庾亮认为苏峻在历阳，终究会成为祸乱，想下诏征召他入朝，征询司徒王导的意见。王导说：“苏峻猜忌阴险，必定不会奉诏前来，不如暂且包容他。”庾亮在朝堂上说：“苏峻狼子野心，最终必会作乱。现在征召他，即使他不服从命令，造成的祸乱也还浅；如果再拖延几年，就无法再控制他了，就像汉朝时的七国之乱一样。”朝臣没有人敢诘难，唯独光禄大夫卞壸争辩说：“苏峻拥有强大的军队，靠近京城，路程不到一天。一旦发生变乱，容易出现失误，应该深思熟虑！”庾亮没有听从。卞壸知道必败，写信给温峤说：“庾亮（元规）征召苏峻的主意已定，这是国家的大事。苏峻已经表现出狂悖之意，却去征召他，这反而会加速祸乱的到来，他必定会放肆地毒害朝廷。朝廷的威望虽然强盛，但不知道是否真能擒获他；王导（王公）也持同样看法。我和他争辩非常恳切，但不能拿他怎么样。本来让你出任外官是作为外援，而现在更遗憾你在外地，不能和你一起谏阻他，我或许只能跟随你了（意指无奈参与讨伐或一同承受后果）。”温峤也多次写信劝阻庾亮。满朝文武都认为不可行，庾亮全然不听。
苏峻听说后，派司马何仍去见庾亮说：“征讨贼寇在外任职，无论远近我都唯命是从，至于在朝内辅政，实在不是我能胜任的。”庾亮不答应，征召北中郎将郭默为后将军、兼领屯骑校尉，司徒右长史庾冰为吴国内史，都领兵防备苏峻。庾冰是庾亮的弟弟。于是朝廷下优礼的诏书，征召苏峻为大司农，加授散骑常侍，赐位特进，让他的弟弟苏逸代领部曲。苏峻上表说：“昔日明皇帝亲自握着我的手，命令我北伐胡寇。如今中原尚未平定，我怎敢贪图安逸！请求让我到青州边界的一个荒僻之郡任职，让我能施展鹰犬般的作用。”朝廷再次不同意。苏峻整装准备接受召见，但犹豫不决。参军任让对苏峻说：“将军请求驻守荒郡都不被允许，事情已到这一步，恐怕已无生路，不如拥兵自守。”阜陵令匡术也劝苏峻反叛，苏峻于是不接受诏命。
温峤听说后，立即想率领部队东下保卫建康，三吴地区（吴郡、吴兴、会稽）也想发起义兵；庾亮都不同意，却写信回复温峤说：“我担忧西陲（指陶侃）的威胁，超过了历阳的苏峻，请你切勿越过雷池一步。”（意为不要离开江州驻地）。朝廷派使者劝告苏峻，苏峻说：“朝廷说我要反叛，我岂能活命！我宁愿在山头遥望廷尉（司法官），也不能在廷尉那里遥望山头（意指宁愿占据山头造反，也不愿在朝廷司法部门待罪）。往日国家危如累卵，非我不能挽救；如今狡兔已死（指王敦被灭），猎犬就该烹杀了。我只有以死来报复那些出主意（征召我）的人了！”
苏峻知道祖约怨恨朝廷，于是派参军徐会去推崇祖约，请求共同讨伐庾亮。祖约大喜，他的侄子祖智、祖衍都劝他促成此事。谯国内史桓宣对祖智说：“本来是因为强胡未灭，将要合力讨伐他。使君（祖约）如果想称雄称霸，为何不帮助国家讨伐苏峻，那样威名自然树立。现在却要与苏峻一同反叛，这怎能长久呢！”祖智不听。桓宣去见祖约，请求见面，祖约知道他想劝谏，拒绝不见。桓宣于是与祖约断绝关系，不和他同流合污。十一月，祖约派哥哥的儿子沛国内史祖涣、女婿淮南太守许柳带兵与苏峻会合。祖逖的妻子是许柳的姐姐，竭力劝谏，许柳不听。朝廷下诏再次任命卞壸为尚书令、兼右卫将军，任命会稽内史王舒代理扬州刺史事务，吴兴太守虞潭督察三吴等诸郡军事。
尚书左丞孔坦、司徒司马丹杨人陶回向王导进言，请求“趁苏峻未到，急速截断阜陵，守住长江以西的当利等渡口，对方人少，我们人多，一战即可决定胜负。如果苏峻还未到来，可以进逼历阳城。现在不先前往，苏峻必定会先到达，苏峻一到则人心危惧惊骇，就难以与他交战了。这个机会不可失去。”王导认为正确，庾亮不听。十二月，辛亥日（初一），苏峻派部将韩晃、张健等人袭击攻陷了姑孰，夺取食盐粮米，庾亮这才后悔。
壬子日（初二），彭城王司马雄、章武王司马休背叛朝廷，投奔苏峻。司马雄是司马释的儿子。
庚申日（初十），京城戒严，授予庾亮符节，都督征讨诸