他见李林甫把持朝政，牛仙客营私舞弊，特别愤恨不平，当即写怜劾奏疏，托宦官交给李隆基。
这份奏章明面上弹劾牛仙客，暗面上怒斥李林甫，言辞异常激烈，并且引用了一段民间流传的预言：
首尾三麟六十年，
两角犊子自狂颠。
奸佞为臣在朝殿，
龙蛇相斗血成川。
预言长着两支犄角的牛犊子的要来了，就是姓牛的人要入朝祸乱李家江山了。皇帝不能识别忠奸，奸臣在朝堂冒充良臣作乱。
李隆基大怒，召周子谅入皇宫，下令在宫殿台阶上用棍杖抽打他。
周子谅被打得昏死过去又苏醒过来，李隆基又命令继续打。打得人半死了再流放瀼州(今广西上思县)。
周子谅棍伤满身，路途中又受到押送他的监吏打骂，不给饭吃，不让喝水，勉强走到蓝田，撑不住凉在地上死去。
李林甫又向李隆基构陷张九龄，对李隆基：
“张九龄举荐了周子谅这么个东西，这算是什么人才？
周子谅敢犯上作乱，可能就是张九龄指使着他做的。”
李隆基再贬张九龄为荆州长史。
张九龄老家广东曲江，文学才华出众，气质风雅，因为性情直率，朝廷容不下他。
他被贬为荆州长史后，仍能随遇而安，活得乐观豁达。
他晚年以醉心诗词文史，不谈朝政是非，六十八岁那年的某一，他躺在床上对家人：
“我要死了，你们准备后事吧”。
完闭上眼睛就死了。
李隆基信任李林甫，疏远排斥张九龄。
张九龄离开朝廷，李隆基还是常回忆起他来，每新选拔官员上来，总是问身边的人：
“这些人有张九龄的文雅君子风度么？”
后来安禄山叛乱，李隆基狼狈逃往四川，后悔当初不听张九龄的话。
他想起张九龄就难过得流泪，派人去广东曲江去祭奠张九龄的在之灵。
张九龄的弟弟张九皋，当官当到岭南节度使。 张九龄儿子张拯也入朝当了官。
李林甫排挤走了张九龄，他和驸马都尉杨洄，商量除掉太子李瑛。
杨洄见李隆基：
“太子李瑛、鄂王李瑶、光王李琚，和太子妃的哥哥驸马薛肃，暗暗谋划造反。”
李隆基查无实据，不再查问。杨洄很着急，找李林甫问：
“我了话皇帝都不信，接下来怎么办？
我撒谎要是被皇帝识破了，我就有麻烦了。”
李林甫给他传授秘密计谋，让他去转告武惠妃。
武惠妃得到计策大喜，派人对太子李瑛、鄂王李瑶、光王李琚：
“反贼混进皇宫，限制住了皇上行动自由，事情紧急，请你们快穿好铠甲，带上兵器，入宫保护皇上！”
李瑛、李瑶、李琚正在一起喝酒吃饭，已经喝得半醉，一听就急了，脑子里没有想到是奸计，一齐应声前往。
武惠妃急忙去见李隆基，：
“李瑛、李瑶、李琚三人谋反，身穿铠甲手拿兵器杀进皇宫来了！”
李隆基派宫中宦官出去查看情况。宦官回来报知李隆基：
“臣看见太子李瑛，鄂王李瑶、光王李琚，身披铠甲，正入宫而来。”
李隆基一听火冒三丈：
“这三个逆子还真反了！”
立命内侍召入李林甫商量怎么办。
李林甫：
“这是陛下的家事，臣不宜参加评论。”
就是，您皇上怎么处置自己的儿子，我都不会加以阻止。
李隆基立即让皇宫侍卫抓住关押他们，然后发布令：
废李瑛、李瑶、李琚为庶人，流放薛肃到瀼州。
随后，李隆基又传诏让三个儿子自尽。三个儿子喊冤，李隆基一概不信。
薛肃迎娶了李隆基女儿唐昌公主，同唐昌公主挥泪告别，他怀着痛苦心情走到蓝田，也由宫中使者传诏，令他上吊自杀。
李瑛、李瑶、李琚都好学有才毕，他们什么罪也没有被赐死，人们都认为他们死得冤。
李瑛舅家赵氏、太子妃家薛氏、李瑶舅家皇甫氏，被连坐判罪流放，共七十多人遭殃。
太子李瑛死了，武惠妃和李林甫商量立李瑁为太子。
李林甫劝李隆基立寿王李瑁为太子，李隆基拿不定主意。
李隆基不是特别昏聩的人，只是被武惠妃迷惑，凭着一时怒气冲，把三个儿子都赐死了。
父子骨肉亲情，事后反思，李隆基又心里懊悔。
这时武惠妃突然神经失常，看上去是疯了。
她整神志不清，满嘴胡言乱语。
武惠妃见了李隆基，怔怔地看着他，口中呓语道：
“你是皇帝陛下么？那你