己酉日，北魏开始设立郡学，设置博士、助教、生员，这是采纳了中书令高允、相州刺史李斤的建议。李斤是李崇的儿子。
明帝诛杀晋安王刘子勋等人后，对待世祖（刘骏）的其他儿子仍像往常一样。司徒刘休仁从寻阳返回后，对明帝说：“松滋侯（刘子房）兄弟还在，将来会对社稷不利，应当尽早处置。” 冬季十月乙卯日，松滋侯刘子房、永嘉王刘子仁、始安王刘子真、淮南王刘子孟、南平王刘子产、庐陵王刘子舆、刘子趋、刘子期、东平王刘子嗣、刘子悦都被赐死，镇北咨议参军路休之、司徒从事中郎路茂之、兖州刺史刘祗、中书舍人严龙也因牵连获罪被诛杀。世祖的二十八个儿子，至此全部被杀。刘祗是刘义欣的儿子。
刘勔围攻寿阳，垣闳进攻合肥，都没能攻克。刘勔为此担忧，召集将领们商议。马队主王广之说：“如果能得到将军您骑的马，我保证能平定合肥。” 幢主皇甫肃愤怒地说：“王广之竟敢抢夺将军的马，应当斩首！” 刘勔笑着说：“看他的意思，一定能立功。” 当即翻身下马，把马交给王广之。王广之前去进攻合肥，三天就攻克了；薛道标突围逃往淮西，投靠常珍奇，刘勔提拔王广之为军主。王广之对皇甫肃说：“如果将军当时听了你的话，怎么能平定叛贼！你不能赏识人才，才会这样！” 皇甫肃有学问，后来刘勔去世，他转而依附王广之，王广之把他推荐给齐世祖，任命他为东海太守。
沈灵宝从庐江领兵进攻晋熙，晋熙太守阎湛之弃城逃走。
徐州刺史薛安都、益州刺史萧惠开、梁州刺史柳元怙、兖州刺史毕众敬、豫章太守殷孚、汝南太守常珍奇，都派使者请求投降。明帝因南方已经平定，想在淮北显示军威，乙亥日，命令镇军将军张永、中领军沈攸之率领五万士兵迎接薛安都。蔡兴宗说：“薛安都归顺，确实不是假的，只需派一个使者带着书信去就行了。现在派重兵迎接，他一定会怀疑恐惧；甚至可能招引北方胡虏，造成更深的祸患。如果认为叛臣罪行严重，不能赦免，那之前已经赦免的人也太多了。况且薛安都在外占据大镇，靠近边境，地势险要、兵力强盛，难以攻克，从国家大计考虑，更应该安抚他；如果他叛投北魏，将会成为朝廷日夜担忧的隐患。” 明帝不听，对征北司马代理南徐州事务的萧道成说：“我现在趁机北上征讨，你觉得怎么样？” 萧道成回答：“薛安都狡猾有余，现在用兵力逼迫他，恐怕对国家不利。” 明帝说：“各路军队勇猛精锐，所向无敌！你别多说了！” 薛安都听说朝廷大军北上，十分恐惧，派使者向北魏投降，常珍奇也献出悬瓠投降北魏，两人都请求北魏派兵救援。
戊寅日，明帝立皇子刘昱为太子。
薛安都把儿子送到北魏做人质，北魏派镇东大将军代郡人尉元、镇东将军魏郡人孔伯恭等人率领一万骑兵从东路出发，救援彭城；派镇西大将军西河公拓跋石、都督荆、豫、南雍州诸军事张穷奇从西路出发，救援悬瓠。北魏任命薛安都为都督徐、雍等五州诸军事、镇南大将军、徐州刺史、河东公；任命常珍奇为平南将军、豫州刺史、河内公。
兖州刺史申纂假装向北魏投降，尉元接受了他的投降，却暗中防备。北魏军队抵达无盐，申纂关闭城门抵抗。
薛安都招引北魏军队时，毕众敬没有附和他，派使者向朝廷请求投降；明帝任命毕众敬为兖州刺史。毕众敬的儿子毕元宾在建康，此前因其他罪名被诛杀。毕众敬听说后，大怒，拔刀砍柱子说：“我白发苍苍，只有这一个儿子，却不能保全，我还活着干什么！” 十一月壬子日，北魏军队抵达瑕丘，毕众敬向北魏投降。尉元派部将先占据瑕丘城，毕众敬悔恨不已，几天不吃饭。尉元率军长驱直入，十二月己未日，驻扎在秺县。
西河公拓跋石抵达上蔡，常珍奇率领文武官员出城迎接。拓跋石想把军队驻扎在汝水北岸，再入城，中书博士郑羲说：“现在常珍奇虽然来迎接，但心意难测。不如直接进城，夺取城门钥匙，占据府库，控制他的亲信，这才是万全之策。” 拓跋石于是骑马入城，随后设置酒宴，嬉戏作乐。郑羲说：“看常珍奇的神色很不满，不能不加强防备。” 拓跋石于是整顿军队，设置防备。当天夜里，常珍奇派人烧毁府屋，想发动叛乱，因拓跋石有防备而失败。郑羲是郑豁的曾孙。
淮西七郡的百姓大多不愿归属北魏，联合起来向南逃奔。北魏派建安王陆馛安抚新归附的百姓；有被抓去当奴婢的士兵，陆馛全部赦免，新归附的百姓这才高兴。
乙丑日，朝廷下诏，因依附寻阳而被削夺官爵、禁锢的人，全部赦免，根据才能选拔任用。
刘勔围攻寿阳，从初春到冬末，对内攻城、对外防御，每战必胜，他因待人宽厚，深得将士之心。寻阳平定后，明帝让中书省起草诏书，晓谕殷琰投降，蔡兴宗说：“天下已经平定，这是殷琰反思过错的时候。陛下应当亲手写几行诏书，安慰引导他。现在直接让中书省起草诏书，他一定会怀疑是假的，不利于尽快平定寿阳。” 明帝不听。殷琰收到诏书，