学园都市里，拥有世界上最尖端的科技，比外界先进二三十年，是科学世界的领导者。
霓虹政府将东京西区开发较慢的区域一次全部收购后，建立起这座“学园都市，面积约东京都的三分之一。
这个“学校之城”包含了数十所大学与数百所小学、初中及高中，总共有一千个以上的大小“研究机构”
而这里所进行的研究可不是一般的课程……
超能力！
这座学园都市是一个以开发超能力为主题的学院城市。
在外界犹如都市传说一般的超能力，在这个城市随处可见。
可以说这里无论是电子科技还是生物科技都远远的超出外界的水准，这一切的荣耀，都来自于各个研究所里研究人员的不懈努力……
个！！
御坂美琴一开始天真的也是这样认为的……
直到她偶然接触到了那个计划……
绝对能力者计划！
御坂美琴脸色犹如黑炭一般的看着手里的报。
学园都市，这座城市建立的终极目标，是为了能够培养出：“system-成为宛如神明意旨一般降落凡尘的人”。
为了更进一步靠近神而需要创造出超越人类的存在——绝对能力level6，以超越人类的存在理解神明的意志。
关于这一点御坂美琴是知道的，毕竟她是这座城市最姐姐的lv5等级的能力者之一。
可以说也是有资格去成为lv6的。
但是……这种成为lv6的方法她可从没听说过啊！
绝对能力者计划：经过“树形图设计者”精密演算，学园都市中的七名超能力者中只有排名第一的一方通行有机会进化为绝对能力者。
但是需要二百五十多年的一般课程训练才能进化为绝对能力者。
因为没有能使人能够活二百五十年的方法，因此经过“树形图设计者”计算之后得到结论，那就是利用实战来促进能力的增长，即准备好特定的战场，让战斗依照计划进行以掌控“实战中能力增长”的方向。
根据“树形图设计者”的演算结果，只要准备好一百二十八种战场将超电磁炮杀害一百二十八次，一方通行便可以进化为绝对能力者。
但是因为并不存在一百二十八个超电磁炮，所以实验将目标锁定在御坂美琴的克隆体御坂妹妹的上。
由于御坂美琴的克隆体只有lv2的程度，所以战斗过程提升到了两万次。
简直是混蛋！扯淡！莫名其妙！御坂美琴双目都要喷出火焰来了。
这个世界上哪有这样的事，人生又不是打怪升级！积累经验就能进化！
这可是两万个生命啊！混蛋……
碰！御坂美琴的拳头狠狠的锤在桌子上。
“都是我的错……”
啪嗒……
御坂美琴的眼泪啪嗒啪嗒的掉落了下来。
若不是幼年的自己提供了dna，那些自己的克隆体就不会被杀掉……
9802次！
这是御坂美琴的资料上显示的实验次数，在研究所的内部已经展开过9802次的实验。
在室外也已经有了143次的实验也就是说……
到现在为止已经有9945名御坂妹妹死在了实验对象一方通行的手里！
怎么可以！
怎么可以！
御坂美琴无力的蹲坐在地上，双手抱着自己，眼泪啪嗒啪嗒的掉下，那都是活生生的生命啊……为什么他就下得去手！
想着自己偶然在街上看到的那个孩子……御坂美琴死死咬着自己的嘴唇……
入夜……
某个地下研究所……
御坂美琴头戴鸭舌帽，一严密的装扮混进了研究所。
lv5电击使的能力完全爆发，将研究所破坏的一干二净。
弱小无能……
御坂美琴第一次觉得自己这样的无能为力，一方通行的能力太无解了，她只能通过这样破坏研究所的方式来祈祷干预实验的进行。
她实在是没有胆量去面对那个魔王一般的存在。
但是……
不管她破坏多少研究所，绝对能力者的实验一直都没有停止的迹象。
而今天晚上，御坂美琴更是受到了来自暗部的狙击！
同是lv5级别的，原子崩坏，麦野沈利与她率领的暗部小队“道具”的攻击。
本来因为绝对能力者计划导致心神不宁的御坂美琴在交战的短时间里就落入了下风。
原子崩坏的能力单轮破坏力来说，远强于她的电磁力，但是因为泛用比不上电磁力与不容易控的缺点，所以麦野沈利才排名lv4。
轰！
御坂美琴，躲过麦野沈利的一道攻击之后，一不