十一月，大司徒伏湛被免职，刘秀任命侯霸为大司徒。侯霸早就听说太原闵仲叔很有名，就征召他来任职。闵仲叔到任后，侯霸却从不和他讨论政事，只是让他做些杂事。闵仲叔很失望，抱怨道：“当初接到您的征召，我既高兴又惶恐。如今见到您，高兴和惶恐都没了。如果您觉得我不值得请教，就不该征召我；征召了却不重用，这是错失人才啊！”于是，闵仲叔递交辞呈，离职而去。
当初，五原人李兴、随昱，朔方人田飒，代郡人石鲔、闵堪各自起兵，自称将军。匈奴单于派使者与他们和亲，想让卢芳回到汉朝故地称帝。李兴等人带兵到匈奴单于王庭迎接卢芳。十二月，他们一起进入边塞，把都城设在九原县，占领了五原、朔方、云中、定襄、雁门五个郡，还任命了太守、县令，与匈奴军队勾结，不断侵扰北方边境，让当地百姓苦不堪言。
冯异治理关中地区，一晃三年过去，上林苑又变得繁荣起来。有人向刘秀上书，说：“冯异在关中权势太大，百姓都拥护他，还称他为咸阳王。”刘秀把奏章拿给冯异看，冯异十分惶恐，连忙上书谢罪。刘秀下诏回复说：“将军和国家之间，从大义上说是君臣，从恩情上看就像父子，有什么可猜忌的，你怎么还会心生恐惧呢！”
隗嚣自命不凡，喜欢耍弄小聪明，常常把自己比作周文王，还和手下将领们商议，想要称王。郑兴劝谏道：“当年周文王占据天下三分之二的土地，依然向殷商称臣；周武王时，八百诸侯不约而同前来会合，他还是按兵不动，等待时机；高祖刘邦征战多年，一直到最后还以沛公的名号统率军队。如今将军您虽然品德高尚，但没有周朝王室那样的福运；虽然威风凛凛、足智多谋，但也没有高祖那样的赫赫战功。在这种情况下，要是做这种不合时宜的事，只会招来祸患，恐怕不行吧！”隗嚣这才打消了称王的念头。后来，隗嚣又大量设置官职，想借此抬高自己的地位。郑兴又劝说道：“中郎将、太中大夫、使持节这些官职，都是只有帝王才能设置的，不是臣子可以擅自决定的。这样做对实际没有好处，还会损害名声，不符合尊重君主的本意。”隗嚣心里不太乐意，但也只好作罢。
当时，关中的将领们多次上书，陈述攻打蜀地的有利条件，刘秀把这些奏章拿给隗嚣看，想让他出兵攻打蜀地，以此来检验他的诚意。隗嚣却上书说，三辅地区兵力薄弱，卢芳又在边境捣乱，现在不适合谋划攻打蜀地。刘秀这才明白，隗嚣是想脚踏两只船，不想让天下统一，于是渐渐降低了对他的礼遇，开始端正君臣之间的礼仪。刘秀因为隗嚣和马援、来歙关系很好，多次派来歙、马援与隗嚣往来，劝说他入朝拜见，还许诺封给他高官厚爵。隗嚣多次派使者前来，言辞十分谦卑，说自己没有什么功劳和德行，要等天下平定后，就归隐乡间。刘秀又派来歙劝说隗嚣，让他送儿子到洛阳做人质。隗嚣听说刘永、彭宠都已经被消灭，只好派长子隗恂跟随来歙来到洛阳。刘秀任命隗恂为胡骑校尉，封镌羌侯。郑兴想借着送隗恂的机会，请求回去安葬父母，隗嚣不同意，只是给他换了住处，还增加了他的俸禄和礼遇。郑兴去见隗嚣，说：“我父母还没下葬，希望能回家料理后事。如果您用增加俸禄、更换住所的方式，让我继续留下，这就等于拿我的亲人当诱饵，太无礼了！您这样做又有什么意义呢？我希望留下妻子儿女，独自回去安葬父母，将军您又何必猜疑呢？”隗嚣这才允许他带着妻子儿女一起东归。马援也带着家属，跟随隗恂回到洛阳。因为他带来的门客太多，就请求在洛阳上林苑中屯田，刘秀同意了他的请求。
隗嚣的将领王元觉得天下局势变幻莫测，胜负难料，不想让隗嚣一门心思归附刘秀，就劝他说：“以前更始帝在长安定都，四方响应，大家都以为天下要太平了，结果眨眼间就土崩瓦解，将军当时差点连安身之处都没有。现在南边有公孙述（字子阳），北边有卢芳（字文伯），江湖海滨一带，称王称霸的人还有十几个。您要是听那些儒生的话，放弃自己现有的地盘，跑到别人的地盘上去求安稳，这简直是重蹈覆辙。咱们天水这个地方完好富足，兵马强壮，我愿意为大王守住函谷关，就像用一颗小泥丸堵住关口一样，这可是千载难逢的好机会。要是不这么干，咱们就养精蓄锐，凭借险要地势坚守，拖得久了，等待天下局势变化。就算成不了帝王，当个一方霸主也不错。总之，鱼不能离开水，神龙没了势力，就跟蚯蚓没什么两样！”隗嚣心里觉得王元说得有道理，虽然把儿子送到洛阳做人质，但还是仗着自己占据险要之地，想在当地独揽大权。
申屠刚劝说道：“我听说，人们拥护的人，上天也会帮助；人们背弃的人，上天也会抛弃。当今皇上能得天下，那是上天的福佑，不是人力能决定的。现在皇上的诏书一封接一封，把国家托付给您，想和您同甘共苦。普通百姓之间交往，尚且有终身信守承诺的，何况是皇上呢！您到底在怕什么、图什么，要这么一直犹豫不决？万一突然发生变故，对上您辜负了忠孝