曾孙）在桂林叠彩山遇害。临刑前，他望着桂林城，吟诵道：“从容待死与城亡，千古忠臣自主张。三百年来恩泽久，头丝犹带满天香。”（《绝命诗》）意思是我从容地等待与城池一同灭亡，这是千古忠臣自己的选择；大明三百年的恩泽深厚，就算死了，头发里也带着满天香气。

    百姓们偷偷把他的遗体埋在仙鹤峰下，每年清明都有人去祭拜。后来，有人在他殉国的地方建了座“仰止堂”，取“高山仰止”之意。而那位跑惯了的永历帝，在桂林陷落后又开始了逃亡，一路跑到了云南，最后逃进了缅甸——他大概永远也不会明白，为什么瞿式耜宁愿死，也不肯像他那样跑。

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