，更承担起调节社会矛盾、保障民生福祉的重任。
在全球范围内，殖民地半殖民地的民族独立运动，推动了现代行政体系的多元化发展。广大亚非拉国家摆脱殖民统治后，纷纷结合本土国情，构建起兼具民族特色与现代性的机关府衙体系：印度独立后，效仿英国建立议会制共和政体，设总统为象征性元首，总理领导的内阁掌握行政实权，地方推行邦、县两级自治，同时保留了传统的村社治理模式；新加坡则以高效的科层制为核心，构建起廉洁、精干的行政体系，政府机关直接主导经济发展与城市治理，成为小国现代化的典范。社会主义阵营的国家，则以人民代表大会制度或苏维埃制度为基础，构建起议行合一的行政架构，机关府衙的权力来源于人民，服务于社会主义建设，苏联的苏维埃代表大会制度、中国的人民代表大会制度，均体现了这一核心特质，与资本主义国家的分权制衡模式形成鲜明对比。
两次世界大战与冷战的洗礼，更推动了机关府衙的国际化协作与职能转型。二战后，联合国、世界银行、国际货币基金组织等国际组织相继成立，成为协调各国机关府衙行动的重要平台；各国的外交、国防、外贸等机关职能不断强化，以适应全球化时代的国际竞争与合作。冷战结束后，全球化浪潮席卷世界，机关府衙的治理边界不断拓展，跨国治理、全球公共产品供给等新兴职能日益凸显；进入21世纪，数字技术的飞速发展，更是重塑了机关府衙的运作模式，电子政务、在线审批、大数据监管等新手段，让机关府衙的行政效率与透明度大幅提升，传统的“衙门”形象逐渐被高效、亲民的现代政府所取代。
从古代的官僚衙署到现代的行政机关，从集权统治的工具到公共服务的载体，机关府衙的演变轨迹，始终与人类社会的生产力发展、制度变革同频共振。在迈向未来的进程中，随着人工智能、大数据等新技术的深度融入，机关府衙的治理模式还将持续革新，但“服