帕木竹巴和格鲁派一事予以申斥，并且问罪于藏巴汗，在诏书中，朱载坖明确说道：“若诚能效顺向化，痛改前非，则朕犹视之如赤子。若犹执迷不悟，则天兵必痛加诛戮，兴灭之事，在卿一人，卿其深思之。朕卷甲整兵，以待卿也！”朱载坖的话已经是非常之明确了。