太宗说：“为我养育百姓的，只有都督、刺史，我常常把他们的名字写在屏风上，坐卧都能看到，了解他们在任上的善恶事迹，都注在名字下面，以便升降官职。县令尤其亲近百姓，不能不慎重选择。”于是下令内外五品以上官员，各自举荐能担任县令的人，上报他们的名字。
太宗说：“近来有奴仆告发主人谋反的情况，这是有害的风气。谋反不可能独自做成，必定会与人同谋，还担心不会败露，何必让奴仆告发呢！从今以后，有奴仆告发主人的，都不要接受，还要将奴仆斩首。”
西突厥统叶护可汗被他的伯父杀死；伯父自立为可汗，即莫贺咄侯屈利俟毗可汗。国内百姓不服，弩矢毕部推举泥孰莫贺设为可汗，泥孰不肯接受。统叶护可汗的儿子咥力特勒为躲避莫贺咄的灾祸，逃到康居，泥孰迎接并拥立他为乙毗钵罗肆叶护可汗，与莫贺咄相互攻打，战事不断，两人都派遣使者前来请求和亲。太宗没有同意，说：“你们国家正处于内乱，君臣地位尚未稳定，怎么能谈论和亲呢！”并且谕令他们各自坚守自己的领地，不要再相互攻打。于是之前臣服于西突厥的西域各国及敕勒各部都反叛了。
突厥北部的各部落大多反叛颉利可汗，归顺薛延陀，共同推举薛延陀的俟斤夷男为可汗，夷男不敢接受。太宗正计划对付颉利可汗，派遣游击将军乔师望从小路携带册书任命夷男为真珠毗伽可汗，赐给他鼓和大旗。夷男大喜，派遣使者入朝进贡，在大漠的郁督军山下建立牙帐，东至靺鞨，西至西突厥，南接沙漠，北至俱伦水；回纥、拔野古、阿跌、同罗、仆骨、霫等部落都臣服于他。
贞观三年（己丑年，公元629年）
春季，正月，戊午日，太宗祭祀太庙；癸亥日，在东郊举行耕藉礼。
僧人法雅因散布妖言被处死。司空裴寂曾听过他的妖言，辛未日，裴寂因此获罪被免官，遣返回乡。裴寂请求留在京城，太宗责备他说：“论你的功劳，怎能达到今天的地位！不过是因为恩泽才位居群臣之首。武德年间，贿赂公开盛行，法度紊乱，都是你的缘故，只是因为你是旧臣，不忍心对你依法严惩。能够回去守护祖先坟墓，已经是很幸运的了！”裴寂于是返回蒲州。不久，裴寂又因狂人信行说他有天命，而裴寂没有上报，按罪当死；被流放静州。恰逢山羌作乱，有人说羌人劫持裴寂立他为主帅。太宗说：“裴寂本该处死，我饶了他，他必定不会这样做。”不久就听说裴寂率领家仆打败了乱贼。太宗思念他辅佐自己即位的功劳，征召他入朝，恰逢他去世。
二月，戊寅日，任命房玄龄为左仆射，杜如晦为右仆射，任命尚书右丞魏征为守秘书监，参与朝政。
三月，己酉日，太宗审查在押囚犯。有个叫刘恭的人，脖子上有“胜”字纹路，自称“应当胜过天下人”，因此被关押在狱中。太宗说：“如果上天要让他兴起，不是我能除掉的；如果没有天命，‘胜’字纹路又有什么用！”于是释放了他。
丁巳日，太宗对房玄龄、杜如晦说：“你们担任仆射，应当广泛寻求贤才，根据他们的才能授予官职，这是宰相的职责。近来听说你们忙于处理诉讼案件，日夜都没有空闲，怎能帮助我寻求贤才呢！”于是下令“尚书省的琐碎事务交给左右丞处理，只有大事需要上奏的，才告知仆射。”
房玄龄通晓政务，又有文才，日夜尽心操劳，唯恐有一件事处理不当；执法宽厚公平，听到别人的善行，就像自己拥有一样，不要求别人完美无缺，不用自己的长处苛求别人。他与杜如晦引荐提拔贤才，常常担心做得不够。朝廷的规章制度，都是他们二人制定的。太宗每次与房玄龄商议事情，必定会说：“非杜如晦不能决断。”等到杜如晦到来，最终还是采用房玄龄的计策。因为房玄龄善于谋划，杜如晦善于决断。二人配合默契，同心为国，所以唐代称赞贤相，首推房玄龄、杜如晦。房玄龄虽然受到太宗的宠信优待，有时因事被谴责，就会连续几天到朝堂上叩首请罪，恐惧得仿佛无地自容。
房玄龄监修国史，太宗对他说：“近来看到《汉书》记载了《子虚赋》《上林赋》，辞藻华丽却没有用处。那些上书议论政事，言辞道理恳切直率的，无论我是否采纳，都应当记载下来。”
夏季，四月，乙亥日，太上皇迁居弘义宫，改名为大安宫。太宗开始在太极殿处理朝政，对侍臣说：“中书省、门下省是关键部门，诏令敕令有不合适的，都应当议论辩驳。近来只看到顺从，听不到不同意见。如果只是传递文书，谁不能做，何必挑选贤才呢！”房玄龄等人都叩首谢罪。旧例：凡军国大事，中书舍人各自发表意见，联名签署，称为五花判事。中书侍郎、中书令审查，给事中、黄门侍郎驳回纠正。太宗开始申明旧制，从此很少有失误之事。
茌平人马周，在长安游历，住在中郎将常何家中。六月，壬午日，因干旱，太宗下