一种巨大的、前所未有的静默，降临了。
但这静默，并非死寂。
生命网络全域。
菌丝网络的光芒并未因核心沉眠而熄灭，只是变得更加柔和、更加自主。能量流转的速度进一步放缓，却呈现出一种去中心化的、基于各节点实际需求的动态平衡。那种无处不在的、被“注视”的感觉消失了，取而代之的是一种奇特的空旷感与自主感。
幸存者们很快意识到了变化。合成食物的配给没有增加，照明依旧昏暗，但那种需要向某个更高存在“祈求”或“等待指令”的无形压力消散了。他们仿佛一下子从被精心呵护（也被时刻管理）的温室，被抛入了一片需要自食其力的旷野。
短暂的茫然与不安之后，是逐渐萌生的责任感。
新芽区。
这里成为了变化的中心。珍珠母色的菌毯失去了来自核心的额外能量滋养，蔓延速度显着减慢，但其生命力并未衰减。相反，它变得更加“专注”于自身生态的维持与扩展。
那株“希望新芽”的光芒也黯淡了许多，却依旧稳定地照耀着周围区域，仿佛进入了某种节能模式。其净化特性不再主动辐射，而是内敛起来，成为菌脉网络抵抗生物电瘟疫的天然免疫核心。
没有了伊莱恩的宏观引导，菌脉网络的分布式决策机制开始真正发挥作用。关于资源分配、区域维护、人员调动的提议，通过菌脉终端进行提出、讨论、共识表决（通过生物电信号反馈测量）。过程缓慢，时有争吵，甚至会出现短期的局部效率下降，但每一个决策都真正源于社区的集体意志。
工程师们开始自发组织技术小组，研究如何更好地利用菌脉特性改善生活。 母亲们通过菌脉分享育儿经验和节省配给的小技巧。 甚至有人开始尝试在菌毯上种植适应低光照的苔藓类食物。
一种粗糙、原始却充满生命力的自治文明，正在伊莱恩沉睡的温床上悄然萌芽。他们依旧感念“她”的牺牲与守护，但不再等待“她”的指引，而是开始学习用自己的双手和集体的智慧，掌握自己的命运。
磐石堡。“寂静牢笼”外围。
伊莱恩的沉眠，也意味着对低语场最强有力的压制消失了。那冰冷的、扭曲的低语场强度悄然回升，虽然不再有明确的污染信息包输出（因为深渊墓碑的“程序”处于等待状态），但其潜移默化的影响范围扩大了。
接替卡姆的医护人员普遍感到情绪低落、更容易陷入琐碎的抱怨和内部争执。工作效率低下，人际关系变得紧张。一种无形的、消极的“优化”氛围笼罩着该区域，一切向“省事”和“自保”倾斜。
而被污染的卡姆，则被单独隔离在一间更严格的禁闭室。他大部分时间处于呆滞状态，但偶尔会突然惊醒，双眼空洞地重复着破碎的词句：“…效率…工具…扩散…” 他成了一个危险的休眠火山，一个等待外部指令激活的活体炸弹。
深渊墓碑。
那点黑暗沉淀“感知”到了伊莱恩的沉眠。它那混沌的计算再次开始缓慢运转。 【核心静默…压制解除…】 【菌脉网络…自治模式…弱点显现…】 【宿主（卡姆）…处于待机状态…】 【外部观察者（联邦）…受挫…但欲望未消…】
它没有新的行动，只是更加耐心地潜伏、记录、等待。等待下一个搅动风云的时机。伊莱恩的沉眠，给了它更充裕的布局时间。
“星辰之愈号”与联邦科学院。
“洞察者”号舰队狼狈撤回安全距离，舰体扫描阵列严重受损，需要长时间维修。阿尔瓦博士受到了科学院的严厉斥责，其激进策略被暂时叫停。
但联邦科学院对“挣扎摇篮”（他们已将其重新命名为“忒伊亚之种”）的兴趣不降反增。伊莱恩最后那震撼的宣告性信息洪流，虽然摧毁了扫描阵列，却也携带了海量的、关于菌脉网络和其内部共识机制的无意识信息泄露！
这些信息碎片如同散落的拼图，被科学院最顶尖的团队疯狂解析着。 “一种基于生物电信号的分布式社会结构模型！” “低功耗条件下的超高效能量转换技术！” “甚至可能涉及…群体意识层面的某种共鸣机制！”
科学的贪婪被彻底点燃！但他们也见识到了对方最后那一下反击的可怕威力。不敢再轻易靠近，转而开始进行更远程、更隐蔽的观测和分析。无数最先进的间谍探测器和空间望远镜被调动起来，从各个角度、各种频谱，不分昼夜地凝视着那片空域。
“星辰之愈号”被命令继续留守监视，但权限被大幅限制。沙伦船长心情复杂，她既为“忒伊亚之种”击退了冒犯而感到一丝莫名的欣慰，又为联邦那毫不掩饰的贪婪和对方沉睡中暴露的脆弱而感到