接着，李傕等人围住宣平门，要求王允出来，还大声质问：“太师董卓犯了什么罪？”王允走投无路，只好下楼面对叛军。第二天，朝廷宣布大赦天下，封李傕为扬武将军，郭汜为扬烈将军，樊稠等人也都升为中郎将。李傕还把司隶校尉黄琬抓起来，关进监狱后杀害。
之前，王允让同乡宋翼担任左冯翊，王宏担任右扶风。李傕等人想杀王允，又怕这两人在外起兵捣乱，就先下诏召他们回长安。王宏派人对宋翼说：“郭汜、李傕因为我们俩在外，才没敢轻易动王允。现在一旦应召回去，明天就得被灭族，你说该怎么办？”宋翼却胆小怕事：“虽然祸福难料，但皇命不可违！”王宏着急地说：“关东义军声势浩大，本来就想讨伐董卓。现在董卓已死，他的余党很容易对付。我们要是起兵讨伐李傕，和关东联军里应外合，说不定还能转祸为福！”可宋翼就是不听，王宏没办法独自行动，只好一起应召回长安。
甲子日，李傕把王允、宋翼、王宏全都抓起来杀了，王允的妻子儿女也没能幸免。王宏临死前大骂：“宋翼这个书呆子，根本不懂大事！”李傕把王允的尸体扔在集市上示众，没人敢去收尸，只有王允的老部下、平陵县令赵戬，毅然辞官，冒险收殓并埋葬了他。当初，王允独揽诛杀董卓的功劳，士孙瑞虽然出了力，却不邀功请赏，因此躲过了这场灾难。
历史学家司马光评价说：《易经》里说“勤劳谦逊的君子，最终会有好结果”，士孙瑞有功却不炫耀，才保住了性命，这难道不是明智之举吗？
李傕等人掌权后，想封贾诩为左冯翊，还要给他封侯。贾诩推辞说：“我不过是出了个保命的主意，哪有什么功劳！”坚决不肯接受。李傕又想让他当尚书仆射，贾诩还是拒绝：“尚书仆射是百官的表率，大家都很看重这个职位。我一向没什么大名声，担当不起。”最后，贾诩只当了个尚书。
吕布从武关逃到南阳，投奔袁术。袁术一开始对他还不错，可吕布仗着自己杀董卓有功，纵容手下士兵烧杀抢掠。袁术很头疼，吕布心里也不安，又跑到河内投奔张杨。李傕等人悬赏捉拿吕布，吕布没办法，又逃去投靠袁绍。
丙子日，朝廷任命前将军赵谦为司徒。七月庚子日，太傅马日磾开始处理尚书事务；八月，车骑将军皇甫嵩升任太尉。朝廷还派马日磾、太仆赵岐拿着符节，去安抚关东的各路诸侯。
九月，李傕被封为车骑将军，兼任司隶校尉，还拥有符节；郭汜为后将军，樊稠为右将军，张济为骠骑将军，全都封了侯。李傕、郭汜、樊稠留在长安把持朝政，张济则带兵驻扎在弘农。不久后，司徒赵谦被罢官，司空淳于嘉升任司徒，光禄大夫杨彪担任司空，开始处理尚书事务。
当初董卓进关中时，曾拉拢韩遂、马腾一起对付关东联军。韩遂、马腾带着军队来到长安，正好赶上董卓被杀。李傕掌权后，封韩遂为镇西将军，让他回金城；封马腾为征西将军，让他驻扎在郿县。
十月，荆州刺史刘表派人给朝廷进贡。朝廷封刘表为镇南将军、荆州牧，还封他为成武侯。十二月，太尉皇甫嵩被免职，光禄大夫周忠担任太尉，参与处理尚书事务。
曹操追击黄巾军到济北，黄巾军全部投降。曹操收编了三十多万青壮士兵，还有一百多万男女百姓。他挑选其中的精锐，组建了一支军队，叫做“青州兵”。
曹操任命陈留的毛玠为治中从事，毛玠向曹操建议：“如今天下大乱，皇上四处流亡，百姓流离失所，田地荒芜，官府没有储备，人心惶惶，这样下去不是长久之计。打仗要师出有名才能取胜，守住基业需要雄厚的财力。您应该迎接天子，用朝廷的名义命令那些不听话的诸侯；同时鼓励百姓耕种，储备军用物资。这样，称霸天下的大业就有希望了！”曹操觉得很有道理，就派人去见河内太守张杨，想借道去长安和朝廷取得联系。张杨一开始不同意，定陶的董昭劝他：“袁绍和曹操现在虽然表面上是盟友，但早晚会翻脸。曹操现在虽然实力不强，却是天下少有的英雄，您应该和他交好。现在正好有这个机会，不仅要借道让他的使者去长安，还应该上表推荐他。如果事情办成了，你们的交情就深厚了。”
张杨听了董昭的话，不仅同意借道，还上表推荐曹操。董昭还以曹操的名义给李傕、郭汜等人写信，根据他们的地位和态度，分别表达了敬意。李傕、郭汜见到曹操的使者，还以为关东诸侯想自立天子，觉得曹操派使者来，肯定没安好心，打算把使者扣留下来。黄门侍郎钟繇劝他们：“现在天下英雄纷纷起兵，各自假传圣旨，独断专行。只有曹操一心忠于朝廷，如果拒绝他的好意，以后谁还愿意为朝廷效力呢？”李傕、郭汜这才改变态度，厚待曹操的使者。钟繇，就是三国时期书法家钟皓的曾孙。
徐州刺史陶谦联合各地郡守、国相，一起