六月初五，隋朝安阳令吕珉献出相州投降，唐高祖任命他为相州刺史。
六月初六，唐高祖将四位先祖的神主牌位供奉到祖庙。追尊高祖父瀛州府君李熙为宣简公；曾祖父司空李天赐为懿王；祖父景王李虎为景皇帝，庙号太祖，祖母为景烈皇后；父亲元王李昞为元皇帝，庙号世祖，母亲独孤氏为元贞皇后；追谥妃子窦氏为穆皇后。规定每年祭祀昊天上帝、皇地只、神州地只时，以景皇帝配享；祭祀感生帝、明堂时，以元皇帝配享。
六月初七，唐高祖立世子李建成为皇太子，赵公李世民为秦王，齐公李元吉为齐王；宗室黄瓜公李白驹为平原王，蜀公李孝基为永安王，柱国李道玄为淮阳王，长平公李叔良为长平王，郑公李神通为永康王，安吉公李神符为襄邑王，柱国李德良为新兴王，上柱国李博叉为陇西王，上柱国李奉慈为勃海王。李孝基、李叔良、李神符、李德良是唐高祖的堂弟；李博叉、李奉慈是唐高祖的侄子；李道玄是唐高祖堂兄的儿子。
六月初十，薛举侵犯泾州。唐高祖任命秦王李世民为元帅，率领八位总管的军队抵抗薛举。
唐高祖派太仆卿宇文明达招抚山东地区，任命永安王李孝基为陕州总管。当时天下尚未平定，凡是边防重要的州，都设置总管府，统领几个州的军队。
六月十二日，唐高祖尊奉隋恭帝为酅国公。下诏说：“近代以来，朝代更替，前代皇族亲属，没有不被诛杀的。兴亡的结果，哪里是人力能决定的！隋朝蔡王杨智积等皇族的子孙，都交给有关部门，根据才能录用。”
东都洛阳听说宇文化及向西进军，上下震惊恐惧。有个叫盖琮的人，上奏请求去劝说李密，让李密和东都联合抵抗宇文化及。元文都对卢楚等人说：“现在国仇未报，兵力又不足，若赦免李密的罪过，让他攻打宇文化及，两贼互相争斗，我们再趁机收拾残局。宇文化及被打败后，李密的军队也会疲惫；而且他的将士贪图我们的官职赏赐，容易离间，到时候连李密也能擒获。”卢楚等人都认为可行，于是任命盖琮为通直散骑常侍，带着敕书赐给李密。
六月二十三日，隋朝信都郡丞东莱人麴棱献出信都郡投降，唐高祖任命他为冀州刺史。
六月二十四日，万年县法曹武城人孙伏伽上奏，说：“隋朝因为不愿听自己的过错而失去天下。陛下从晋阳起兵，远近响应，不到一年就登基称帝；只知道得天下容易，却不知道隋朝失天下也不难。我认为陛下应改变隋朝的老路，务必让下面的意见能传上来。君主的言行，不能不谨慎。我见陛下今天即位，明天就有人献上鹞鹰雏鸟，这是年轻人玩的东西，哪里是圣主需要的！另外，杂耍、散乐都是亡国的靡靡之音。最近太常寺在民间借了五百多件妇女的衣裙，用来做歌妓的衣服，准备在五月五日到玄武门表演，这也不是能给子孙做榜样的事。凡这类事情，都应废除。善恶的习惯，会在朝夕间逐渐沾染，容易改变人的品行。皇太子、诸王身边的幕僚随从，应谨慎挑选；那些家风不和、为人无德无义、专好奢靡、沉迷声色游猎的人，都不能让他们亲近皇子。从古到今，骨肉分离、导致国破家亡的，没有不是因为身边人挑拨离间造成的。希望陛下谨慎对待。”唐高祖看了奏表非常高兴，下诏表扬孙伏伽，提拔他为治书侍御史，赏赐三百匹丝帛，还把奏表向各地颁布。
六月二十八日，内史令延安靖公窦威去世。唐高祖任命将作大匠窦抗兼任纳言，黄门侍郎陈叔达兼管纳言事务。
宇文化及把物资留在滑台，任命王轨为刑部尚书，让他驻守滑台，自己率领军队向北赶赴黎阳。李密的将领徐世积占据黎阳，畏惧宇文化及军队的锋芒，率军向西退守仓城。宇文化及渡过黄河，占据黎阳，分兵包围徐世积。李密率领两万步兵骑兵，在清淇扎营，和徐世积用烽火传递消息，深挖壕沟、高筑营垒，不与宇文化及交战。宇文化及每次攻打仓城，李密就率军从后方牵制他。
李密和宇文化及隔河对话，李密斥责他说：“你本是匈奴奴隶破野头的后代，父兄子弟都受隋朝恩惠，世代富贵，满朝大臣中没有第二家能比。君主失德，你不能以死劝谏，反而杀君叛逆，想篡夺皇位。你不学诸葛瞻的忠诚，却做霍禹那样的逆贼，天地不容，你还想逃到哪里去！若赶快归顺我，还能保全你的后代。”宇文化及沉默不语，低头很久，然后瞪大眼睛大声说：“我和你谈互相厮杀的事，何必说这些文绉绉的话！”李密对随从说：“宇文化及如此平庸愚蠢，还想当帝王，我只用手杖就能把他赶走！”宇文化及大力修造攻城器具，逼近仓城，徐世积在城外挖深沟坚守，宇文化及被壕沟阻拦，无法靠近城下。徐世积在壕沟中挖地道，出兵袭击宇文化及，宇文化及大败，烧毁了攻城器具。