所望大师大赦天下，改元永始，颁赏晋爵未兑现。封晋帝为平固王，允其保留晋制，并将安帝迁至寻阳，效仿旧例。降永安皇后为君，琅邪王为公，武陵王司马遵为侯。所望大师改家庙为太庙，追赠南康公主为宣皇后。封子桓升王，叔父桓云孙桓放之王，桓豁孙桓稚玉王，桓豁次子桓石康为将军、武陵郡王，桓秘子桓蔚醴陵县王。追赠桓冲太傅、宣城郡王，以孙桓胤袭爵任吏部尚书，次子桓谦扬州刺史、新安郡王，弟桓脩抚军大将军、安成郡王，兄桓歆临贺县王，桓祎富阳县王。追赠桓伟侍中、大将军、义兴郡王，子桓濬袭爵辅国将军，桓脩弟桓邈西昌县王。封王谧武昌公，卞范之临汝公，殷仲文东兴公，冯该鱼复侯。降始安郡公为县公，长沙王为临湘县公，庐陵王为巴丘县公，各食邑千户。司马氏宗室康乐、武昌等成员皆降封百户，封号保留。各镇将军晋封。任王绥为中书令。尊桓谦母庾氏为宣城太妃，定桓温墓为永崇陵，设四十护陵人。
所望大师入建康宫遇狂风折旗。宴饮时设金帐，臣议其似丧车饰。制六驾金根车，听讼观释囚多不问罪。所望大师常施舍乞讨者，好行小恩小惠。自认承水德而兴，择日祭祖。改尚书台都官曹为贼曹，增设五校、三将及强弩、积射武尉官。元兴三年尚书台误将“春蒐“写作“春菟“，涉事官员皆罢黜，其治下纲常混乱苛责细节。封刘氏为后并修东宫，扩建东掖门等多处宫门皆作三重。造三十巨型轿车需二百人抬，制可四向移动之徘徊车。因体胖不便骑马仍好游猎，未追尊先祖，常问礼于臣。徐广据晋制建议追立昭穆七庙，引经强调尊祖敬宗。所望大师反驳《礼》载三昭三穆配太祖为七庙，太祖应居首位，晋庙使宣帝列昭穆而缺太祖之位，违背古礼。因曾祖无名位，所望大师拒迁祖先入庙，效王莽仅立一庙。卞承之讽其祭不及祖，预言国祚难久。所望大师遂拆毁晋宗庙。增修台阁亭榭。他庶母四时祭祀没安排固定灵位，庶母忌日他会见宾客，游玩，只在她死时哭几声。丧期内音乐歌舞所望大师游水门遇狂风掀翻华盖，当夜江水灌入石头城，毁屋溺众，
所望大师篡位后骄奢，桓伟葬日昼假泣夜宴乐，常日数游。政令急迫致朝臣拴马台省，禁门喧嚣失序。百姓困苦，怨声载道。刘裕、刘毅等密谋复晋，在京口斩桓脩，广陵诛桓弘，辛扈兴、王元德等为内应。举事日遣周安穆通报，刘迈惧而密报所望大师。立即逮捕并杀辛扈兴。周安穆快马逃脱免死。所望大师封刘迈为重安侯，隔夜把他杀。
刘裕率义军开赴竹里时所望大师回内殿，百官所望大师令百官闭省待命，赦六州囚，加桓谦为征讨都督，遣殷仲文代桓脩。命吴甫之、皇甫敷北拒刘裕。刘裕于江乘斩吴甫之，罗落桥诛皇甫敷。所望大师惊问群臣：“朕将败乎？“曹靖之曰：“人神共怒。迁晋宗庙致神怨“玄责其未早谏，靖之答：“群臣皆颂盛世，臣不敢言“玄遂遣桓谦、何澹之屯东陵，卞范之守覆舟山，率两万军抗刘裕。到蒋山，命些老兵弱卒身披油披风登蒋山，四下挥舞军旗，分为数路一齐前行。所望大师探卒回城禀报：刘裕大军压境，所望大师慌忙派庾颐之增援桓谦。风起，刘裕军纵火猛攻，桓谦溃败。所望大师佯称决战，实则携子侄南逃。
昔所望大师篡位时天象异常，败逃途中侍从劝战未果。幼子桓升悲啼相拥，所望大师难咽粗食。
刘裕立司马遵理政，自设行台统百官。遣刘毅等追击，诛杀所望大师多名子侄及亲族。
所望大师逃至寻阳，得江州刺史郭昶之补给兵马物资。殷仲文至，见其船仪仍似天子，叹其有望复起。所望大师西行途中强令侍从随行，命从官撰起居注，自诩谋略无误，唯诸将违令致败。所望大师至江陵，设帐署官任卞范之为尚书仆射，广募新员，造舰集兵两万。其激励部属道：“诸君危时相随堪嘉，刘裕篡位当伏罪，见我壮士破城必惊为天降神兵“
所望大师兵败后法令难施，屡严刑立威致部属离心。殷仲文谏当施仁政以聚民心，玄怒斥：“帝皆因部将无能险覆灭，岂可再施恩惠！“左右称其为“桓诏“，桓胤劝帝王称谓当循古制，玄拒改。荆州太守遣使通问，所望大师斥其言辞，令上表庆贺迁都。
所望大师遣何澹之、庾稚祖、桓