但张凤翼提出“暂缓辽东、专剿流寇”的奏疏，被东林党扣上“弃地卖国”罪名，阉党则借宣府失守攻击其“畏敌如虎”。其“海运辽饷”方案被御史吴执御斥为“蹈汪直故智”，与嘉靖朝倭寇之乱强行类比。

    同时粮饷匮乏导致军队战斗力丧失，《明史纪事本末》描述：“宣大军士无斗志，遇敌辄溃，甚至为清军向导。”这种纪律崩溃在《明季北略》中被归因于“朝廷失信于士卒，士卒亦失信于朝廷”。

    面对军事溃败，张凤翼严重心理崩溃，每日服食大黄导致腹泻不止，《明史纪事本末》描述其临终前“犹据案批答军书，手颤不能成字”。

    正如《明史》所言：“凤翼非无才略，然处末世，受制于积弊，虽欲有为而不可得。”