一千五百年时间转瞬即逝，五行混沌平衡网络运转良好，多元宇宙实现了前所未有的能量共生：双宇的机械族与元素宇宙的金属族、同源宇宙的融合机械族合作，研发出“万源混沌机械城”，城市能自主调节五行、混沌、双宇能量，适应任何多元宇宙的环境；精灵族与元素宇宙的木系族、暗能宇宙的生命族培育的五行混沌生命树，覆盖了六个多元宇宙的所有核心星球，树木释放的万源平衡能量让星球生态达到完美平衡；
混沌学院培养出数十万掌握多元能量平衡的人才，其中数千人成为“万源衡道者”，分布在各个多元宇宙中，担任平衡管理员；万源巡查队成功接触了四个新的“同源平衡宇宙”（光系宇宙、暗系宇宙、空间宇宙、时间宇宙），通过五行混沌平衡体系的分享，将它们纳入多元平衡网络；五行本源遗迹也被成功探索，遗迹中的五行混沌晶核融入多元平衡网络，让网络的能量传输速度提升十倍，能量转化效率达到百分之百。
年轻领袖们已成为万源平衡议会的核心支柱：夏玥与陈玥、元素圣女木灵、暗能圣女暗曦组成“万源圣女团”，负责沟通所有多元宇宙的衡道者和守灵者，她们的五行混沌平衡权杖能在跨宇宙危机时启动万源平衡网络的应急模式，召唤所有多元宇宙的平衡能量支援；苏晴作为生命五行混沌长老，掌管多元宇宙的生命能量与五行混沌平衡，她培育的五行生命果让数百万多元宇宙的成员获得了五行混沌平衡体质，彻底解决了文明因能量失衡导致的衰退问题；
林辰作为机械五行混沌长老，负责跨宇宙机械装备的研发与维护，他构建的“万源机械防御网络”覆盖了十个多元宇宙，能自主识别并净化任何失衡能量冲击；雷昊与元素火雷长老、暗能雷电长老组成“万源雷电军团”，军团配备五行混沌雷电装备，是多元联盟的核心战斗力量，曾三次击退跨宇宙失衡执念体的入侵；寒雪与元素冰水长老、暗能冰系长老构建“万源冰水平衡阵”，阵体能冻结并净化大规模失衡能量，保护了多个多元宇宙的核心星球；
吴磊作为时序五行混沌长老，通过万源时序体质，提前预判了八次跨宇宙连锁失衡危机，其中最严重的一次“光暗能量碰撞危机”，他提前三年发出预警，让巡查队有足够时间部署防御，避免了两个多元宇宙的毁灭；周瑶作为灵界五行混沌长老，构建了“万源灵界通讯网络”，网络能连接十个多元宇宙，实现实时跨宇宙通讯、能量共享和危机预警，是多元联盟的“神经中枢”。
这一日，万源平衡监测站突然发出“万源失衡预警”：多元宇宙群的中心——“本源混沌原点”出现能量波动，原点周围的“混沌壁垒”开始破裂，破裂处涌出“本源失衡能量”——紫黑色的能量中夹杂着所有多元宇宙的失衡因子，正在快速侵蚀周围的五个多元宇宙。监测影像显示，原点中央浮现出“本源执念领主”——形态如巨型的混沌漩涡，身体由所有多元宇宙的失衡能量融合而成，眉心嵌着“本源失衡晶核”，核外缠绕着无数紊乱的多元法则链，口中能喷出“本源毁灭射线”，射线所过之处，多元宇宙的空间壁垒直接崩解。
“本源混沌原点是所有多元宇宙的诞生地，是本源混沌的残留核心！”元素衡道者看着影像，眼中闪过凝重，“本源执念领主是所有多元宇宙失衡能量的集合体，是混沌分裂时产生的‘终极失衡’，古籍记载，它会在多元宇宙能量达到峰值时苏醒，试图将所有多元宇宙吞噬，回归混沌失衡状态。”陈默眼中闪过坚定：“召集所有多元宇宙的精英！启动万源联合防御！前往本源混沌原点！”
十天后，“万源舰队”在本源混沌原点集结——由十个多元宇宙的所有战斗飞船组成，舰队中央是“万源混沌母舰”，母舰的核心是五行混沌晶核与双宇混沌核心的融合体，能释放“万源平衡能量”。舰队的防御体系由所有多元宇宙的守灵者、衡道者共同构建：夏玥的万源圣女团激活“万源平衡光罩”，光罩由十个多元宇宙的核心能量融合而成，表面刻满五行、混沌、暗能、光系等所有平衡纹；
苏晴的生命小队培育“万源生命树阵”，数千棵五行混沌生命树在母舰周围形成能量网，根系连接所有飞船的能量核心，释放万源生命平衡能量；林辰的机械小队操控“万源混沌机械守卫”，百万台守卫组成巨型机械阵，守卫的核心是万源平衡晶，能吸收本源失衡能量，转化为万源平衡能量；雷昊的雷电军团与光系、暗系、空间、时间等宇宙的战斗军团组成“万源攻击阵”，各军团释放对应的多元能量，与混沌能量融合，形成“万源攻击流”；
吴磊的时序小队操控“万源时序能量”，减缓本源执念领主的能量爆发速度，同时将“领主的平衡轨迹”传递给所有小队；周瑶的灵界小队构建“万源灵界通道网络”，将十个多元宇宙的灵体能量汇聚到母舰，形成“万源灵体能量流”，补充舰队的能量消耗；陈默与陈宇、元素衡道者、暗能衡道者等所有多元衡道者组成“万源衡道阵”，站在母舰顶端，手中的万源混沌刃同时释放能量，形成“万源衡道光柱”。