司卫所也都划归这些信地总兵们管理，卫所从军事编制变为了军事行政单位，负责军屯的管理，士卒的招募和退伍军官士卒的安置等事务，同时下辖一定数量的师团等官军用以守卫大明国土。他们的主要任务就是守土，有固定的辖区和相应的部队，也有明确的任务。