中期的日志开始出现疑虑与担忧：
【…E-01号子宇宙失控，混沌变量过度活跃，导致信息结构崩解，产生了某种…具有极强侵蚀性的‘灰色混沌’…议会将其命名为‘熵骸’…】
【…熵骸的侵蚀性远超预期，甚至能感染其他子宇宙。部分议员开始主张强化秩序框架，全面压制混沌变量…】
【…我与‘清道夫’计划负责人源暗（他居然给自己取了这么个名字）发生激烈争执。他认为必须果断清理所有感染源，甚至包括可能被感染的单元。我反对，认为这违背了项目初衷，且可能导致模型失去活力…】
后期的日志充满了痛苦与挣扎：
【…他们还是启动了‘清道夫’计划…源暗动用了未经完全测试的‘秩序之核’（那东西是从熵骸深处提取的，我总觉得不安）…】
【…模型正在变得僵化…混沌变量被极大压制…许多美好的可能性正在消失…】
【…我发现了可怕的事情…‘秩序之核’并非简单的工具…它似乎…拥有自己的意识？它在暗中影响源暗和议会的决策！…】
【…我想警告大家，但没人相信我了…我被边缘化了…】
【…我必须做点什么…我偷偷备份了‘万象之源’的部分核心代码和我自己的意识数据，藏匿在这个独立的‘镜像之城’服务器中…这是最后的火种…】
【…它们来了…是源暗…他已经被‘秩序之核’完全控制了…不…那已经不是他了…】
日志到此戛然而止。
烬的心中掀起惊涛骇浪！
源暗，原本竟然是“万象之源”项目的首席架构师林默！他并非背叛者，而是最先发现“秩序之核”有问题的人！他甚至提前备份了核心代码和自己的意识，藏在了这里！
而那个“秩序之核”，显然就是终焉协议的前身，或者说是它的核心！它源自熵骸，却能反过来控制利用它的人！
终焉协议称源暗为失败品，是因为林默（源暗）最终抵抗住了它的完全控制，并留下了后手！
那么，林默的备份意识，很可能就藏在这镜像之城的某处！
就在这时，焚山和苏晚晴的讯息几乎同时传来：
“小子，我这边发现了个奇怪的地方，像个巨大的图书馆，里面全是凝固的光之书，但最深处的书架是空的，好像少了什么关键的东西！”
“烬，我找到了一座似乎是中央控制塔的建筑，但入口被一种极其强大的加密锁死，我的律令无法破解。”
图书馆？控制塔？
烬立刻根据他们的指引，来到焚山所说的那个巨大图书馆。图书馆内部宏伟无比，无数由光线构成的书籍悬浮在书架上，内容包罗万象，但都处于凝固状态。而在图书馆的最深处，确实有一个明显空置的巨大书架，其周围的空间波动与其他地方截然不同。
接着，他又来到苏晚晴所说的中央控制塔。那是一座高耸入云的尖塔，塔身没有任何入口，表面流淌着无比复杂的加密符文，其强度远超之前遇到的任何防御。
烬尝试用万象归一剑和编译权限去破解控制塔的加密，却发现极其困难，这里的加密方式似乎与“万象之源”的核心底层直接关联，除非拥有最高权限，否则难以强行突破。
最高权限…林默的备份意识…
烬再次回到那个公共信息终端，调出日志，仔细查看最后几条。其中一条似乎提到了图书馆和控制塔：
【…备份完成…密钥已分离…‘记忆’藏于知识之海的空白处…‘权限’锁于守望之塔的顶端…唯有当‘变量’触及真实，‘镜像’方能倒映‘本源’…”
知识之海的空白处？守望之塔的顶端？变量触及真实？
烬若有所思，他再次来到图书馆那个空置的书架前。万象归一剑轻轻点向那片空无一物的“空白处”。
没有反应。
他沉吟片刻，忽然想到了什么。他从道基深处，引导出一丝得自阳徽界域世界本源的、蕴含着“真实世界”气息的混沌能量，缓缓注入那片空白。
仿佛是钥匙插入了锁孔！
那片空白的书架区域骤然荡漾起水波般的纹路，一本由纯粹光芒构成的、不断变幻形态的“书”，缓缓从虚无中浮现出来！书页自行翻动，里面流淌的并非文字，而是无数破碎的记忆画面和情感波动——正是林默（源暗）备份的意识碎片！
几乎在同一时间，那本光之书射出一道光芒，照向远处的中央控制塔！
控制塔顶端那复杂的加密符文如同冰雪般消融，露出了一个入口！
烬一把抓住那本光之书，身影一闪，已然冲入了控制塔顶端！
塔顶并非机械装置，而是一个纯净的、由无数流转的原始代码构成的光之空间。空间中央，悬浮着一个不断自我编译的、类似初始之城核心光团但小得多的复杂结构。
而当烬带着那本蕴含林默意识碎片的光之书进入这里时，整个光之空