南陈太子陈胤，生性聪慧，喜好文学，但常有过失；太子詹事袁宪恳切劝谏，他却不听。当时沈皇后不受宠爱，而后主身边的侍从多次往来东宫，太子也多次派人到沈皇后住处，后主怀疑他们心怀不满，对太子十分厌恶。张贵妃、孔贵嫔日夜编造沈皇后和太子的坏话，孔范等人又在宫外加以附和。后主想立张贵妃的儿子始安王陈深为太子，曾私下里和大臣谈论此事。吏部尚书蔡征顺从后主的心意，称赞这个想法，袁宪却神色严厉地反驳：“皇太子是国家的储君，天下百姓都归心于他，你是什么人，竟敢轻易谈论废立太子！”后主最终还是听从了蔡征的建议。这年夏天五月庚子日，后主废黜太子陈胤，改封他为吴兴王，立扬州刺史始安王陈深为太子。蔡征是蔡景历的儿子。陈深也聪慧机敏，有志向操守，举止端庄，即使是身边的侍从，也从未见他有过喜怒之色。后主听说袁宪曾劝谏过陈胤，当天就任命袁宪为尚书仆射。
后主对待沈皇后一向冷淡，张贵妃独掌后宫大权，沈皇后却淡然处之，从未有过嫉妒怨恨，日常生活节俭，衣服没有锦绣装饰，只以阅读图书史籍和佛经为事，还多次上书劝谏后主。后主想废黜沈皇后，改立张贵妃，恰逢国家灭亡，此事才没办成。
这年冬天十月己亥日，后主立皇子陈蕃为吴郡王。
己未日，隋朝在寿春设置淮南行省，任命晋王杨广为行省尚书令。
后主派遣兼散骑常侍王琬、兼通直散骑常侍许善心出使隋朝，隋人把他们留在客馆中。王琬等人多次请求返回南陈，都没被允许。
甲子日，隋朝因要出兵伐陈，在太庙举行祭祀仪式，任命晋王杨广、秦王杨俊、清河公杨素为行军元帅。杨广率军从六合出兵，杨俊从襄阳出兵，杨素从永安出兵，荆州刺史刘仁恩从江陵出兵，蕲州刺史王世积从蕲春出兵，庐州总管韩擒虎从庐江出兵，吴州总管贺若弼从广陵出兵，青州总管弘农人燕荣从东海出兵。此次出兵共设总管九十人，兵力五十一万八千人，全部受晋王杨广调度。军队东接沧海，西抵巴蜀，旌旗战船，连绵数千里。隋朝任命左仆射高颎为晋王元帅府长史，右仆射王韶为司马，军中事务都由他们决断；两人处理军队调度、物资分配等事，毫无阻碍。
十一月丁卯日，隋文帝亲自为将士们饯行；乙亥日，隋文帝抵达定城，检阅军队并誓师。
丙子日，后主立皇弟陈叔荣为新昌王，陈叔匡为太原王。
隋文帝前往河东；十二月庚子日，返回长安。突厥莫何可汗向西攻打邻国，中箭身亡。突厥国人拥立雍虞闾为可汗，号称颉伽施多那都蓝可汗。
隋军进逼长江，高颎对行台吏部郎中薛道衡说：“如今大举出兵，江东一定能攻克吗？”薛道衡回答：“一定能攻克。我曾听说郭璞有句话：‘江东分治称王三百年，之后会重新和中原统一。’如今三百年的期限即将到来，这是第一条理由。皇上恭敬节俭、勤勉治国，陈叔宝却荒淫骄奢，这是第二条理由。国家的安危取决于任用的人，陈朝任命江总为宰相，江总只知饮酒赋诗，还提拔小人施文庆，把政务托付给他；萧摩诃、任蛮奴担任大将，不过是匹夫之勇罢了，这是第三条理由。我们有道义且国力强大，他们无德行且国力弱小，估计他们的兵力不过十万，西起巫峡，东至沧海，兵力分散则势力单薄，兵力集中则顾此失彼，这是第四条理由。我军席卷江东的势头，是毫无疑问的。”高颎高兴地说：“听你分析成败的道理，我豁然开朗。我原本只期望你有才华学识，没想到你的谋略竟如此高明。”
秦王杨俊统领各路军队驻守汉口，负责上游的军事调度。后主下诏任命散骑常侍周罗睺为都督，统领巴峡一带沿江的军事，以抵御隋军。
杨素率领水军顺江东下，经过三峡，抵达流头滩。南陈将军戚昕率领一百多艘青龙战船，驻守狼尾滩。狼尾滩地势险要陡峭，隋军对此感到担忧。杨素说：“胜负的关键，就在这一战。如果白天乘船而下，他们会看清我们的虚实，而且滩流湍急，船只难以控制，我们就会失去有利时机；不如趁夜突袭。”于是杨素亲自率领几千艘黄龙战船，士兵口中衔枚（防止出声）