冬天十月，乌桓的独孤部、鲜卑的没弈干各自率领几万人投降前秦，秦王苻坚把他们安置在塞南。阳平公苻融劝谏说：“戎狄这些人表面是人，内心却像野兽一样，不懂仁义。他们低头投降，实际上是贪图土地的利益，不是因为感激恩德；他们不敢侵犯边境，是害怕我们的兵力，不是因为感恩。现在把他们安置在塞内，和百姓杂居，他们窥探到郡县的虚实，一定会成为边境的祸患，不如把他们迁到塞外，以防患于未然。”苻坚听从了他的建议。
十一月，朝廷封桓温为南郡公，桓温的弟弟桓冲为丰城县公，儿子桓济为临贺县公。
前燕太宰慕容恪想任命李绩为右仆射，前燕君主慕容暐不同意。慕容恪多次请求，慕容暐说：“国家各种事务，都委托给叔父您，只有李绩这一个人，我请求自己做主。”于是把李绩外放为章武太守，李绩最终因忧虑而死。
升平五年（辛酉年，公元361年）
春天正月戊戌日，大赦天下。
刘卫辰掳掠了前秦边境五十多个百姓，把他们当作奴婢献给前秦，秦王苻坚责备他，让他归还掳掠的人。刘卫辰因此背叛了前秦，专门依附于代国。
东安简伯郗昙去世。二月，任命东阳太守范汪为都督徐、兖、青、冀、幽五州诸军事，兼任徐、兖二州刺史。
平阳人带领全郡投降前燕。前燕任命建威将军段刚为太守，派督护韩苞率领军队一起镇守平阳。
方士丁进受到前燕君主慕容儁的宠信，他想讨好太宰慕容恪，劝说慕容恪杀掉太傅慕容评，慕容恪非常生气，上奏请求逮捕丁进并把他斩首。
高昌去世，前燕河内太守吕护吞并了他的部众，派使者来向东晋投降，朝廷任命吕护为冀州刺史。吕护想带领晋兵袭击邺城。三月，前燕太宰慕容恪率领五万士兵，冠军将军皇甫真率领一万士兵，一起讨伐吕护。前燕的军队到达野王，吕护环城固守。护军将军傅颜请求加紧攻打，以节省大量的耗费。慕容恪说：“这老贼经历的变故多了，看他的防守情况，不容易一下子攻下来。不久前攻打黎阳，死伤了很多精锐士兵，最终也没能攻下来，还让自己陷入困境受辱。吕护城内没有积蓄，外面没有救援，我们深挖壕沟、高筑营垒，坚守阵地，让士兵休息，安抚百姓，离间他的同党，这样我们不劳累而贼人的形势会一天比一天窘迫。不超过一百天，一定能拿下野王，何必牺牲那么多士兵来追求眼前的功劳呢！”于是修筑了长长的包围圈来围困吕护。
夏天四月，桓温让他的弟弟、黄门郎桓豁担任都督沔中七郡诸军事，兼任新野、义城二郡太守，率军攻取了许昌，打败了前燕将领慕容尘。
前凉骠骑大将军宋混病得很重，张玄靓和他的祖母马氏去探望，说：“将军万一有不幸，我们孤儿寡母可依靠谁呢！想让你的儿子宋林宗继承你的位置，行吗？”宋混说：“我儿子林宗还年幼弱小，担当不了大任。殿下要是不嫌弃我家，我弟弟宋澄处理政事比我强，只是怕他性格偏于儒雅迟缓，处理紧急事务不太合适。殿下要是能鞭策鼓励他去做，还是可以的。”宋混告诫宋澄和儿子们：“我们家受国家大恩，应当以死相报，不要仗着权势地位傲慢待人。”他又召见朝廷大臣，都告诫他们要忠贞为国。等宋混去世后，连路上的行人都为他流泪。张玄靓任命宋澄为领军将军，让他辅佐朝政。
五月丁巳日，东晋穆帝去世，没有留下子嗣。皇太后下令说：“琅邪王司马丕，是中兴以来的正统，论道义声望和亲情地位，没人能比得上他，就让他继承皇位吧！”于是文武百官准备好皇帝的车驾，去琅邪王府迎接他。庚申日，司马丕即位，大赦天下。壬戌日，改封东海王司马弈为琅邪王。秋天七月戊午日，把穆帝安葬在永平陵，庙号孝宗。
前燕军队围困野王好几个月，吕护派他的将领张兴出城交战，傅颜反击斩杀了张兴，城中形势一天比一天危急。皇甫真告诫部下将领说：“吕护到了穷途末路，肯定会突围逃跑，一定会选择防守薄弱的地方冲出去。我们部下的士兵大多瘦弱，武器盔甲也不精良，应该严密防备。”于是加紧打造了望和防御用的器械，还亲自检查夜间巡逻的人。吕护的粮食吃完了，果然在夜里率领全部精锐士兵冲向皇甫真的防区，想要突围，却没能成功。