张骏整治军队，想趁虚袭击长安。理曹郎中索询劝谏说：“刘曜虽然东征，但他儿子刘胤驻守长安，不好对付。就算小有所获，他要是放弃东方的谋划，回来和我们较量，灾祸的发生就难以估量了。”张骏于是放弃了这个想法。苏峻的心腹路永、匡术、贾宁听说祖约战败，担心事情不能成功，劝苏峻杀尽司徒王导等大臣，另立自己的心腹。苏峻向来敬重王导，没答应。路永等人便对苏峻产生了二心，王导派参军袁耽暗中引诱路永归顺。九月戊申日，王导带着两个儿子和路永一起逃奔白石垒。袁耽是袁涣的曾孙。
陶侃、温峤等人和苏峻长时间对峙，没能决出胜负。苏峻分派将领向东、西方向攻掠，大多取得胜利，人心惶惶。逃到西边军队中的朝廷官员都说：“苏峻狡猾且有胆识决断，他的部下勇猛，所向无敌。如果从上天要讨伐有罪之人来说，苏峻最终会灭亡；但就眼下局势而言，不容易除掉他。”温峤生气地说：“你们这些人胆小懦弱，竟然还称赞叛贼！”后来多次作战不胜，温峤也害怕了。
温峤的军队粮草耗尽，向陶侃借粮。陶侃生气地说：“您之前说不愁没有良将和军粮，只希望我来做主帅。现在多次作战都败北，良将在哪里呢！荆州与胡、蜀两敌相接，要防备意外；如果再没有粮食，我就想西归，再想别的好办法。慢慢再来消灭叛贼，也不算晚。”温峤说：“军队取胜在于团结，这是古代好的教训。光武帝在昆阳取胜，曹操在官渡攻克敌军，都是以少胜多，凭借道义的缘故。苏峻、祖约是小人，凶逆滔天，还怕消灭不了他们吗！苏峻因屡次取胜而骄傲，自认为无人能敌，现在向他挑战，可一鼓作气擒获他。怎能放弃即将成功的功业，考虑后退的计策呢！况且天子被幽禁逼迫，国家危急，这正是天下臣子效命的时候。我等和您都受国家恩惠，事情如果成功，君臣就共享福运；如果失败，就该粉身碎骨来告慰先帝。现在的形势，道义上不容退缩，就像骑在虎背上，怎能中途下来呢！您如果违背众人独自返回，人心必定沮丧；使众人沮丧而坏了大事，义旗就会转而指向您了。”毛宝对温峤说：“我能留住陶公。”于是去劝陶侃说：“您本来应该镇守芜湖，作为南北的援军，之前已经东下，按形势不能返回。而且军政方面有进无退，不只是为了整齐三军，显示必死的决心，也因为后退没有依靠，最终会灭亡。过去杜弢不是不强大，您最终消灭了他，怎么到了苏峻这里，就偏偏不能打败呢！叛贼也怕死，不是都勇猛，您可以试着给我兵力，让我上岸切断叛贼的物资粮草。如果我不能立功，然后您再离开，人心也不会有遗憾了。”陶侃同意了，加授毛宝为督护，派他前去。竟陵太守李阳劝陶侃说：“现在大事如果不成功，您即使有粮食，怎么能吃得上呢！”陶侃于是分五万石米给温峤的军队。毛宝烧毁了苏峻在句容、湖孰的物资储备，苏峻的军队缺乏粮食，陶侃便留下不走了。
张健、韩晃等人猛攻大业垒，堡垒中缺水，人们喝粪水。郭默害怕了，暗中突围出去，留下士兵防守。郗鉴在京口，士兵们听说后都变了脸色。参军曹纳说：“大业垒是京口的屏障，一旦失守，叛贼就会直接打来，难以抵挡。请返回广陵，等待日后再举事。”郗鉴召集僚属，斥责曹纳说：“我受先帝临终托付的重任，就算死在九泉之下，也不足以报答。现在强敌在附近，众人心中危急，你是心腹助手，却滋生异端，将怎么率领义兵，安定三军呢！”郗鉴要杀他，过了很久才释放。
陶侃准备救援大业垒，长史殷羡说：“我们的士兵不熟悉步战，救援大业垒如果不能取胜，大事就完了。不如猛攻石头城，那么大业垒之围自然会解除。”陶侃听从了他的建议。殷羡是殷融的哥哥。
庚午日，陶侃统领水军奔向石头城。庾亮、温峤、赵胤率领一万步兵从白石垒向南进发，想挑战。苏峻率领八千人迎战，派他儿子苏硕和部将匡孝分兵先逼近赵胤的军队，打败了赵胤。苏峻正在慰劳将士，乘着醉意望见赵胤逃跑，说：“匡孝能打败敌人，我难道不如他吗！”于是丢下自己的部队，和几个骑兵向北冲阵，没能冲进去，准备退回白木陂，马被绊倒，陶侃的部将彭世、李千等人用矛刺他，苏峻坠马，被斩首分尸，尸骨被焚烧，三军都欢呼万岁。剩下的人溃不成军。苏峻的司马任让等人共同拥立苏峻的弟弟苏逸为主，关闭城门自守。温峤于是设立行台，向远近发布公告，凡是原来的官吏中二千石以下的，都让他们到行台来，于是前来的人很多。韩晃听说苏峻死了，率军赶赴石头城。管商、弘徽攻打庱亭垒，督护李闳、轻车长史滕含打败了他们。滕含是滕修的孙子。管商逃到庾亮那里投降，