司空、安州都督吴王李恪的母亲是隋炀帝的女儿。李恪文武双全，太宗常认为他像自己，曾想立他为太子，因长孙无忌坚决反对而作罢，因此李恪与长孙无忌结怨。李恪的名望一向很高，深受众人拥戴，长孙无忌十分忌恨他，想借此事诛杀李恪以断绝众人的期望。房遗爱得知后，便谎称与李恪同谋，希望能像纥干承基那样免死。
永徽四年（癸丑年，公元653年）
春季二月甲申日，高宗下诏将房遗爱、薛万彻、柴令武全部斩首，李元景、李恪、高阳公主、巴陵公主一同赐死。高宗私下对侍臣说：“荆王是我的叔父，吴王是我的兄长，我想赦免他们的死罪，可以吗？”兵部尚书崔敦礼认为不行，于是将他们处死。薛万彻临刑前大声喊道：“薛万彻是顶天立地的勇士，留下我为国家效命，难道不好吗？竟然因房遗爱而被杀！”吴王李恪临死前骂道：“长孙无忌擅自玩弄权术，陷害忠良，祖宗有灵，应当不久就会将他灭族！”
乙酉日，侍中兼太子詹事宇文节，特进、太常卿江夏王李道宗，左骁卫大将军驸马都尉执失思力，都因与房遗爱交往而获罪，流放岭南。宇文节与房遗爱关系亲密，房遗爱入狱后，宇文节多次为他说情。江夏王李道宗一向与长孙无忌、褚遂良不和，因此都被治罪。戊子日，将李恪的同母弟弟蜀王李愔废为庶人，安置在巴州；房遗直贬为春州铜陵尉，薛万彻的弟弟薛万备流放交州；停止房玄龄配享太宗庙庭的待遇。
任命开府仪同三司李积为司空。
起初，林邑王范头利去世，儿子真龙即位，大臣伽独杀死真龙，诛灭了范氏家族。伽独自立为王，国人不服，于是立范头利的女婿婆罗门为王。国人都思念范氏，又罢黜婆罗门，立范头利的女儿为王。女王无法治理国家，有个叫诸葛地的人，是范头利姑母的儿子，父亲被范头利杀害，他向南逃奔真腊。大臣可伦翁定派遣使者将他迎回并拥立为王，把女王嫁给她，民众才安定下来。夏季四月戊子日，诸葛地派遣使者入朝进贡。
秋季九月壬戌日，右仆射北平定公张行成去世。甲戌日，任命褚遂良为右仆射，仍担任同中书门下三品，兼管选拔官员之事。
冬季十月庚子日，高宗前往骊山温泉；乙巳日，返回宫中。
起初，睦州女子陈硕贞用妖言迷惑民众，与妹夫章叔胤起兵反叛，自称文佳皇帝，任命章叔胤为仆射。甲子日夜，章叔胤率领部众攻打桐庐，将其攻陷。陈硕贞撞钟焚香，率领两千士兵攻陷睦州及於潜，进攻歙州未能攻克。高宗下诏命扬州刺史房仁裕发兵讨伐。陈硕贞派遣部将童文宝率领四千人侵犯婺州，刺史崔义玄发兵抵抗。民间传言陈硕贞有神力，触犯她军队的人必遭灭族，士兵们十分恐惧。司功参军崔玄籍说：“起兵凭借正义尚且难以成功，何况依靠妖术虚妄之说，岂能长久！”崔义玄任命崔玄籍为前锋，亲自率领州兵随后跟进，到达下淮戍时，遭遇叛军，双方交战。身边的人用盾牌掩护崔义玄，崔义玄说：“刺史躲避箭矢，士兵们谁还肯拼死作战！”下令撤去盾牌。于是士兵们奋勇争先，叛军大败，斩首数千级。崔义玄允许残余叛军投降；进军到睦州境内，投降的叛军数以万计。十一月庚戌日，房仁裕的军队赶到，与崔义玄会合，擒获陈硕贞、章叔胤，将他们斩首，残余叛军全部平定。崔义玄因功被任命为御史大夫。
癸丑日，任命兵部尚书崔敦礼为侍中。
十二月庚子日，侍中蓚宪公高季辅去世。
这一年，西突厥乙毗咄陆可汗去世，他的儿子颉苾达度设号称真珠叶护，开始与沙钵罗可汗产生矛盾，与五弩失毕部落一同攻打沙钵罗可汗，将其击败，斩首一千多级。
永徽五年（甲寅年，公元654年）
春季正月壬戌日，羌人首领冻就归附唐朝，朝廷在其辖地设置剑州。
三月戊午日，高宗前往万年宫。
庚申日，追赠武德年间的功臣屈突通等十三人官职。
起初，王皇后没有儿子，萧淑妃受到宠爱，王皇后十分忌恨。高宗做太子时，入宫侍奉太宗，见到才人武氏便心生喜爱。太宗去世后，武氏随同众妃嫔前往感业寺削发为尼。太宗的忌日，高宗前往感业寺上香，见到武氏，武氏哭泣，高宗也为之落泪。王皇后得知后，暗中让武氏留发，劝高宗将她纳入后宫，想借此离间高宗对萧淑妃的宠爱。武氏聪慧机敏，善于权谋，刚入宫时，言辞谦卑、举止恭顺地侍奉王皇后。王皇后十分喜爱她，多次在高宗面前称赞她的美貌。不久，武氏深得高宗宠爱，被册封为昭仪，王皇后和萧淑妃的宠爱都逐渐衰减，两人于是一同诬告