李孝恭领兵包围江陵，萧铣内外隔绝，向中书侍郎岑文本询问对策，岑文本劝萧铣投降。萧铣于是对群臣说：“上天不保佑梁朝，我们已经无法支撑下去了。如果一定要等到兵力耗尽才投降，百姓就会遭受灾难，怎么能因为我一个人，让百姓陷入水深火热之中呢！”乙巳日，萧铣用太牢（猪、牛、羊三牲）祭祀太庙，下令打开城门投降，守城的士兵都哭了。萧铣率领群臣穿着丧服、戴着布头巾，到军营门口投降，说：“该死的只有我萧铣一个人，百姓没有罪，希望不要杀掠他们。”李孝恭进入并占据江陵城，各位将领想大肆抢掠，岑文本劝李孝恭说：“江南的百姓，自从隋末以来，遭受虐政之苦，又加上群雄争斗，如今能存活下来的，都是经历过战乱的人，他们踮着脚尖、伸长脖子盼望贤明的君主，所以萧氏君臣、江陵父老才决心归顺，希望能得到喘息的机会。如今如果放纵士兵抢掠，让百姓失望，恐怕从这里往南，再也没有人愿意归顺朝廷了！”李孝恭称赞他说得对，立即下令禁止抢掠。各位将领又说：“梁朝的将帅中，那些与官军抵抗战死的，罪行很重，请没收他们的家产，赏赐给将士们。”李靖说：“王者的军队，应当先树立道义的名声。他们为自己的君主战死，是忠臣，怎么能把他们等同于叛逆，没收他们的家产呢！”于是江陵城中秩序安定，唐军秋毫无犯。南方的州县听说后，都望风归顺。萧铣投降几天后，赶来的援兵有十多万，听说江陵已经失守，都放下武器投降。
李孝恭把萧铣押送到长安，唐高祖斥责他的罪行。萧铣说：“隋朝失去了天下，天下人都来争夺。我没有天命，所以落到这个地步；如果认为我有罪，我无话可说，甘愿受死！”最终在闹市被斩首。朝廷下诏任命李孝恭为荆州总管；李靖为上柱国，赐爵永康县公，仍然让他安抚岭南地区，有权秉承皇帝旨意任命官员。
此前，萧铣派遣黄门侍郎、江陵人刘洎攻占岭南地区，夺取了五十多座城池，还没返回江陵，萧铣就战败了，刘洎献出所攻占的城池，前来投降；朝廷任命他为南康州都督府长史。
戊申日，徐圆朗的昌州治中刘善行献出须昌，前来投降。
庚戌日，朝廷下诏：陕东道大行台尚书省，从尚书令、仆射到郎中、主事，官阶品级都与京城的尚书省相同，但官员人数略少，山东行台及各总管府、各州都隶属于它。益州、襄州、山东、淮南、河北等道的行台，从尚书令、仆射以下，官阶各比京城的尚书省低一等，官员人数又进一步减少。行台尚书令有权秉承皇帝旨意任命官员。除了秦王、齐王府的官员外，各自设置左右六护军府，以及左右亲事帐内府。
闰十月乙卯日，唐高祖前往稷州；己未日，前往武功县的旧宅；壬戌日，在好畤打猎；乙丑日，在九嵕山打猎；丁卯日，在仲山打猎；戊辰日，在清水谷打猎，随后前往三原；辛未日，前往周氏陂；壬申日，返回长安。
十一月甲申日，唐高祖在圜丘祭祀上天。
杜伏威派他的将领王雄诞攻打李子通，李子通率领精兵守卫独松岭。王雄诞派遣副将陈当率领一千多人，占据高处险要之地逼近李子通，大量竖起旗帜，夜晚则在树上捆扎火把，布满山野沼泽。李子通感到害怕，烧毁营寨逃到杭州坚守；王雄诞追击他，又在杭州城下打败他。庚寅日，李子通走投无路，请求投降。杜伏威捉住李子通和他的左仆射乐伯通，押送到长安；唐高祖赦免了他们。
此前，汪华占据黟县、歙县，称王十多年。王雄诞回师攻打他，汪华在新安洞口抵抗，士兵装备精良。王雄诞在山谷中埋伏精兵，率领几千名瘦弱的士兵进攻汪华的阵地，刚一交战，就假装战败，逃回营寨；汪华率军进攻，没能攻克，恰逢天黑，领兵返回，这时埋伏的士兵已经占据了洞口，汪华无法进入，走投无路请求投降。
闻人遂安占据昆山，没有百姓归附，杜伏威派王雄诞攻打他。王雄诞认