太史令庾质是庾季才的儿子，他的儿子是齐王的下属。隋炀帝对庾质说：“你不能一心侍奉我，却让儿子侍奉齐王，为什么这样三心二意！”庾质回答：“我侍奉陛下，儿子侍奉齐王，实在是一心，不敢有二心。”隋炀帝还是发怒，把他贬为合水令。
乙卯日，隋炀帝下诏，因突厥启民可汗遵守隋朝教化，想改变游牧习俗，应在万寿戌修建城池房屋，他的帐篷、床褥等物品，务必做得优厚华丽。
秋天七月辛巳日，征发二十多万成年男子修筑长城，从榆谷向东延伸。
裴矩劝说铁勒部落，让他们攻打吐谷浑，铁勒大败吐谷浑。吐谷浑可汗伏允向东逃跑，进入西平境内，派使者请求投降求救。隋炀帝派安德王杨雄从浇河出兵，许公宇文述从西平出兵迎接伏允。宇文述抵达临羌城，吐谷浑害怕宇文述兵力强盛，不敢投降，率领部众向西逃遁。宇文述领兵追击，攻克曼头、赤水两座城池，斩杀三千多人，俘获吐谷浑王公以下官员二百人，俘虏男女四千多人后返回。伏允向南逃奔雪山，他原来的领地都空了，东西四千里、南北二千里的土地，都归隋朝所有。隋朝在这里设置州、县、镇、戍，把天下犯轻罪的人迁徙到这里居住。
八月辛酉日，隋炀帝亲自祭祀恒山，大赦天下。河北道的郡守全部聚集，裴矩招来的西域十几个国家也都来协助祭祀。
九月辛未日，征召天下擅长驯鹰的人全部聚集到东京，前来的有一万多人。
冬天十月乙卯日，颁布新的度量衡制度。
常骏等人抵达赤土国境内，赤土国王利富多塞派使者用三十艘船迎接他们，进献金链拴住常骏的船。常骏等人航海一百多天，进入赤土国境内一个多月后，才到达赤土国都城。赤土国王的住处和器物，极其珍贵华丽，接待使者的礼节也很隆重，还派儿子那邪迦跟随常骏入朝进贡。
隋炀帝任命右翊卫将军河东人薛世雄为玉门道行军大将，和突厥启民可汗联合出兵攻打伊吾。军队从玉门出发，启民可汗却没有来。薛世雄孤军穿越沙漠，伊吾人起初认为隋军不能到达，都没有防备；听说薛世雄的军队已经穿越沙漠，非常害怕，请求投降。薛世雄于是在汉朝旧伊吾城东边修筑新城，留下银青光禄大夫王威率领一千多名士兵驻守，然后返回。
大业五年（己巳年，公元609年）
春天正月丙子日，改东京为东都。
突厥启民可汗入朝，隋炀帝对他的礼遇和赏赐更加优厚。
癸未日，隋炀帝下诏在全国推行均田制。
戊子日，隋炀帝从东都向西返回西京。
己丑日，下令禁止民间拥有铁叉、搭钩、长刀等器具。
二月戊申日，隋炀帝的御驾抵达西京。
三月己巳日，隋炀帝向西巡视河右地区；乙亥日，亲临扶风旧宅。夏天四月癸亥日，从临津关出发，渡过黄河，抵达西平，部署军队，演练武艺，准备攻打吐谷浑。五月乙亥日，隋炀帝在拔延山大规模打猎，猎围周长二十里。庚辰日，进入长宁谷，翻越星岭；丙戌日，抵达浩亹川。因桥梁还没建成，隋炀帝斩杀都水使者黄亘和九名监工官员，几天后桥梁建成，才继续前进。
吐谷浑可汗伏允率领部众据守覆袁川，隋炀帝分别命令内史元寿向南驻守金山，兵部尚书段文振向北驻守雪山，太仆卿杨义臣向东驻守琵琶峡，将军张寿向西驻守泥岭，四面围困伏允。伏允率领几十名骑兵突围逃跑，派他的名王谎称是伏允，据守车我真山。壬辰日，隋炀帝下诏命令右屯卫大将军张定和前去抓捕。张定和轻视敌军人数少，不穿铠甲，挺身登山，被吐谷浑伏兵射死；张定和的副将柳武建攻打吐谷浑，打败了敌军。甲午日，吐谷浑仙头王走投无路，率领男女十多万人前来投降。
六月丁酉日，隋炀帝派左光禄大夫梁默等人追击伏允，梁默的军队战败，梁默被伏允杀死。卫尉卿刘权从伊吾道出兵，攻打吐谷浑，抵达青海，俘获一千多人，乘胜追击，抵达伏俟城。
辛丑日，隋炀帝对给事郎蔡征说：“自古以来天子就有巡狩的礼仪；但江南的那些皇帝，大多涂抹脂粉，坐在深宫里，不与百姓见面，这是什么道理？”蔡征回答：“这就是他们不能长久统治的原因。”丙午日，隋炀帝抵达张掖。
隋炀帝准备西巡时，命令裴矩劝说高昌王麹伯雅和伊吾吐屯设等人，用厚利引诱他们，召他们入朝。壬子日，隋炀帝抵达燕支山，麹伯雅、吐屯设等人以及西域二十七国的使者都在道路左边拜见，隋炀帝让他们都佩戴金玉饰品，身穿锦缎丝绸，焚香奏乐，歌舞喧哗。隋炀帝又命令武威、张掖的男女百姓盛装观看，衣服车马不鲜艳的，由郡县官员督促改进。车马人群拥挤不堪，连绵几十里，以此显示中原的强盛。吐屯设献