王敬则率领一万名装备精良的士兵渡过浙江。张瑰派三千士兵在松江抵抗王敬则，士兵们听到王敬则军队的鼓声，一下子就溃散逃跑了，张瑰放弃吴郡，逃到民间躲藏。王敬则以老将军的身份起兵，百姓们扛着竹竿、拿着锄头，跟随他的人有十几万；到达晋陵时，南沙人范修化杀了县令公上延孙，响应王敬则。王敬则到达武进陵口，痛哭着祭拜完高帝、武帝的陵墓后继续前进。乌程人丘仲孚担任曲阿县令，王敬则的前锋突然到达，丘仲孚对官吏百姓说：“叛军虽然乘胜而来，气势锐利，但都是乌合之众，容易离散。现在如果收集船只，挖开长冈埭，放干沟渠里的水来阻断他们的道路，能拖延几天，朝廷的军队必定会赶到，这样一来，大事就能成功了。”王敬则的军队到达时，恰逢沟渠干涸，果然被困住无法前进。
五月壬午日，明帝下诏派前军司马左兴盛、后军将军崔恭祖、辅国将军刘山阳、龙骧将军、马军主胡松在曲阿长冈修筑营垒；任命右仆射沈文季为持节都督，驻守湖头，防备京口方向的道路。崔恭祖是崔慧景的族人。王敬则猛攻左兴盛、刘山阳的两座营垒，朝廷军队抵挡不住，想撤退，但包围无法解开，士兵们只能拼死作战。胡松率领骑兵从叛军后方突袭，叛军里的平民没有武器，都惊慌溃散。王敬则的军队大败，他想找马再上阵，却找不到，崔恭祖用矛把他刺倒在地，左兴盛的部下袁文旷斩了王敬则。乙酉日，王敬则的首级被送到建康。当时明帝病情已经很重，王敬则仓促从东边起兵，朝廷上下震惊恐惧。太子萧宝卷让人爬上屋顶，看到征虏亭失火，以为是王敬则来了，急忙收拾行装想逃跑。王敬则听说后，高兴地说：“檀公三十六策，走为上策，我看你们父子也只能逃跑了！”这是当时人讥讽檀道济躲避北魏的话。王敬则起兵时，声势很大，却只几天就失败了。
朝廷军队讨伐王敬则的党羽时，晋陵地区因依附王敬则而应被处死的百姓很多。太守王瞻上奏说：“愚昧的百姓容易被煽动，不值得用严厉的刑法穷追猛治。”明帝批准了他的奏请，因此保全性命的百姓数以万计。王瞻是王弘之的侄孙。
明帝奖赏谢杋的功劳，升任他为尚书吏部郎。谢杋上奏表三次推辞，明帝不允许。中书省的官员疑惑谢杋的官职还没到需要推辞的级别，国子祭酒沈约说：“近代以来，小官推辞的情况很少，已经成了常规。谢吏部这次被破格提拔，他的推辞另有深意。推辞体现的是人情态度，难道和官职大小有关吗！”谢杋的妻子常常随身藏着刀，想杀谢杋，谢杋不敢和她见面。
秋季七月，北魏彭城王元勰上奏，请求把自己一年的封国赋税、官职俸禄和亲友抚恤费用，全部资助军国开支。孝文帝下诏说：“牺牲自身利益保全国家，这是深远的大义。你的官职俸禄就暂停发放，封国赋税和亲友抚恤费用允许你留下三分之一自用。”壬午日，孝文帝又下诏，削减皇后私人府库财物的一半，六宫妃嫔、五服以内亲属的供养费用也减半，军中人员的供给减少三分之一，用节省下来的财物赏赐军队。
癸卯日，南齐任命太子中庶子萧衍为雍州刺史。
己酉日，明帝在正福殿去世。遗诏规定：“徐孝嗣可重申之前的任命（指开府仪同三司）。沈文季可任左仆射，江祏可任右仆射，江祀可任侍中，刘暄可任卫尉。军政事务可委托太尉陈显达；朝廷内外各种事务，无论大小都委托徐孝嗣、萧遥光、萧坦之、江祏处理，重大事务要和沈文季、江祀、刘暄共同商议。心腹重任可委托刘悛、萧惠休、崔慧景。”
明帝性格猜忌多疑，很少外出，始终没举行过郊天祭典。他还深信巫师，每次外出前都要占卜吉凶，想往东去却对外说往西，想往南去却对外说往北。起初生病时，他把消息封锁得很严，依然处理朝政。过了很久，他下令在台省的文书档案中寻找“白鱼”（一种祥瑞之物，也可入药）治病，外界才知道他生病。
太子萧宝卷即位。
八月辛亥日，北魏太子元恪从洛阳前往悬瓠朝见孝文帝。
壬子日，南齐奉朝请邓学献出齐兴郡，向北魏投降。
孝文帝入侵南齐时，派人征调高车部落的士兵。高车人害怕远征，拥戴袁纥树者为首领，一起向北叛乱。孝文帝派征北将军宇文福讨伐，宇文福大败而回，被革去官职。孝文帝又任命平北将军江阳王元继为都督北讨诸军事，率军讨伐高车，规定从怀朔镇以东的地区都受元继指挥，同时让他代理镇守平城。元继是元熙的曾孙。
八月，南齐将明帝安葬在兴安陵，庙