御史中丞樊准看到各郡国连年遭受水旱灾害，百姓大多饥寒交迫，就向朝廷上书：“请下令让太官、尚方、考功、上林苑等部门，切实削减不必要的开支；让太傅、太尉、司徒、司空、大将军这五府精简京城的官吏和服役的人。受灾的郡县，百姓生活困苦，只靠救济恐怕解决不了问题，有时候名义上是在救济，实际上百姓根本得不到实惠。可以按照征和元年的做法，派使者拿着符节去安抚百姓，把特别贫困的人迁到荆州、扬州那些收成好的郡县。现在虽然有西部屯守的战事，但应该先解决东部地区百姓的燃眉之急。”太后采纳了他的建议，把公有土地都分给贫民，还提拔樊准和议郎吕仓为守光禄大夫。二月乙丑日，派樊准去冀州、吕仓去兖州，负责开仓放粮、救济百姓，流亡的百姓这才得以休养生息。
这年夏天发生旱灾。五月丙寅日，皇太后亲自到洛阳官署和若卢监狱，审查囚犯的案卷。洛阳有个囚犯，其实没杀人，却在严刑拷打下被迫认罪。他瘦弱疲惫，被人抬着来见太后，因为害怕官吏，不敢说出真相。太后准备离开时，他抬头好像想说什么。太后察觉有异，就把他叫回来询问，终于了解到他被冤枉的实情，当场就把洛阳县令抓起来治罪。太后回宫的路上，大雨倾盆而下。
六月，京城及四十个郡国遭遇大水、大风和冰雹灾害。秋天七月，太白星（金星）运行至北斗星座区域。闰月辛丑日，广川王刘常保去世，因无子嗣，封国被废除。
癸未日，蜀郡边境外族羌人献地归附汉朝。
冬季，邓骘派任尚与从事中郎司马钧率各郡军队，在平襄与滇零等数万羌人交战，汉军大败，八千余人战死。羌人势力自此强盛，朝廷无法遏制。湟中地区粮价暴涨至每石万钱，百姓死亡无数，而粮草转运困难加剧。原左校令庞参因犯法在若卢服役，派儿子庞俊上书建议：“长途运粮损耗巨大，不如让邓骘暂时撤军，留任尚督率凉州军民迁居三辅，恢复生产积蓄力量，待羌人疲惫时再出奇制胜。”奏书呈上时，恰逢樊准举荐庞参，太后立即将庞参从囚徒中提拔为谒者，派他西去督导三辅各军屯驻。十一月辛酉日，朝廷命邓骘回师，留任尚屯驻汉阳指挥各军，同时派使者迎接邓骘并拜为大将军。邓骘抵达京城时，大鸿胪亲自迎接，中常侍到郊外慰劳，王侯公主以下官员沿途等候，恩宠显赫震动朝野。
滇零自称天子，在北地招集武都参狼羌、上郡与西河各羌族部落，切断陇道，劫掠三辅地区，又南下益州杀死汉中太守董炳。梁慬接诏本应屯驻金城，听闻羌人进攻三辅，立即率兵驰援，在武功、美阳一带连战连捷，羌人逐渐退散。十二月，广汉塞外参狼羌投降。这一年，十二个郡国发生地震。
永初三年（公元109年）
正月庚子日，安帝行成年加冠礼，大赦天下。朝廷派骑都尉任仁督率各郡屯兵救援三辅，但多次战败。当煎、勒姐羌攻占破羌县，钟羌攻占临洮县，生擒陇西南部都尉。
三月，京城发生严重饥荒，出现人相食惨剧。壬辰日，公卿大臣到皇宫请罪，安帝下诏要求“务必想办法恢复阴阳调和，弥补朕的不足”。
壬寅日，司徒鲁恭被罢免。他两度担任三公，选拔的高才之士中有数十人官至列卿、郡守，但门下老臣有的未被举荐，甚至心生怨恨。鲁恭听闻后说：“学问不精是我担忧的，学生们不是可以通过乡里举荐入仕吗！”始终不解释，也不借助议论平息争议。他教导学生时必深究疑难，学业有成后才让其离去，学生们都说：“鲁公亲自指导论辩，求学不可虚度。”
四月丙寅日，大鸿胪夏勤被任命为司徒。三公因国库不足，奏请允许吏民缴纳钱粮换取关内侯、虎贲郎等官职，品级不同纳粮数额有别。
甲申日，清河愍王刘虎威去世无子嗣。五月丙申日，封乐安王刘宠之子刘延平为清河王，继承清河孝王刘庆一脉。
六月，渔阳郡乌桓人与右北平郡胡人千余人侵扰代郡、上谷郡。汉人韩琮随南匈奴单于入朝，返回后欺骗单于说“关东遭水灾，百姓饿死殆尽，可以进攻”，单于信以为真发动反叛。
秋季七月，海贼张伯路等劫掠沿海九郡，杀死郡守、县令。朝廷派侍御史庞雄督率州郡兵征讨，张伯路等暂时投降，不久又聚集作乱。
九月，雁门郡乌桓率众王无何允与鲜卑首领丘伦，联合南匈奴骨都侯率七千骑兵侵扰五原郡，与太守战于高渠谷，汉军大败。南匈奴单于在美稷围困中郎将耿种。冬季十一月，朝廷派大司农何熙代理车骑将军事，中郎将庞雄为副将，率五营及边郡兵两万余人，又令辽东太守耿夔率鲜卑及诸郡兵共同进击，同时命梁慬代理度辽将军事。庞雄、耿夔击败南匈奴薁韐日逐王。
十二月辛酉日，九个郡国发