刘元进退守建安，炀帝命令吐万绪进军讨伐，吐万绪认为士兵疲惫，请求休整军队等到明年春天，炀帝不高兴。鱼俱罗也认为贼军不是一年半载可以平定的，他的几个儿子在洛阳，暗中派家仆去迎接；炀帝发怒。有关部门迎合旨意，上奏吐万绪怯懦，鱼俱罗战败，鱼俱罗因此获罪被处斩，征召吐万绪到行宫，吐万绪忧愤，在途中去世。
炀帝改派江都郡丞王世充征发淮南兵数万人讨伐刘元进。王世充渡江，屡战屡胜，刘元进、朱燮在吴郡战败而死，其余部众有的投降有的溃散。王世充召集先投降的人在通玄寺瑞像前烧香发誓，约定投降的人不杀。溃散的人起初想入海为盗，听说后，十天半月之间，自首的人几乎全部归降，王世充将他们全部坑杀在黄亭涧，死者三万多人。从此残余党羽又重新聚集为盗，官军无法讨伐，直到隋朝灭亡。炀帝认为王世充有将帅之才，更加宠爱信任。
这一年，下诏为盗的人没收其家产。当时群盗所在之处到处都是，郡县官吏趁机各自专权作威作福，任意生杀予夺。
章丘人杜伏威与临济人辅公祏是生死之交，都逃亡成为群盗。杜伏威十六岁，每次出战都冲锋在前，撤退时殿后，因此他的徒众推举他为主帅。下邳人苗海潮也聚众为盗，杜伏威派辅公祏对他说：“如今我与您同样苦于隋朝的暴政，各自起义，力量分散势力薄弱，常常害怕被擒。如果合为一股，就足以与隋朝为敌了。您能做首领，我自当敬从，如果自认为不能，就应该来听我号令；不然就打一仗来决定胜负。”苗海潮恐惧，立即率领部众投降。杜伏威转战抢掠淮南，自称将军，江都留守派校尉宋颢讨伐他，杜伏威与他交战，假装不能取胜，将宋颢的部众引入芦苇丛中，趁上风纵火，宋颢的部众都被烧死。海陵贼帅赵破陈认为杜伏威兵少，轻视他，召他来合力；杜伏威让辅公祏严阵以待在外，自己与左右十人带着牛酒进去谒见，在座位上杀死赵破陈，兼并了他的部众。
隋炀帝大业十年（甲戌年，公元614年）
春季，二月，辛未日，下诏让百官商议讨伐高句丽，议论了几天，没有人敢说话。戊子日，下诏再次征调天下军队，分一百路同时进军。
丁酉日，扶风贼帅唐弼拥立李弘芝为天子，拥有部众十万人，自称唐王。
三月，壬子日，炀帝巡行到涿郡，士兵在路上逃亡的接连不断。癸亥日，到达临渝宫，举行祃祭（出兵时的祭祀）祭祀黄帝，斩杀叛逃的士兵用其血涂鼓，但逃亡仍然不止。
夏季，四月，榆林太守成纪人董纯与彭城贼帅张大虎在昌虑交战，大破贼军，斩首一万多级。
甲午日，车驾到达北平。
五月，庚申日，延安贼帅刘迦论自称皇王，建年号大世，拥有部众十万人，与稽胡互相呼应侵扰。下诏任命左骁卫大将军屈突通为关内讨捕大使，发兵攻击他，在上郡交战，斩杀刘迦论及其将士一万多级，俘虏男女数万人而回。
秋季，七月，癸丑日，车驾停驻在怀远镇。当时天下已经大乱，所征调的军队大多误期不到，高句丽也困顿疲惫。来护儿到达毕奢城，高句丽发兵迎战，来护儿击破敌军，准备进军平壤，高句丽王高元恐惧，甲子日，派使者乞求投降，囚送斛斯政。炀帝非常高兴，派使者持节召回来护儿。来护儿召集部众说：“大军三次出动，未能平定贼寇，这次回去不可能再来了。劳而无功，我私下感到羞耻。如今高句丽确实困顿，用这些军队攻击它，不久就可攻克。我想进军直接包围平壤，俘获高元，得胜献捷而归，不也很好吗！”于是上表请求进军，不肯奉诏返回。长吏崔君肃坚决劝阻，来护儿不同意，说：“贼军势力已经破败，单独交给我，足以办成此事。我在外统兵，事情应当专断，宁可俘获高元返回后受责罚，放弃这次成功的机会，我不能做！”崔君肃对众人说：“如果听从元帅违抗诏令，必定会被上奏，大家都应获罪。”众将领恐惧，都请求返回，来护儿才奉诏。
八月，己巳日，炀帝从怀远镇班师。邯郸贼帅杨公卿率领同党八千人抄袭车驾后军第八队，夺得飞黄上厩马四十二匹离去。冬季，十月，丁卯日，炀帝回到东都；己丑日，回到西京。将高句丽使者及斛斯政献祭于太庙；并征召高句丽王高元入朝，高元最终没有来。敕令将帅整顿行装，准备再次图谋出兵，最终没有实行。
当初，开皇末年，国家富庶强盛，朝野上下都认为应该征讨高句丽，只有刘炫认为不可，作《抚夷论》来讽喻此事，到这时，他的话开始应验了。
十一月，丙申日，在金光