但领主突然引爆部分时序能量，身体分裂成“过去”“现在”“未来”三个分身，过去分身释放“时序倒流射线”，击中雷昊的雷链，让雷链变回未激活的状态；未来分身释放“时序加速射线”，击中冬凌的图腾锁，让锁的能量快速耗尽；现在分身则朝着陈默和逆冲来，眉心的失衡核释放出黑色的悖论能量，试图阻止他们激活锚点。“逆！用反平衡能量牵制现在分身！”陈默将时序界域共生钥插入锚点凹槽，逆的虚影紫色能量暴涨，与现在分身的悖论能量碰撞，形成“反平衡-悖论能量漩涡”，暂时困住分身。锚点被激活的瞬间，时序枢纽爆发璀璨的灰白七彩光芒，一道巨型光柱直冲时序本源层，照亮了“本源时序渊”的位置——渊底是一个直径万米的巨型时钟状结构，时钟中心的“本源时序核”散发着纯净的时序界域能量，核周围缠绕着黑色的悖论能量。
“本源时序核被悖论能量污染了！必须净化它才能彻底稳定时序！”陈默飞向本源时序渊，逆的虚影摆脱现在分身后紧随其后。领主的三个分身融合成巨型躯体，追着两人冲向渊底，口中喷出“时序界域毁灭风暴”，风暴中既有时序加速的焚天火焰，也有时序减速的冰封寒气，还有界域紊乱的空间碎片。“联盟全员！能量共享！”陈默通过共生网络发出号召，多宇宙精英的能量同时涌入他体内，界域平衡核的能量暴涨，九色能量化作“万宇平衡光盾”，挡住了毁灭风暴的攻击。
“逆！用反平衡能量引导悖论能量暴露核心！”陈默将时序界域共生能量注入本源时序核，逆的虚影化作紫色能量，钻进核周围的悖论能量中，强行将悖论能量的核心牵引出来。悖论核心暴露的瞬间，陈默将万宇平衡能量注入其中，与悖论能量形成“时序界域共生双螺旋”，两种能量开始激烈碰撞，核的表面不断出现裂痕。“守住！让时序能量的‘流动’与界域能量的‘稳定’包裹悖论能量！”陈默的身体被悖论能量侵蚀，意识开始出现“过去与未来的重叠”——他既看到自己在地球的少年时光，也看到自己千年后白发苍苍守护平衡碑的景象，但他握紧掌心的共生印记，锚定“现在”的意识，将所有能量注入双螺旋。
双螺旋逐渐稳定，悖论能量被时序界域共生能量彻底净化，转化为“时序界域平衡能量”，本源时序核恢复纯净，散发出照亮整个时序夹缝的灰白七彩光芒。领主感受到本源核的变化，发出震天的嘶吼，三个分身的能量开始消散，最终化作黑色的悖论粒子，被本源核吸收净化。当最后一丝悖论能量被净化时，时序夹缝的时序畸变彻底消失，共生通道的波纹状畸变恢复正常，时序枢纽周围的时序失衡兽也随之崩解，转化为时序界域平衡能量，融入“时序界域共生带”——带内的时序能量与界域能量完美融合，形成“万宇时序锚点网”，将所有多宇宙共生通道连接成稳定的整体。
陈默返回共生舰时，众人都露出了疲惫却欣慰的笑容——吴磊的时序后遗症彻底消失，手臂上的皱纹完全褪去；苏晴正用植物能量滋养共生带的能量晶体，让其生长速度与时序同步；李锐和机械族的工匠们正在检修共生舰的时序引擎，准备将其升级为“时序界域双引擎”；周瑶则通过灵界通讯网络，与各个宇宙的文明确认时序稳定情况。“时序法则与界域法则稳定融合后，多宇宙的基础框架彻底稳固了。”逆的虚影看着共生通道壁上稳定的七彩光芒，紫色能量中多了一丝灰白的时序能量，“而且时序界域平衡能量能强化界域平衡核，现在核内的能量，足以应对多宇宙层面的任何危机。”
众人在时序枢纽休息七日，期间发现了枢纽底层的“远古时序族-界域族联合遗迹”——遗迹内的石壁上刻满了两族的文明记载：时序族与界域族在多宇宙诞生之初就达成共生契约，时序族构建时间之轴，界域族搭建空间之基，共同创造了多宇宙的共生框架；后来两族遭遇“本源裂隙危机”，多宇宙之外的“本源虚无”开始侵蚀，本源虚无没有时间和空间属性，能直接吞噬所有法则能量；两族为了阻止危机，将自身的本源能量注入时序枢纽和界域枢纽，构建了“万宇本源防御带”，暂时挡住了本源虚无的侵蚀，两族的族人则化作能量，融入枢纽的核心，只留下试炼传承和危机预警。遗迹中还存放着“时序界域共生战甲”和“万宇平衡刃”，战甲能同时抵御时序畸变和界域同化，战刃能释放时序界域融合攻击，威力足以撼动多宇宙的空间结构。
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苏晴、李锐、周瑶、吴磊在遗迹中获得了意外收获——苏晴找到一枚“时序生命符”，符文与她的植物本源融合后，能培育出“时序永恒藤”，藤蔓能在任何时序环境中生长，还能修复时序紊乱的生物；李锐找到一台“时序界域修复核心”，核心与他的机械能量融合后，能构建“时序界域修复军团”