皇泰主派人登上紫微观，问王世充：“你带兵来想干什么？”王世充下马谢罪说：“元文都、卢楚等人蓄意谋害我；请杀了元文都，我甘愿接受法律制裁。”段达于是命令将军黄桃树把元文都抓起来送给王世充。元文都回头对皇泰主说：“我今天早上死，陛下傍晚也会遭殃！”皇泰主痛哭着送他出去，元文都到兴教门后，像卢楚一样被乱刀砍死，他和卢楚的儿子们也都被杀死。段达又以皇泰主的名义下令开门，让王世充进城，王世充派人替换了所有宫中警卫，然后到乾阳殿拜见皇泰主。
皇泰主对王世充说：“你擅自杀人，却不向我奏报，这难道是臣子该做的吗！你想滥用武力，还敢对我动手吗！”王世充跪下磕头，流泪谢罪说：“我承蒙先帝提拔，粉身碎骨也难以报答。元文都等人心怀歹意，想召李密来危害国家，又因我反对他们，对我深怀疑忌；我是迫于求生，来不及奏报。如果我心怀不轨，辜负陛下，天地日月都能作证，让我全家灭绝，没有后代。”他说得声泪俱下，皇泰主以为他是真心，让他上殿，和他谈了很久，还带他一起去拜见皇太后；王世充披散头发发誓，说不敢有二心。于是皇泰主任命王世充为左仆射、总督内外诸军事。
到中午时，王世充捕获赵长文、郭文懿，把他们杀了。然后巡视全城，向百姓说明诛杀元文都、卢楚的原因。王世充从含嘉城搬到尚书省居住，逐渐结党营私，肆意作威作福。他任命哥哥王世恽为内史令，让王世恽住进皇宫，子弟都掌管兵权，把政务分成十个部分，全由他的党羽负责，势力震动朝廷内外，没人敢不顺从，皇泰主只能束手无策。
李密正准备入朝，走到温县时，听说元文都等人已死，便返回了金墉城。当时东都洛阳发生严重饥荒，私铸的钱币质量极差，大半掺杂着锡环，钱体细得像线，一斛米竟卖到八九万钱。
起初，李密曾跟随儒生徐文远求学。徐文远当时担任皇泰主的国子祭酒，一次亲自出城砍柴，被李密的军队抓获。李密让徐文远面向南坐下，以弟子之礼，自己面朝北拜见他。徐文远说：“老夫既然受了您的厚礼，怎敢不直言！不知将军的志向是想做伊尹、霍光那样扶持王室、挽救危局的贤臣，还是想做王莽、董卓那样趁乱夺权、谋取私利的逆臣？若是前者，老夫虽已年迈，仍愿为您效力；若是后者，那老夫对您就没什么用处了！”李密磕头说：“昨日我接受朝廷任命，担任上公之职，希望能尽我微薄之力，挽救国家危难，这是我李密的本心。”徐文远说：“将军是名臣之子，只是一时走错了路，若能及时回头，仍不失为忠义之臣。”
等到王世充杀了元文都等人，李密又向徐文远请教对策。徐文远说：“王世充也是我的学生，他为人残忍、心胸狭隘，如今趁势掌权，必定有篡权的野心，将军之前入朝的计划怕是行不通了。不打败王世充，绝不能入朝！”李密说：“起初我以为先生只是个不懂世事的儒生，如今您却能如此果断地决断大事，真是英明啊！”徐文远是徐孝嗣的玄孙。
七月十九日，唐高祖下诏，废除隋朝所有供皇帝游玩的离宫别馆。
七月二十七日，唐高祖派黄台公李瑗安抚山南地区。
七月二十八日，唐高祖任命隋朝原右武卫将军皇甫无逸为刑部尚书。
隋朝河间郡丞王琮坚守郡城，抵抗各路盗贼，窦建德攻打了一年多也没能攻克。听说隋炀帝被杀的消息后，王琮率领官吏百姓为隋炀帝举办丧事，守城的士兵都痛哭流涕。窦建德派使者前去吊唁，王琮通过使者请求投降，窦建德退兵扎营，准备酒菜等待他。王琮谈到隋朝灭亡时，俯身流泪，窦建德也为他落泪。窦建德的将领们说：“王琮长期抵抗我军，杀了我们很多人，现在是力竭才投降，请求把他煮死！”窦建德说：“王琮是忠臣，我正要奖赏他来勉励众人尽忠君主，怎么能杀他！过去我们在高鸡泊做强盗，或许可以随意杀人；如今要安抚百姓、平定天下，怎能杀害忠良呢！”于是他在军中宣布：“此前与王琮有怨恨，敢擅自动他的人，诛灭三族！”随后任命王琮为瀛州刺史。河北各郡县听说这件事后，纷纷归附窦建德。
在此之前，窦建德攻陷景城，抓获了户曹河东人张玄素，准备杀他。景城县一千多名百姓哭着请求代替张玄素去死，说：“户曹大人清廉谨慎，无人能比，大王杀了他，还怎么劝勉世人行善！”窦建德于是释放了张玄素，任命他为治书侍御史，张玄素坚决推辞。等到江都事变（隋炀帝被杀）后，窦建德又任命他为黄门侍郎，张玄素